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蛋白质结构预测的多agent模拟退火算法研究

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蛋白质结构预测的多agent模拟退火算法研究
论文目录
 
摘要第1-9页
Abstract第9-11页
· 引言第11-20页
  · 课题背景及研究意义第11-13页
  · 国内外研究现状第13-18页
  · 本文工作概述第18-19页
  · 本文结构安排第19-20页
· 蛋白质结构预测问题及其应用第20-33页
  · 蛋白质结构的实验测定方法第20-22页
    · X 射线法测定蛋白质的晶体结构第21页
    · 核磁共振法测定蛋白质的溶液结构第21-22页
    · 其他实验测定方法第22页
  · 蛋白质结构的理论预测方法第22-27页
    · 蛋白质的二级结构预测第23-24页
    · 蛋白质的三级结构预测第24-27页
  · 蛋白质结构预测的模型第27-29页
  · 蛋白质结构预测的应用第29-31页
    · 在结构基因组学中的应用第29-30页
    · 在蛋白质设计中的应用第30-31页
    · 在药物设计中的应用第31页
  · 小结第31-33页
· 多 agent 模拟退火算法第33-49页
  · 预备知识第34-38页
    · 模拟退火算法(SA)第34-35页
    · 粒子群优化算法(PSO)第35-38页
  · 基于粒子群优化算法(PSO)的多 agent 模拟退火算法(MSA)第38-39页
  · 多 agent 模拟退火算法(MSA)仿真结果第39-48页
    · 实验方法第39-42页
    · 对于指定迭代目标的实验结果第42-44页
    · 对于固定迭代次数的实验结果第44-46页
    · 对于固定迭代次数的迭代过程第46-48页
  · 小结第48-49页
· 多 agent 模拟退火算法(MSA)在蛋白质结构预测中的应用第49-60页
  · 对人工蛋白质序列的计算机仿真模拟实验及结果分析第49-54页
    · 仿真实验相关参数设定第49-50页
    · 人工蛋白质序列仿真实验结果第50-53页
      · 序列长度 3-5 的短 Fibonacci 测试序列的仿真实验结果第50-51页
      · 序列长度为 6 的两条 Fibonacci 测试序列的仿真实验结果第51-52页
      · 序列长度 13-55 的长 Fibonacci 测试序列的仿真实验结果第52-53页
    · 结果分析第53-54页
  · 算法在真实蛋白质结构预测中的结果第54-59页
    · 仿真实验的相关参数设定第54页
    · 仿真实验结果一:较短真实蛋白质序列第54-56页
    · 仿真实验结果二:较长真实蛋白质序列第56-58页
    · 1AGT 序列更正后的结果第58页
    · 结果分析第58-59页
  · 小结第59-60页
· 总结与展望第60-63页
  · 论文工作总结第60-61页
  · 研究与展望第61-63页
参考文献第63-70页
附录第70-71页
致谢第71页

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