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菊属、亚菊属叶绿体DNA的基因组结构与进化分析
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菊属、亚菊属叶绿体DNA的基因组结构与进化分析
论文目录
摘要
第1-7页
ABSTRACT
第7-9页
引言
第9-11页
第一章 文献综述
第11-21页
1 叶绿体基因组研究进展
第11-19页
1.1 叶绿体基因组的研究概括
第11-12页
1.2 叶绿体基因组的结构与功能特征
第12-13页
1.3 叶绿体基因组在系统发育分析中的应用
第13-14页
1.4 叶绿体基因与核基因互作
第14-17页
1.5 叶绿体全基因组测序技术研究发展
第17-19页
1.5.1 传统的DNA测序技术—Sanger测序法
第17-18页
1.5.2 基于二代测序(Illumina平台)的叶绿体基因组测序
第18页
1.5.3 第三代单分子实时测序技术
第18-19页
2 菊科系统分类及菊属与亚菊属的研究现状
第19-20页
3 本研究的目的及意义
第20-21页
第二章 菊属、亚菊属叶绿体DNA提取
第21-29页
1 材料与方法
第22-24页
1.1 植物材料
第22页
1.2 试剂与仪器
第22-23页
1.2.1 叶绿体提取所用的溶液配方
第22页
1.2.2 试剂盒提取叶绿体DNA所用的试剂
第22-23页
1.2.3 仪器与设备
第23页
1.3 提取方法
第23-24页
1.3.1 试剂盒法
第23页
1.3.2 改良试剂盒法
第23页
1.3.3 常规叶绿体DNA提取法
第23-24页
1.4 叶绿体DNA质量检测
第24页
2 结果与分析
第24-26页
2.1 叶绿体DNA质量检测结果
第24-26页
3 讨论
第26-29页
第三章 菊属、亚菊属叶绿体基因组结构分析
第29-51页
1 材料与方法
第30-31页
1.1 植物材料
第30页
1.2 叶绿体DNA测序
第30页
1.3 叶绿体基因组基因注释方法
第30-31页
1.4 叶绿体基因组基因比较方法
第31页
2 结果与分析
第31-49页
2.1 菊属、亚菊属叶绿体基因组基本特征
第31-38页
2.1.1 叶绿体基因组结构组成
第31-33页
2.1.2 AT含量比较
第33-35页
2.1.3 叶绿体基因组序列组成
第35-36页
2.1.4 叶绿体基因组中基因信息
第36-38页
2.2 菊属、亚菊属IR区边界比较分析
第38-43页
2.3 菊属、亚菊属重复序列和SSR分析
第43-48页
2.4 菊属、亚菊属叶绿体基因组全序列比对
第48-49页
3 讨论
第49-51页
第四章 菊属、亚菊属叶绿体基因组的系统进化分析
第51-57页
1 材料与方法
第52页
1.1 材料
第52页
1.2 叶绿体基因组系统进化树的构建方法
第52页
2 结果与分析
第52-54页
3 讨论
第54-57页
全文结论
第57-59页
创新之处
第59-61页
参考文献
第61-67页
附录
第67-81页
致谢
第81-82页
本篇论文共
82
页,
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