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猪骨骼肌/肝脏特异性表达基因MyoG/α1-AT启动子的功能分析及应用

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猪骨骼肌/肝脏特异性表达基因MyoG/α1-AT启动子的功能分析及应用
论文目录
 
摘要第11-12页
ABSTRACT第12-14页
缩略词表第14-15页
第一章 文献综述第15-27页
1 引言第15页
2 启动子简介第15-22页
  2.1 启动子的结构第15-17页
  2.2 启动子的研究方法第17-20页
    2.2.1 基于生物信息学的启动子分析第17-18页
    2.2.2 启动子克隆方法第18-19页
    2.2.3 研究启动子功能的实验方法第19-20页
  2.3 启动子的应用第20-22页
    2.3.1 应用于转基因动物第20页
    2.3.2 应用于RNA干扰第20-21页
    2.3.3 临床治疗中的应用第21-22页
3 MyoG/α1-AT启动子及CKM增强子研究进展第22-23页
  3.1 MyoG启动子研究进展第22页
  3.2 α1-AT启动子研究进展第22-23页
  3.3 CKM增强子研究现状第23页
4 PPARγ的概述第23-24页
5 BGL1研究现状第24-25页
6 研究目的和意义第25-27页
第二章 材料与方法第27-51页
1 试验材料第27-29页
  1.1 DNA样品第27页
  1.2 载体和菌株第27页
  1.3 试剂及其配置第27-28页
    1.3.1 主要试剂第27-28页
    1.3.2 试剂的配置第28页
  1.4 主要数据库及分析软件第28-29页
2 试验方法第29-51页
  2.1 猪MyoG基因启动子的克隆及重组表达质粒的构建第29-34页
    2.1.1 猪基因组提取DNA及质量鉴定第29页
    2.1.2 猪MyoG调控序列的获得第29-30页
    2.1.3 PCR扩增产物的检测和回收第30页
      2.1.3.1 PCR产物的检测第30页
      2.1.3.2 PCR产物的回收及纯化第30页
    2.1.4 克隆载体的构建及酶切回收第30-32页
      2.1.4.1 PCR产物连接pMD18-T第30-31页
      2.1.4.2 重组质粒转化第31页
      2.1.4.3 阳性克隆的检测及测序第31页
      2.1.4.4 连接pMD18-T质粒小量提取第31-32页
    2.1.5 pGL3-MyoG重组表达质粒的构建第32-34页
      2.1.5.1 pMD18-T及pGL3-Basic载体双酶切及回收第32-33页
      2.1.5.2 pGL3-Basic重组表达质粒的构建第33页
      2.1.5.3 重组质粒的去内毒素小量提取及双酶切鉴定第33-34页
  2.2 细胞培养及诱导分化第34-35页
    2.2.1 细胞的复苏第34页
    2.2.2 细胞的常规培养第34-35页
    2.2.3 细胞冻存第35页
    2.2.4 C2C12细胞的诱导分化第35页
  2.3 细胞转染及双荧光素酶活性的测定第35-37页
    2.3.1 细胞的转染第35-36页
    2.3.2 双荧光素酶相对活性的检测第36页
      2.3.2.1 细胞裂解第36页
      2.3.2.2 双荧光素酶活性的检测及计算第36页
    2.3.3 数据的处理及分析第36-37页
  2.4 真核表达载体以及MyoG突变载体构建第37-38页
    2.4.1 转录因子MyoD真核表达质粒的鉴定第37页
    2.4.2 pcDNA3.1-EGFP真核表达质粒的构建第37页
    2.4.3 MyoG突变载体的构建第37-38页
  2.5 EMSA验证MyoD结合位点的存在第38-41页
    2.5.1 制备探针第38页
    2.5.2 核蛋白提取第38-39页
    2.5.3 凝胶迁移试验第39-41页
  2.6 MyoG启动子与PPARy重组质粒的构建第41-42页
    2.6.1 猪PPARγ基因CDS区域的克隆第41页
    2.6.2 PPARγ与pGL3-MyoG重组质粒的鉴定第41-42页
  2.7 PPARγ基因在C2C12细胞中表达量的测定第42-46页
    2.7.1 小鼠C2C12细胞RNA的提取及反转录第42-43页
