棘托竹荪连作对土壤细菌结构和功能的影响

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棘托竹荪连作对土壤细菌结构和功能的影响

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棘托竹荪连作对土壤细菌结构和功能的影响

论文目录
摘要	第1-6页
Abstract	第6-14页
第一章绪论	第14-27页
1.1 连作障碍的研究进展	第14-18页
1.1.1 连作障碍的危害	第14-16页
1.1.2 连作障碍发生的原因	第16-17页
1.1.3 连作障碍防治措施	第17-18页
1.2 土壤微生物多样性的研究概述	第18-22页
1.2.1 土壤微生物	第18-19页
1.2.2 土壤微生物多样性研究进展	第19-20页
1.2.3 森林土壤微生物群落结构及其影响因素	第20-22页
1.2.4 森林土壤微生物多样性问题及展望	第22页
1.3 棘托竹荪的研究现状	第22-24页
1.3.1 棘托竹荪的分类	第22-23页
1.3.2 棘托竹荪的生物学特性及营养价值	第23页
1.3.3 棘托竹荪的连作障碍及其性状表现	第23-24页
1.3.4 棘托竹荪栽培特点	第24页
1.4 本课题选题依据及创新点	第24-25页
1.5 研究内容、目的与意义及技术路线图	第25-27页
1.5.1 研究内容	第25页
(1)土壤理化性质分析	第25页
(2)种植棘托竹荪后土壤细菌多样性研究	第25页
(3)土壤宏基因组研究	第25页
1.5.2 研究目的与意义	第25-26页
1.5.3 技术路线图	第26-27页
第二章棘托竹荪连作对土壤细菌群落结构的影响	第27-48页
2.1 实验区域概况	第27页
2.2 实验样地设置	第27-28页
2.3 主要试剂和仪器	第28-29页
2.4 实验方法	第29-32页
2.4.1 土壤理化性质分析	第29页
2.4.2 土壤样品高通量测序	第29-30页
2.4.3 生物信息学分析	第30-32页
2.5 结果与分析	第32-43页
2.5.1 棘托竹荪土壤理化性质分析	第32-33页
2.5.2 测序数据的处理	第33页
2.5.3 OTU注释及表达谱	第33-34页
2.5.4 物种丰富度分析	第34-36页
2.5.5 土壤细菌微生物群落和土壤理化性质之间的关系	第36-37页
2.5.6 土壤细菌微生物群落差异分析	第37-38页
2.5.7 细菌群落结构分析	第38-40页
2.5.8 棘托竹荪土壤细菌群落结构及进化分析	第40-42页
2.5.9 细菌群落功能基因差异	第42-43页
2.6 小结	第43-48页
2.6.1 种植棘托竹荪对土壤理化性质的影响	第44-45页
2.6.2 种植棘托竹荪对土壤细菌多样性的影响	第45页
2.6.3 种植棘托竹荪对土壤细菌群落结构的影响	第45-46页
2.6.4 不同土壤细菌群落组成及潜在功能比较	第46-48页
第三章棘托竹荪土壤微生物群落结构与功能	第48-63页
3.1 材料与方法	第48-50页
3.1.1 宏基因组测序	第48页
3.1.2 数据预处理	第48-49页
3.1.3 宏基因组组装	第49页
3.1.4 基因预测及丰度计算	第49页
3.1.5 物种注释	第49-50页
3.1.6 功能注释	第50页
3.2 结果与分析	第50-60页
3.2.1 测序数据质量控制	第50页
3.2.2 序列组装	第50-51页
3.2.3 基因预测	第51页
3.2.4 微生物的群落结构	第51-52页
3.2.5 功能注释	第52-55页
3.2.6 代谢通路	第55-60页
3.3 小结	第60-63页
3.3.1 棘托竹荪种植对土壤微生物功能基因的影响	第60-61页
3.3.2 棘托竹荪种植对信号转导系统的影响	第61页
3.3.3 棘托竹荪种植对N循环的影响	第61-62页
3.3.4 棘托竹荪种植对C循环的影响	第62-63页
第四章流溪河生态公益林下土壤细菌多样性	第63-75页
4.1 研究区概况	第64页
4.2 研究方法	第64-66页
4.2.1 样地设置和群落调查	第64页
4.2.2 样品采集	第64-65页
4.2.3 主要试剂和仪器	第65页
4.2.4 土壤DNA提取	第65页
4.2.5 数据分析	第65-66页
4.2.6 统计学分析	第66页
4.3 结果与分析	第66-72页
4.3.1 不同密度林分类型土壤养分含量	第66-67页
4.3.2 测序数据分析	第67-68页
4.3.3 微生物多样性指数	第68页
4.3.4 细菌群落组成	第68-72页
4.4 小结	第72-75页
4.4.1 流溪河生态公益林下土壤细菌的多样性	第72页
4.4.2 林分密度影响土壤细菌的多样性、丰富度及其群落结构	第72-73页
4.4.3 流溪河区域中密度林分更适于土壤细菌的繁衍生息	第73页
4.4.4 土壤的肥力状况受林分密度、灌木杂草的影响	第73-74页
4.4.5 16SrRNA基因的基因组异质性	第74-75页
第五章总结与展望	第75-80页
5.1 结论	第75-77页
5.1.1 棘托竹荪土壤细菌多样性结论	第75-76页
5.1.2 流溪河生态公益林下土壤细菌多样性结论	第76-77页
5.2 展望	第77-80页
5.2.1 棘托竹荪土壤细菌多样性	第77-78页
5.2.2 流溪河生态公益林土壤细菌多样性	第78-80页
参考文献	第80-94页
在读期间的学术研究	第94-95页
致谢	第95页

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