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斑马鱼miR-125c在细胞低氧应答和胚胎发育中的功能

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斑马鱼miR-125c在细胞低氧应答和胚胎发育中的功能
论文目录
 
摘要第1-10页
Abstract第10-13页
缩略语表第13-14页
1 前言第14-23页
  1.1 低氧对鱼类的影响第14页
  1.2 HIF的概况第14-16页
    1.2.1 HIF-1α 的作用机制第15页
    1.2.2 HIF-1α 的功能第15-16页
  1.3 MiRNA的研究进展第16-20页
    1.3.1 MiRNA的发现第16-17页
    1.3.2 MiRNA的生物合成过程第17-18页
    1.3.3 MiRNA的功能第18-19页
    1.3.4 低氧应答相关mi RNA的研究进展第19-20页
  1.4 MiR-125 家族简介第20页
  1.5 Cdc25a的研究进展第20-22页
  1.6 研究目的及意义第22-23页
2 材料与方法第23-46页
  2.1 实验材料第23-25页
    2.1.1 实验鱼第23页
    2.1.2 实验细胞系第23页
    2.1.3 主要的仪器设备及试剂第23-25页
      2.1.3.1 主要的仪器设备第23-24页
      2.1.3.2 主要的试剂第24-25页
  2.2 实验方法第25-46页
    2.2.1 斑马鱼基因组DNA的提取第25-26页
    2.2.2 总RNA的提取第26页
    2.2.3 反转录第26-27页
      2.2.3.1 通用引物法第26-27页
      2.2.3.2 Stem-loop法第27页
    2.2.4 引物设计第27-29页
      2.2.4.1 MiR-125c反转录引物设计第27页
      2.2.4.2 MiR-125c荧光定量PCR引物设计第27-28页
      2.2.4.3 Cdc25a-3’UTR野生型及突变型扩增引物设计第28-29页
    2.2.5 荧光定量PCR第29-30页
    2.2.6 质粒构建第30-33页
      2.2.6.1 包含HRE位点的荧光素酶报告载体的构建第30-31页
      2.2.6.2 用于靶基因验证的质粒构建第31-33页
    2.2.7 细胞实验第33-39页
      2.2.7.1 细胞传代培养第33-34页
      2.2.7.2 细胞冻存以及细胞复苏第34页
      2.2.7.3 HeLa细胞转染及其HRE启动子活性分析第34-36页
      2.2.7.4 HeLa细胞转染及双荧光素酶报告载体活性分析第36页
      2.2.7.5 ZF4细胞转染siRNA第36页
      2.2.7.6 CoCl_2模拟低氧处理ZF4细胞第36-37页
      2.2.7.7 细胞增殖检测第37页
      2.2.7.8 细胞周期检测第37-38页
      2.2.7.9 细胞凋亡检测第38-39页
    2.2.8 蛋白实验第39-42页
      2.2.8.1 细胞总蛋白提取第39页
      2.2.8.2 胚胎总蛋白提取第39-40页
      2.2.8.3 Western blot第40页
      2.2.8.4 Cdc25a的原核表达及纯化第40-42页
    2.2.9 生物信息学方法预测靶标第42页
    2.2.10 胚胎实验第42-44页
      2.2.10.1 显微注射第42页
      2.2.10.2 Terminal transferase dUTP nick end labeling(TUNEL)第42-43页
      2.2.10.3 活胚胎吖啶橙(Acridine orange, AO)染色第43页
      2.2.10.4 斑马鱼机械触动运动轨迹试验第43-44页
    2.2.11 斑马鱼石蜡切片第44-45页
      2.2.11.1 斑马鱼石蜡包埋第44页
      2.2.11.2 切片第44页
      2.2.11.3 H&E染色第44-45页
    2.2.12 数据分析第45-46页
3 结果与分析第46-60页
  3.1 MiR-125 家族序列分析第46-47页
    3.1.1 MiR-125 家族序列进化树分析第46-47页
    3.1.2 MiR-125 家族的序列特征第47页
  3.2 斑马鱼miR-125c启动子活性分析第47-50页
    3.2.1 斑马鱼ZF4细胞CoCl_2处理第47-48页
    3.2.2 斑马鱼mi R-125c HRE验证第48-49页
    3.2.3 ZF4细胞Hif-1α knockdown第49-50页
  3.3 斑马鱼miR-125c靶基因验证第50-51页
  3.4 斑马鱼miR-125c负调控cdc25a的表达第51-54页
    3.4.1 MiR-125c在细胞水平负调控cdc25a的表达第51-53页
    3.4.2 MiR-125c在胚胎中负调控cdc25a的表达第53页
    3.4.3 低氧条件下,mi R-125c与cdc25a的表达相反第53-54页
  3.5 斑马鱼miR-125c对细胞增殖、细胞周期和细胞凋亡的影响第54-58页
    3.5.1 MiR-125c通过阻滞细胞的G1期进程抑制ZF4细胞增殖第54-56页
    3.5.2 MiR-125c诱导细胞凋亡第56-58页
  3.6 MiR-125c在斑马鱼胚胎发育中的功能第58-60页
    3.6.1 Mi R-125c的过表达影响斑马鱼的胚胎发育第58页
    3.6.2 Mi R-125c的过表达导致斑马鱼仔鱼的运动能力减弱第58-59页
    3.6.3 Mi R-125c过表达引起斑马鱼组织受损第59-60页
4 讨论第60-64页
参考文献第64-77页
附录第77-78页
致谢第78页

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