    2.7.2 定量PCR分析PPARγ在C2C12细胞中的表达量第43-44页
    2.7.3 C2C12细胞蛋白质的提取第44页
    2.7.4 Western Blot检测目的蛋白质的表达量第44-46页
      2.7.4.1 SDS-PAGE电泳第44-45页
      2.7.4.2 转膜第45页
      2.7.4.3 抗原抗体免疫反应第45-46页
  2.8 肌肉特异性表达外源基因转基因小鼠的制备与鉴定第46页
    2.8.1 转基因小鼠的制备第46页
    2.8.2 阳性鼠的PCR鉴定第46页
  2.9 嵌合启动子构建第46-47页
    2.9.1 猪CKM增强子的获得第46-47页
    2.9.1 猪Enhancer-Promoter嵌合启动子的构建第47页
  2.10 猪α1-AT基因启动子的克隆及重组表达质粒的构建第47-48页
    2.10.1 猪α1-AT调控序列的获得第47-48页
    2.10.2 pGL3-Basic重组表达质粒的构建第48页
  2.11 α1-AT启动子与BGL1重组质粒的构建第48-49页
    2.11.1 α1-AT基因信号肽的克隆第48-49页
    2.11.2 BGL1基因CDS区域的克隆第49页
    2.11.3 pGL3-AT-Signal-BGL1重组质粒的构建第49页
  2.12 BGL1基因在Hepa1-6细胞中表达量的测定第49-51页
    2.12.1 定量PCR分析BGL1在Hepa1-6细胞中的表达量第49-50页
    2.12.2 Western Blot检测BGL1蛋白质的表达量第50-51页
第三章 结果与分析第51-72页
第一部分第51-67页
1 猪MyoG调控序列功能分析第51-59页
  1.1 猪MyoG调控区域的生物信息学分析第51-53页
    1.1.1 猪MyoG调控区域的结构预测第51-53页
  1.2 猪MyoG启动子克隆及重组质粒的构建第53-54页
  1.3 C2C12细胞的诱导分化第54页
  1.4 pGL3-MyoG-Basic质粒的双荧光素酶活性检测第54-56页
  1.5 转录因子MyoD对MyoG启动子的调控作用第56-59页
    1.5.1 转录因子MyoD真核表达载体与启动子片段共转染第56-57页
    1.5.2 转录因子MyoD真核表达载体与MyoG突变载体共转染第57-58页
    1.5.3 EMSA验证MyoD结合位点的存在第58-59页
2 PPARγ表达载体的构建及其表达量测定第59-64页
  2.1 PPARγ表达载体的构建第59-60页
  2.2 QPCR检测PPARγ在C2C12细胞中的表达量第60-62页
  2.3 Western Blot检测PPARγ蛋白质在C2C12细胞中的表达量第62-63页
  2.4 转基因小鼠的获得第63-64页
    2.4.1 转基因小鼠PCR检测第64页
3 猪CKM增强子活性的验证第64-67页
  3.1 含有Enhancer-Promoter载体的构建第64-67页
第二部分第67-72页
1 猪α1-AT基因调控序列功能分析第67-69页
  1.1 猪α1-AT调控区域的生物信息学分析第67-68页
  1.2 猪α1-AT启动子克隆及缺失重组质粒的构建第68-69页
  1.3 α1-AT缺失重组质粒的双荧光素酶活性检测第69页
2 BGL1基因表达载体的构建及其表达量测定第69-72页
  2.1 BGL1表达载体的构建第69-70页
  2.2 QPCR检测BGL1在Hepa1-6细胞中的表达量第70-71页
  2.3 Western Blot检测蛋白质BGL1在Hepa1-6细胞中的表达量第71-72页
第四章 讨论第72-79页
1 启动子的组织特异性研究第72-73页
2 启动子分析第73-75页
  2.1 猪MyoG启动子的活性分析第73-74页
  2.2 转录因子MyoD对启动子活性的影响第74-75页
  2.3 α1-AT启动子的活性分析第75页
3 猪CKM增强子功能分析第75-76页
4 异位表达PPARγ对骨骼肌的影响第76-77页
5 肝脏特异性表达BGL1基因的意义第77-79页
第五章 小结第79-81页
1 本研究取得的成果第79-80页
2 下一步工作计划第80-81页
参考文献第81-89页
致谢第89页

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