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猪CD4/CD8互斥分化机制的单类细胞转录组分析

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猪CD4/CD8互斥分化机制的单类细胞转录组分析
论文目录
 
摘要第1-10页
ABSTRACT第10-12页
缩略词表(ABBREVIATIONS)第12-14页
1 前言第14-24页
  1.1 研究问题的由来第14-15页
  1.2 文献综述第15-20页
    1.2.1 T淋巴细胞的免疫调节功能第15-16页
    1.2.2 T淋巴细胞的研究进展第16-17页
      1.2.2.1 T淋巴细胞的分化发育概况第16-17页
      1.2.2.2 T淋巴细胞亚型的多样性第17页
    1.2.3 CD4/CD8四类T淋巴细胞的研究进展第17-20页
      1.2.3.1 CD4/CD8四类T淋巴细胞第17-18页
      1.2.3.2 CD4/CD8互斥分化机制第18-19页
      1.2.3.3 CD4/CD8互斥分化的基因第19-20页
  1.3 猪CD4/CD8互斥分化机制研究的不足第20-22页
    1.3.1 以猪为模型的基础研究极少第20-21页
    1.3.2 以单基因/信号通路研究为主第21-22页
    1.3.3 全基因组水平的研究关注程度不够第22页
  1.4 本研究的目的和意义第22-24页
2 实验材料和方法第24-30页
  2.1 技术路线第24页
  2.2 实验材料第24-26页
    2.2.1 试验动物第24页
    2.2.2 主要试验试剂第24-25页
    2.2.3 主要试剂的配置第25页
    2.2.4 主要实验仪器第25页
    2.2.5 主要分子生物学软件第25-26页
    2.2.6 主要图像分析软件第26页
    2.2.7 主要数据库及相关网站第26页
  2.3 方法第26-30页
    2.3.1 仔猪胸腺的采集第26页
    2.3.2 胸腺T淋巴细胞悬液的制备第26页
    2.3.3 流式细胞术分选猪胸腺CD4/CD8 T细胞第26-27页
    2.3.4 细胞培养第27页
    2.3.5 流式细胞术分析培养后的猪胸腺CD4/CD8 T细胞第27页
    2.3.6 单类细胞测序样品的制备第27-28页
    2.3.7 单类细胞扩增第28页
    2.3.8 建库测序第28-29页
    2.3.9 差异表达基因数据处理第29-30页
3 结果第30-52页
  3.1 流式细胞术分选情况的研究第30-36页
    3.1.1 猪胸腺CD4/CD8四类T细胞分选结果第30-33页
    3.1.2 流式细胞仪分析培养72h的四类T细胞第33-34页
    3.1.3 单类细胞转录组测序样品的制备第34-36页
  3.2 文库构建和质检情况的研究第36-40页
    3.2.1 猪胸腺CD4/CD8四类T细胞亚型的文库信息第36页
    3.2.2 文库质检情况第36-40页
  3.3 单类细胞测序结果的研究第40-52页
    3.3.1 基因表达水平分析第40-42页
    3.3.2 差异表达基因的分布情况第42-48页
    3.3.3 差异表达基因的二维聚类分析结果第48-49页
    3.3.4 差异基因GO富集分析第49-52页
4 讨论第52-58页
  4.1 关于猪胸腺CD4/CD8四类T细胞亚型分选及培养的讨论第52-53页
  4.2 关于胸腺细胞悬液制备方法选择的讨论第53-54页
  4.3 各T细胞亚型文库质检结果的讨论第54页
  4.4 关于猪胸腺不同T细胞亚型基因表达水平的讨论第54-55页
  4.5 关于猪胸腺不同T细胞亚型差异基因的讨论第55-56页
  4.6 关于下一步工作的计划第56-58页
5 小结第58-60页
  5.1 本研究的主要结果第58页
  5.2 本研究的创新点与特色第58-59页
  5.3 本研究的不足之处第59-60页
参考文献第60-68页
致谢第68-69页

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