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养殖对虾肠道微生物区系的特征与功能

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养殖对虾肠道微生物区系的特征与功能
论文目录
 
摘要第1-7页
ABSTRACT第7-14页
引言第14-18页
  1 微生物在水产养殖中的生物学功能及其应用第14-16页
    · 海洋微生物的生物学功能第14-15页
      · 微生物的定义第14页
      · 海洋微生物的作用第14-15页
    · 微生物在水产养殖中的应用第15-16页
      · 微生物在水产养殖中的应用现状第15页
      · 有益微生物在对虾养殖中的应用现状第15-16页
  参考文献第16-18页
第一章 养殖对虾肠道优势菌种的筛选及鉴定第18-22页
  1 材料与方法第18-19页
    · 健康养殖凡纳滨对虾第18页
    · 培养基第18页
    · 肠道样品的制备第18-19页
    · 细菌的 16SrDNA 鉴定第19页
  2 结果第19-20页
  3 讨论第20页
  参考文献第20-22页
第二章 应用 PCR-RFLP 和 PCR-DGGE 分析工厂化养殖对虾肠道微生物群落特征第22-33页
  1 材料与方法第23-25页
    · 材料第23-24页
      · 凡纳滨对虾肠道样品第23页
      · 试剂第23页
      · 引物设计第23-24页
    · 凡纳滨对虾肠道总 DNA 提取第24页
    · 16S rDNA 基因的 PCR 扩增第24页
    · 16S rDNA 克隆文库构建和 RFLP 分析第24-25页
    · 16S rDNAV3 区的 PCR 扩增第25页
    · DGGE 图谱条带分析第25页
    · DGGE 条带回收和序列分析第25页
  2 结果第25-29页
    · RFLP 结果分析第25-27页
    · DGGE 结果分析第27-29页
  3 讨论第29-30页
  参考文献第30-33页
第三章 哈氏弧菌拮抗菌的筛选与效果第33-40页
  1 材料与方法第33-35页
    · 细菌的分离与培养第33页
    · 拮抗菌的筛选第33-34页
    · 溶血素的产生第34页
    · 16S rDNA 鉴定第34页
    · 菌种发酵培养第34页
    · 饲料制备第34页
    · 实验分组第34-35页
    · 哈氏弧菌感染实验第35页
      · 哈氏弧菌菌悬液的制备第35页
      · 预感染实验第35页
      · 注射感染实验第35页
  2 结果第35-37页
    · 拮抗菌的实验结果第35-36页
    · 16S rDNA 鉴定和系统发育树第36-37页
    · 哈氏弧菌感染结果第37页
  3 讨论第37-39页
  参考文献第39-40页
第四章 3 株海水芽孢菌的鉴定与生物学特性分析第40-48页
  1 材料与方法第40-41页
    · 菌株来源及分离第40页
    · 菌株鉴定第40-41页
      · 革兰氏染色及形态学观察第40页
      · 菌株的生长特性第40-41页
      · 菌株 16S rDNA 序列分析第41页
      · 利用 Biolog 微生物自动分析仪系统鉴定菌株第41页
  2 结果第41-46页
    · 菌体形态特征第41-42页
    · 菌株的生长曲线第42-43页
    · 菌株 16S rDNA 序列分析与系统发育树第43-45页
    · 菌株 Biolog 碳源利用鉴定第45-46页
  3 讨论第46页
  参考文献第46-48页
第五章 3 株共生芽孢杆菌对凡纳滨对虾抗 WSSV 感染力的影响第48-53页
  1第48-50页
    · 材料与方法第48-49页
      · 对虾第48-49页
      · 菌种的来源及发酵培养第49页
    · 饲料制备第49页
    · 实验分组第49页
    · WSSV 感染实验第49-50页
      · WSSV 粗提液制备第49-50页
      · 注射感染实验第50页
    · 数据分析第50页
  2 结果第50-51页
    · 凡纳滨对虾抗 WSSV 病毒感染力及累积死亡率结果第50-51页
  3 讨论第51页
  参考文献第51-53页
第六章 饲料中添加益生菌对凡纳滨对虾肠道相关基因分子表达水平的影响第53-62页
  1 材料与方法第54-56页
    · 实验材料同第五章 ·第54页
    · 实验方法同第五章 ·第54页
    · WSSV 感染实验同第五章.·第54页
    · 样品采集与处理第54页
      · 感染期间的样品采集与处理第54页
      · 免疫期间的样品采集与处理第54页
    · RNA 提取第54页
    · cDNA 合成第54-55页
    · 实时荧光定量 PCR 分析基因表达第55页
      · 引物第55页
      · 实时荧光定量 PCR 反应体系和程序第55页
      · 溶解曲线测定第55页
    · 统计分析第55-56页
  2 结果第56-59页
    · cDNA 浓度测定第56页
    · 包裹饲料免疫期间和感染 WSSV 后对虾肠道中凋亡基因 caspase 和免疫相关基因 trx 表达量的检测第56-59页
      · 投喂包裹益生菌饲料感染期间对凡纳滨对虾肠道中凋亡基因 caspase表达量的影响第56-57页
      · 投喂包裹益生菌饲料感染期间对凡纳滨对虾肠道中免疫相关基因trx表达量的影响第57-58页
      · 投喂包裹益生菌饲料对凡纳滨对虾肠道中凋亡基因 caspase表达量的影响第58页
      · 投喂包裹益生菌饲料对凡纳滨对虾肠道中免疫相关基因trx表达量的影响第58-59页
  3 讨论第59-60页
  参考文献第60-62页
第七章 饲料中添加益生菌对凡纳滨对虾感染 WSSV 病毒增殖速率的影响第62-67页
  1 材料与方法第62-63页
    同第五章 ·第62页
    同第五章 ·第62页
    同第五章 ·第62页
    同第五章 ·第62页
    · 样品采集和处理第62-63页
    · 鳃组织 DNA 提取和浓度测定第63页
      · 鳃组织的提取第63页
      · 测定鳃组织基因组 DNA 浓度第63页
    · 病毒定量检测第63页
      · 标准品的制备第63页
      · WSSV 绝对定量第63页
  2 结果第63-65页
    · 鳃组织 DNA 浓度第63-64页
    · 对虾感染 WSSV 相对保护率第64页
    · WSSV 实时荧光定量 PCR第64-65页
  3 讨论第65页
  参考文献第65-67页
附录 使用试剂的配制第67-70页
致谢第70-71 页

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