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M.xanthus DK1622基因组序列分析及新型随机兼并引物数据库的构建
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M.xanthus DK1622基因组序列分析及新型随机兼并引物数据库的构建
论文目录
 
摘要第1-8 页
ABSTRACT第8-10 页
第一章 微生物基因组序列分析第10-39 页
　　1 绪论第10-24 页
　　　　· 基因组学与生物信息学第10-11 页
　　　　· 数据管理—常见的生物学数据库第11-17 页
　　　　　　· 核酸序列数据库第11-12 页
　　　　　　· 蛋白质数据库第12-15 页
　　　　　　　　· 蛋白质序列数据库第12-13 页
　　　　　　　　· 以蛋白质序列数据库为基础的二级数据库第13-14 页
　　　　　　　　· 生物大分子空间结构数据库第14 页
　　　　　　　　· 蛋白质分类数据库第14-15 页
　　　　　　· 基因组数据库第15-17 页
　　　　· 数据分析—微生物基因组序列分析第17-24 页
　　　　　　· 单个基因组序列分析第17-21 页
　　　　　　　　· 基因组序列注释第17-18 页
　　　　　　　　· 碱基组分分析第18-19 页
　　　　　　　　· 密码子偏好性分析第19-21 页
　　　　　　· 比较基因组研究第21-24 页
　　　　　　　　· 基因组特征比较第21-22 页
　　　　　　　　· 分子系统发生分析第22-24 页
　　2 Myxococcus xanthus DK1622的基因组序列分析第24-39 页
　　　　· 立题依据第24 页
　　　　· M.xanthus DK1622基因组的注释第24-27 页
　　　　· M.xanthus DK1622基因组的碱基组分分析第27-30 页
　　　　· M.xanthus DK1622基因组的密码子偏好性分析第30-35 页
　　　　· 比较基因组学的一种新方法的尝试第35-39 页
第二章 新型随机兼并(AD)引物数据库的构建第39-56 页
　　1 简介第39-42 页
　　　　· TAAIL PCR简介第39-40 页
　　　　· 现有的 AD引物第40-42 页
　　　　· 立题依据及总体思路第42 页
　　2 新型 AD引物设计思路第42-46 页
　　　　· 总体思路第42-44 页
　　　　　　· 目标和方法第42-43 页
　　　　　　· 限制条件第43 页
　　　　　　· 总体模型第43-44 页
　　　　· AD引物设计细节第44-46 页
　　　　　　· AD引物的长度第44 页
　　　　　　· AD引物的组装形式第44-45 页
　　　　　　· 细化的模型第45-46 页
　　3 ADDB的实现第46-54 页
　　　　· AD引物生成过程第46-49 页
　　　　　　· 统计出现频率第46 页
　　　　　　· GC数的分配第46-48 页
　　　　　　· 挑选3’端5bp片段第48 页
　　　　　　· 根据3’-5挑选相应的mid-5和5'-4第48-49 页
　　　　　　· 组装和批处理第49 页
　　　　· ADDB的构建第49-54 页
　　　　　　· 服务器及数据库的架构第49-53 页
　　　　　　　　· 服务器的构架第49-51 页
　　　　　　　　· JSP连接mysql数据库第51-52 页
　　　　　　　　· 数据交互和搜索结果分页显示第52-53 页
　　　　　　· 用户界面第53-54 页
　　4 结果与讨论第54-56 页
参考文献第56-59 页
致谢第59-60 页
学位论文评阅及答辩情况表第60 页

本篇论文共60页，点击这进入下载页面。
 
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