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绵羊多胎性状候选基因群及其互作效应的研究

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绵羊多胎性状候选基因群及其互作效应的研究
论文目录
 
致谢第1-9页
摘要第9-11页
英文缩略词第11-12页
1 文献综述第12-28页
  · 我国主要多胎绵羊品种第12-14页
    · 湖羊第12页
    · 小尾寒羊第12-13页
    · 杜泊羊第13-14页
  · 绵羊繁殖力及其候选基因第14页
  · 绵羊多胎性状候选基因的遗传变异研究第14-25页
    · BMPR-1B基因第15页
    · BMP15基因第15-17页
    · BMP4基因第17页
    · GDF9基因第17-18页
    · ESR基因第18-19页
    · RBP4基因第19-20页
    · IGF基因第20页
    · PRL、PRLR基因第20-21页
    · PGR基因第21页
    · FSH-β 基因第21页
    · RXRG基因第21-22页
    · MTNR1A基因第22页
    · Lacaune基因-B4GALNT2第22-24页
    · ZAR1基因第24-25页
  · 影响绵羊繁殖力主效基因互作与基因聚合第25-27页
    · 主效基因互作第25页
    · 基因聚合第25-27页
      · 基因聚合的概念第26页
      · 动物多基因聚合研究进展第26-27页
  · 本研究总体目标第27-28页
2 引言第28-29页
3 试验一绵羊B4GALNT2和Zar1基因遗传变异分析第29-44页
  · 试验材料第29-31页
    · 试验动物及样品采集第29页
      · 所选试验动物第29页
      · 样品的采集第29页
    · 试验仪器设备第29-30页
    · 试验试剂第30页
    · 溶液配制第30页
    · 分析工具第30-31页
  · 试验方法第31-37页
    · 绵羊血液基因组DNA的提取与检测第31页
      · DNA样本的纯度与浓度检测第31页
      · DNA样本质量的定性检测第31页
    · DNA混合池的构建第31页
    · 引物设计第31-34页
      · 绵羊B4GALNT2基因筛选和鉴定第31-33页
      · 绵羊Zar1基因筛选和鉴定第33-34页
    · 引物稀释及注意事项第34-35页
      · 引物稀释第34页
      · 注意事项第34-35页
    · PCR扩增、检测及测序第35-36页
      · PCR扩增第35页
      · PCR产物琼脂糖凝胶电泳检测第35页
      · PCR产物纯化第35-36页
      · 测序筛选突变位点第36页
    · Sequenom Mass Array基因分型第36-37页
    · 体尺性状测量第37页
    · 统计分析第37页
      · 体型指数第37页
      · 变异位点与繁殖性状关联分析第37页
  · 结果与分析第37-41页
    · 血液DNA提取结果与分析第37-38页
    · 绵羊B4GALNT2基因变异位点的筛选第38-39页
      · 小尾寒羊和湖羊T28075A变异位点鉴定第38-39页
      · 绵羊B4GALNT2全基因组变异扫描分析第39页
    · 绵羊Zar1基因变异位点的筛选和鉴定第39-41页
      · Zar1基因变异位点的筛选第39页
      · Zar1基因变异位点的遗传变异分析第39-41页
  · 讨论与小结第41-44页
    · 基因多态性与筛选多态位点的方法第41页
      · 基因多态性第41页
      · 筛选多态位点的方法第41页
    · B4GALNT2基因遗传多态性第41-42页
    · Zar1基因遗传多态性分析第42-43页
      · Zar1基因群体遗传变异第42页
      · Zar1基因与绵羊生产性状关联分析第42-43页
    · 小结第43-44页
4 试验二17个候选基因中重要SNP对绵羊产羔数单基因效应分析第44-57页
  · 试验材料第44页
  · 试验内容和方法第44-48页
    · 候选基因和变异位点的选择第44-46页
    · 基因型分型方法第46页
      · BMPR-IB基因Fec B突变基因型PCR-RFLP分析第46页
      · 其它候选基因重要位点的Sequenom Mass Array基因分型第46页
    · 群体遗传学分析第46-48页
      · 各变异位点遗传多态性分析第46-48页
  · 结果与分析第48-54页
    · BMPR-IB基因Fec B突变基因分型第48页
