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抗菌肽Piscidin1及其突变体的动力学研究与TTR抑制剂分子的药物设计
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抗菌肽Piscidin1及其突变体的动力学研究与TTR抑制剂分子的药物设计
论文目录
摘要
第1-6页
ABSTRACT
第6-15页
第一章 绪论
第15-23页
· 计算机辅助药物设计简介
第15-17页
· 生物体系与分子动力学
第17页
· 抗菌肽 Pis-1 及其突变体研究进展
第17-19页
· 抗菌肽研究进展
第17-18页
· 抗菌肽 Piscidin 1 研究进展
第18-19页
· TTR 及其抑制剂研究进展
第19-21页
· 论文的主要研究内容
第21-23页
第二章 计算理论及方法
第23-31页
· 分子动力学模拟
第23-26页
· 分子动力学简介
第23-24页
· 分子力场简介
第24-25页
· 主要计算方法
第25-26页
· 定量构效关系
第26-27页
· 定量构效关系简介
第26页
· 常用的 3D-QSAR 分析方法
第26-27页
· 药效团模型与数据库搜索
第27-28页
· 分子对接
第28-31页
· 分子对接简介
第28-29页
· 分子对接软件简介
第29-31页
第三章 抗菌肽 Pis-1 及其突变体的动力学模拟
第31-49页
· 本课题的研究意义
第31页
· 研究涉及的主要软件
第31-32页
· AMBER 软件包简介
第31-32页
· Python 语言简介
第32页
· 动力学模拟方案
第32-35页
· “抗菌肽-膜”模型的建立与模拟
第32-34页
· “抗菌肽-水”模型的建立与模拟
第34页
· 模拟结果的分析方法
第34-35页
· MD 模拟的结果与讨论
第35-46页
· Pis-1 及其突变体的结构分析
第35-36页
· Piscidin1 及其突变体的 RMSD 分析
第36-40页
· 自然接触分数分析
第40页
· 模拟过程中二级结构的变化
第40-44页
· 分子内氢键的分布
第44-46页
· 与实验结果相比较
第46页
· 本章小结
第46-49页
第四章 TTR 抑制剂的理论研究
第49-67页
· 本课题的研究意义
第49页
· 研究涉及的主要软件
第49-50页
· Gaussian 软件包简介
第49页
· SYBYL 软件包简介
第49-50页
· ABX 系列抑制剂的 3D-QSAR 研究
第50-56页
· 3D-QSAR 研究方案
第50-51页
· 结果与讨论
第51-56页
· ABX 系列抑制剂分子的药效团模研究
第56-59页
· 药效团模型研究方案
第56-59页
· 结果与讨论
第59页
· ABX 系列抑制剂分子的对接研究
第59-63页
· 分子对接研究方案
第59-60页
· 结果与讨论
第60-63页
· 抑制剂分子连接区域的研究
第63-64页
· 数据库搜索与筛选
第64-65页
· 本章小结
第65-67页
第五章 结论
第67-69页
· 取得的成果
第67页
· 研究的创新之处
第67-68页
· 今后研究的展望
第68-69页
参考文献
第69-77页
附录
第77-81页
致谢
第81-83页
研究成果及发表的学术论文
第83-85页
作者简介
第85页
导师简介
第85-86页
附件
第86-87页
本篇论文共
87
页,
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