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海洋胶红酵母菌株Rhodotorula mucilaginosa CTD02的冷适应性机制研究

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海洋胶红酵母菌株Rhodotorula mucilaginosa CTD02的冷适应性机制研究
论文目录
 
摘要第1-7页
Abstract第7-8页
第1章 前言第13-24页
    1.1 深海环境第13-14页
    1.2 海洋酵母第14-16页
        1.2.1 红酵母第14-16页
            1.2.1.1 胶红酵母第15-16页
    1.3 低温微生物的冷适应性机制第16-19页
        1.3.1 细胞膜与低温适应性第16-17页
        1.3.2 低温酶与低温适应性第17-18页
        1.3.3 冷适应蛋白、冷激蛋白与低温适应性第18-19页
        1.3.4 其他适应机制第19页
    1.4 转录组学研究与应用第19-20页
    1.5 基因沉默研究与应用第20-21页
    1.6 研究方法及目的第21-22页
    1.7 技术路线第22-24页
第2章 菌株CTD02 不同温度条件下生长特性研究第24-45页
    2.1 引言第24页
    2.2 实验材料与方法第24-33页
        2.2.1 实验菌株第24页
        2.2.2 主要试剂第24-25页
        2.2.3 主要仪器第25-26页
        2.2.4 引物第26页
        2.2.5 实验方法第26-33页
            2.2.5.1 真菌分离第26-27页
            2.2.5.2 真菌DNA提取与扩增第27-29页
            2.2.5.3 ITS序列进化分析第29-30页
            2.2.5.4 CTD02 菌株细胞形态和培养特征第30页
            2.2.5.5 CTD02 菌株的分子鉴定第30页
            2.2.5.6 CTD02 菌株不同温度下生长特性研究第30-31页
            2.2.5.7 不同温度下CTD02 菌株不饱和脂肪酸含量与成分分析第31-33页
    2.3 实验结果第33-42页
        2.3.1 样品分离结果第33-35页
        2.3.2 CTD02 菌株的形态学特征第35-37页
            2.3.2.1 菌落特征第35页
            2.3.2.2 细胞形态第35-36页
            2.3.2.3 生理生化特征测定结果第36-37页
        2.3.3 菌株的分子鉴定结果第37页
        2.3.4 不同温度下CTD02 菌株的生长曲线第37-38页
        2.3.5 不同温度下CTD02 菌株的细胞形态第38-40页
        2.3.6 不同温度下CTD02 菌株不饱和脂肪酸含量与成分分析第40-42页
    2.4 分析与讨论第42-43页
    2.5 总结与展望第43-45页
        2.5.1 总结第43-44页
        2.5.2 展望第44-45页
第3章 菌株CTD02 全基因组测序与分析第45-58页
    3.1 引言第45页
    3.2 实验材料与方法第45-48页
        3.2.1 实验菌株第45页
        3.2.2 主要试剂第45-46页
        3.2.3 实验方法第46-48页
            3.2.3.1 CTD02 菌株全基因组测序第46页
            3.2.3.2 CTD02 菌株全基因组注释第46-48页
    3.3 实验结果第48-56页
        3.3.1 CTD02 菌株全基因组测序结果第48-49页
        3.3.2 CTD02 菌株全基因组分析结果第49-56页
            3.3.2.1 重复序列预测第49页
            3.3.2.2 重复序列家族分类统计第49-52页
            3.3.2.3 近缘物种基因结构数量统计第52页
            3.3.2.4 功能注释情况统计第52-54页
            3.3.2.5 非编码RNA统计结果第54-55页
            3.3.2.6 全基因组圈图第55-56页
    3.4 分析与讨论第56页
    3.5 总结与展望第56-58页
        3.5.1 总结第56-57页
        3.5.2 展望第57-58页
第4章 菌株CTD02 不同温度下转录组分析第58-92页
    4.1 引言第58页
    4.2 实验材料及方法第58-69页
        4.2.1 实验菌株第58页
        4.2.2 主要试剂第58-59页
        4.2.3 引物第59页
        4.2.4 实验方法第59-69页
            4.2.4.1 转录组测序第59-64页
            4.2.4.2 反转录PCR第64-66页
            4.2.4.3 目标基因沉默第66-67页
            4.2.4.4 重组菌株生长特性分析第67页
            4.2.4.5 重组菌株的脂肪酸提取验证第67-69页
    4.3 实验结果第69-88页
        4.3.1 CTD02 菌株转录组分析结果第69-81页
            4.3.1.1 RNA样品质量分析第69页
            4.3.1.2 基因表达差异分析第69-70页
            4.3.1.3 基因表达水平分析第70-74页
            4.3.1.4 相关通路与冷适应基因分析第74-81页
        4.3.2 CTD02 菌株冷适应基因验证第81-88页
            4.3.2.1 脂肪酸合成基因荧光定量PCR验证第81-82页
            4.3.2.2 目标基因沉默第82-86页
            4.3.2.3 重组菌株脂肪酸含量与成分分析第86-88页
    4.4 分析与讨论第88-92页
第5章 总结与展望第92-96页
    5.1 主要结论第92-94页
    5.2 创新点第94-95页
    5.3 展望第95-96页
致谢第96-97页
参考文献第97-103页
附录第103页

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