      · PCR扩增第48页
      · AvaⅡ酶切及酶切产物电泳结果第48页
    · 各候选基因重要变异位点的群体遗传分析第48-52页
      · Fec B(A746G)位点遗传变异分析第49页
      · MTNR1A(G605A)位点遗传变异分析第49-50页
      · GDF9(G477A)位点遗传变异分析第50页
      · BMP4(C305A)位点遗传变异分析第50页
      · ESR(C363G)位点遗传变异分析第50-51页
      · IGF-1(G4988A)位点遗传变异分析第51页
      · PGR(C70T)位点遗传变异分析第51页
      · PRLR(G304A)位点遗传变异分析第51-52页
    · 各候选基因重要变异位点与产羔数的关联性分析第52-53页
      · 湖羊群体中重要SNP单独效应分析第52页
      · 小尾寒羊重要SNP单独效应分析第52-53页
    · 合并群体重要SNP单独效应分析第53-54页
  · 讨论与小结第54-57页
    · BMPR-IB与绵羊产羔数单基因效应分析第54页
    · 小尾寒羊MTNR1A(G605A)基因位点的多态性及其与产羔数关联性第54-55页
      · 小尾寒羊MTNR1A(G605A)基因位点的多态性第54页
      · 小尾寒羊MTNR1A(G605A)位点与产羔性状关联分析第54-55页
    · 湖羊GDF9(G477A)基因位点的多态性及其与产羔数的关联性第55页
      · 湖羊GDF9(G477A)基因位点的多态性第55页
      · 湖羊GDF9(G477A)位点与产羔性状关联性第55页
    · 合并群体重要SNP单基因效应分析第55页
    · 其它位点遗传变异分析第55-56页
    · 小结第56-57页
      · 对三个试验群体20个SNP位点分型结果第56页
      · 试验群体单基因效应分析第56-57页
5 试验三17个候选基因中重要SNP对绵羊产羔数的互作效应分析第57-64页
  · 材料与方法第57页
  · 试验数据统计分析第57-58页
    · 多基因互作效应分析模型第57页
    · 数据分析步骤第57-58页
  · 结果与分析第58-61页
    · 湖羊群体重要SNP互作效应分析第58-59页
      · GDF9(G477A)和ESR(C363G)基因互作效应第58-59页
      · Fec B(A746G)和ESR(C363G)基因互作效应第59页
    · 小尾寒羊群体重要SNP互作效应分析第59-60页
      · PGR(C70T)和MTNR1A(G605A)基因互作效应第59-60页
      · PGR(C70T)和PRLR(G304A)基因互作效应第60页
    · 合并群体重要SNP互作效应分析第60-61页
      · GDF9(G477A)和IGF-1(G49888A)基因互作效应第60-61页
  · 讨论与小结第61-64页
    · 多标记的遗传效应第61页
    · 湖羊群体重要SNP互作效应分析第61-62页
      · GDF9(G477A)和ESR(C363G)两个基因合并基因型的遗传效应第61-62页
      · Fec B(A746G)和ESR(C363G)两个基因合并基因型的遗传效应第62页
    · 小尾寒羊群体重要SNP互作效应分析第62页
    · 合并群体GDF9(G477A)和IGF-1(G49888A)基因合并基因型遗传效应第62页
    · 绵羊基因聚合育种的探讨第62-63页
      · 拟聚合基因的选择第63页
      · 基因的遗传效应第63页
      · 样本含量第63页
    · 小结第63-64页
6 试验四17个候选基因中重要SNP与母羊体重性状关联分析第64-69页
  · 试验材料第64页
  · 试验统计方法第64-65页
    · 产羔数与体重性状统计分析第64页
    · Pearson相关系数第64-65页
  · 结果与分析第65-67页
    · 试验群体基本体尺性状统计分析第65-66页
    · 重要SNP位点与绵羊产羔性状和体重关联分析第66-67页
      · 重要SNP与小尾寒羊产羔性状和体重关联分析第66-67页
      · 重要SNP与湖羊产羔性状和体重关联分析第67页
  · 讨论与小结第67-69页
    · 试验总群体基本体型性状统计分析第67-68页
    · 重要SNP与绵羊体重性状关联分析第68页
    · 小结第68-69页
7 全文结论及下一步工作计划第69-71页
  · 结论第69-70页
  · 下一步工作计划第70-71页
参考文献第71-80页
ABSTRACT第80-83页

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