论文目录 | |
摘要 | 第1-7
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Abstract | 第7-14
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第一部分 长江口及其邻近海域沉积环境细菌多样性研究 | 第14-39
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前言 | 第14
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1 长江口及其邻近海域生态与环境状况 | 第14-21
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· 长江口及其邻近海域环境特点 | 第14-16
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· 水文特点 | 第14
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· 水化学特征 | 第14-15
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· 沉积环境特点 | 第15-16
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· 分子生态学方法广泛应用于微生物研究 | 第16-18
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· 限制性片段长度多态性分析 | 第16
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· 末端限制性片段长度多态性分析 | 第16-17
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· 克隆文库分析法 | 第17
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· 变性梯度凝胶电泳(DGGE)或者温度梯度凝胶电泳(TGGE) | 第17-18
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· 单链构象多态性方法 | 第18
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· 以 PCR 为基础的分子生态学方法普遍存在的潜在问题 | 第18-19
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· 样品总 DNA 的提取效率 | 第18
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· PCR 产生的偏差 | 第18-19
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· 16SrRNA 序列分析技术作为微生物分类鉴定的理论依据 | 第19-20
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· 本文的研究目的意义 | 第20-21
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2 材料与方法 | 第21-26
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· 实验材料 | 第21-22
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· 基本方法 | 第22-26
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· 样品基因组DNA 的提取 | 第22
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· 16S rRNA 基因文库构建及序列分析 | 第22-26
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· 感受态细胞的制备 | 第22-23
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· 细菌 16S rRNA 基因片断的扩增 | 第23
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· PCR 产物的纯化与连接 | 第23
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· 重组载体的转化 | 第23-24
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· 扩增的 16S rRNA 基因基因的限制性酶切分析 | 第24-25
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· 16S rRNA 基因测序及系统进化分析 | 第25
页 |
· 多样性覆盖率、多样性指数和稀释曲线分析 | 第25-26
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3 结果与分析 | 第26-37
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· PCR扩增产物的限制性酶切分析(ARDRA) | 第26-29
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3.2 16S rRNA 基因序列系统进化分析 | 第29-37
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· 变形菌门(Proteobcteria phylum)序列分析 | 第35
页 |
· 绿弯菌门(Chloroflexi phylum)序列分析 | 第35-36
页 |
· 浮霉菌门(Planctomycetes phylum)序列分析 | 第36
页 |
· 酸杆菌门(Acidobacteria phylum)序列分析 | 第36
页 |
· 放线菌门(Actinobacteria phylum)序列分析 | 第36
页 |
· 拟杆菌门 (Bacteroidetes phylum)序列分析 | 第36
页 |
· 其它门类序列分析 | 第36-37
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4 讨论 | 第37-39
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第二部分 一株深海嗜低温萘降解细菌Nah-1 (Cycloclasticus sp.)的分离及降解基因研究 | 第39-56
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前言 | 第39
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1 深海及其环境特点 | 第39-47
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· 深海环境特点 | 第39-40
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· 海洋微生物的生物多样性 | 第40
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· 深海微生物的开发利用 | 第40
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· PAHs及对海洋环境污染的概况 | 第40-43
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· PAHs 及其危害 | 第40-41
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· 海洋PAHs 污染的来源 | 第41-42
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· PAHs 污染的生物修复(Bioremediation) | 第42-43
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· 降解PAHs 的微生物 | 第43
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· PAHs 微生物降解的一般途径 | 第43-44
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· PAHs 降解菌及降解基因研究进展 | 第44-46
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· 解环菌(Cycloclasticus)的研究进展 | 第44-45
页 |
· 海洋微生物对萘的生物降解 | 第45-46
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· 本文的研究目的及意义 | 第46-47
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2 材料与方法 | 第47-50
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· 实验材料 | 第47
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· ONR7a 培养基 | 第47-48
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· 主要实验仪器 | 第48
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· 基本方法 | 第48-50
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· 萘降解细菌的分离及形态观察 | 第48-49
页 |
· 生长条件及生长曲线测定 | 第49
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· 16S rDNA 片断的扩增 | 第49-50
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· 萘降解基因的 PCR 检测 | 第50
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3 结果与分析 | 第50-54
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· 萘降解菌株的分离及形态观察 | 第50-51
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· 底物浓度对菌株生长的影响 | 第51
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· 盐度对菌株生长的影响 | 第51-52
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· 温度对菌株生长的影响 | 第52
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· 生长曲线 | 第52-53
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· 16S rDNA 系统发育分析 | 第53-54
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· 萘降解基因的检测 | 第54
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4 讨论和结论 | 第54-56
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参考文献 | 第56-63
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致谢 | 第63-64
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个人简历 | 第64
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发表的学术论文 | 第64
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