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DNA分子中碱基甲基化及羟基化损伤的理论研究

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DNA分子中碱基甲基化及羟基化损伤的理论研究
论文目录
 
摘要第1-5 页
Abstract第5-10 页
第一章 综述第10-24 页
  第一部分 DNA 甲基化的研究概况第10-17 页
    1 引言第10 页
    2 DNA 甲基化的分子生物学研究第10-13 页
      · DNA 甲基化第10-11 页
      · DNA 甲基化水平与相关疾病的研究第11-13 页
        · 甲基化诱发疾病第11 页
        · 甲基化致癌性质的基因学研究第11-12 页
        · DNA 高甲基化的致癌性第12-13 页
        · DNA 低甲基化的致癌性第13 页
    3 DNA 甲基化的药物研究第13 页
    4 DNA 甲基化的反应方式第13 页
    5 DNA 甲基化反应的量子化学研究概述第13-15 页
      · 甲基基团对DNA 结构影响的量子化学研究第13-14 页
      · 甲基对碱基对影响的研究第14-15 页
      · 5-甲基胞嘧啶的量子化学研究第15 页
    参考文献第15-17 页
  第二部分 DNA 羟基化综述第17-24 页
    引言第17 页
    1 自由基的种类和产生第17-18 页
    2 羟基自由基与碱基、核苷、核酸的反应产物及其反应机理第18 页
    3 羟基自由基对DNA 碱基的损伤第18-20 页
      · 羟基自由基对嘌呤的损伤第18-20 页
      · 羟基自由基对嘧啶碱基的损伤第20 页
    4 有关羟基加合物的研究第20-22 页
      · 羟基加合物的实验研究第20-21 页
      · 羟基加合物的量子化学研究第21-22 页
    参考文献第22-24 页
第二章 基本理论简介第24-29 页
  1 从头算方法简介第24-26 页
    · 量子化学计算中的Schr?dinger 方程第24 页
    · 从头算的三个近似和Pauli 原理第24-26 页
      · 从头算的三个近似第24-25 页
      · Pauli 原理第25-26 页
  2 分子的自洽场计算中的几个问题第26 页
  3 B3LYP 方法第26-27 页
  4 DZP++基组第27 页
  参考文献第27-29 页
第三章 O~6-MedG·dC 的电子结构和性质的理论研究第29-44 页
  · 引言第29 页
  · 计算模型与方法、计算细节第29-31 页
    · 计算模型与方法第29-30 页
    · 计算细节第30-31 页
  · 结果与讨论第31-42 页
    · O~6-MedG·dC 构象的优化结果第31-33 页
    · O~6-MedG·dC 构象的共面性第33-37 页
      · O~6-MedG·dC 的键长和键角第34-35 页
      · 鸟嘌呤碱基单体和甲基化且质子化的鸟嘌呤碱基单体的键长比较第35-36 页
      · dG·dC 碱基对和质子化O~6-MedG·dC 碱基对的平面构象中鸟嘌呤分子的键长第36-37 页
    · 甲基化dG·dC 碱基对的反应趋势第37-38 页
      · dG·dC 碱基对和甲基化的O~6-MedG·dC 碱基对的碱基配对趋势第37-38 页
      · dG·dC 和鸟嘌呤质子化的O~6-MedG·dC 的碱基配对趋势分析第38 页
      · dG·dC 碱基对和甲基化的鸟嘌呤质子化的胞嘧啶碱基对dG·dC 的碱基配对趋势第38 页
    · O~6-MedG·dC 的NBO 电荷分析第38-39 页
    · 分子轨道及其能级第39-42 页
  · 结论第42 页
  参考文献第42-44 页
第四章 羟基胸腺嘧啶脱氧核苷酸加合物的结构和性质的量子化学研究第44-58 页
  · 引言第44 页
  · 计算模型与方法、计算细节第44-45 页
  · 结果和讨论第45-55 页
    · (5'-dTMP 酸+·OH)加合物的几何优化结构第45-48 页
    · (5'-dTMP 酸+ ·OH)加合物的键长和键角第48-50 页
      · C2-OH-dTMP 和C2-OH-dTMP'的键长和键角第48 页
      · 加合物 C4-OH-dTMP 、C4-OH-dTMP'、C5-OH-dTMP 、C5-OH-dTMP'、C6-OH-dTMP 、C6-OH-dTMP' 的分子结构第48-50 页
    · (5'-dTMP 酸+·OH)加合物的分子轨道第50-52 页
    · (5'-dTMP 酸+·OH)加合物的稳定性第52-53 页
    · (5'-dTMP 酸+·OH)加合物的NBO 电荷分布第53-54 页
    · (5'-dTMP 酸+·OH)加合物的自旋密度分析第54-55 页
  · 结论第55-56 页
  参考文献第56-58 页
致谢第58-59页

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