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黄颡鱼TLR18、TLR19和TLR21基因的克隆及表达分析

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黄颡鱼TLR18、TLR19和TLR21基因的克隆及表达分析
论文目录
 
摘要第1-9页
Abstract第9-12页
第一章 文献综述第12-25页
1 前言第12页
2 非特异性免疫系统概述第12-14页
  2.1 鱼类的非特异性免疫第12-13页
  2.2 非特异性免疫的模式识别受体第13-14页
3 TOLL样受体研究进展第14-20页
  3.1 TOLL样受体的发现及种类第14-15页
  3.2 TOLL样受体的结构和分布第15页
  3.3 鱼类TOLL样受体的分类及免疫应答研究第15-20页
    3.3.1 TLR1亚家族第16-17页
    3.3.2 TLR3亚家族第17页
    3.3.3 TLR4亚家族第17-18页
    3.3.4 TLR5亚家族第18页
    3.3.5 TLR7亚家族第18-19页
    3.3.6 TLR11亚家族第19-20页
4 鱼类TLR介导的免疫信号传导第20-23页
  4.1 TLR信号传导中的衔接蛋白第20-21页
  4.2 MyD88依赖途径第21-22页
  4.3 MyD88非依赖途径第22-23页
5 黄颡鱼疾病研究概况第23-24页
6 本研究的目的和意义第24-25页
第二章 黄颡鱼Pf_TLR18、Pf_TLR19和Pf_TLR21基因的克隆和序列分析第25-47页
1 前言第25页
2 材料和方法第25-34页
  2.1 实验样本第25页
  2.2 主要实验仪器与设备第25-26页
  2.3 药品与试剂第26-27页
    2.3.1 试剂盒及药品第26页
    2.3.2 主要试剂配置第26-27页
  2.4 引物设计第27-28页
  2.5 实验方法第28-34页
    2.5.1 总RNA的提取第28-29页
    2.5.2 总RNA质量检测第29页
    2.5.3 cDNA模板制备第29-30页
    2.5.4 黄颡鱼Pf_TLR18、Pf_TLR19和Pf_TLR21 cDNA中间保守区片段的克隆第30-31页
    2.5.5 PCR产物的分离,回收和纯化第31页
    2.5.6 感受态细胞制备第31-32页
    2.5.7 连接和转化第32-33页
    2.5.8 菌液PCR检测第33页
    2.5.9 黄颡鱼Pf_TLR18, Pf_TLR19和Pf_TLR21 cDNA 3'端扩增第33页
    2.5.10 黄颡鱼Pf_TLR21 cDNA 5'端扩增第33-34页
    2.5.11 序列的生物信息学分析第34页
3 结果与分析第34-45页
  3.1 总RNA的检测第34-35页
  3.2 黄颡鱼Pf_TLR18 cDNA部分序列的克隆与分析第35-39页
    3.2.1 黄颡鱼Pf_TLR18 cDNA部分序列的特征第35-37页
    3.2.2 黄颡鱼Pf_TLR18氨基酸序列分析第37-38页
    3.2.3 黄颡鱼Pf_TLR18基因的系统发育第38-39页
  3.3 黄颡鱼Pf_TLR19 cDNA部分序列的克隆与分析第39-42页
    3.3.1 黄颡鱼Pf_TLR19 cDNA部分序列的特征第39-42页
    3.3.2 黄颡鱼Pf_TLR19氨基酸序列同源性分析第42页
    3.3.3 黄颡鱼Pf_TLR19基因的系统发育第42页
  3.4 黄颡鱼Pf_TLR21 cDNA序列的克隆与分析第42-45页
    3.4.1 黄颡鱼Pf_TLR21 cDNA部分序列的特征第42-45页
    3.4.2 黄颡鱼Pf_TLR21氨基酸序列同源性分析第45页
    3.4.3 黄颡鱼Pf_TLR21基因的系统发育第45页
4 讨论第45-47页
第三章 黄颡鱼Pf_TLR18、Pf_TLR19和Pf_TLR21基因mRNA的表达分析第47-69页
1 前言第47页
2 材料和方法第47-52页
  2.1 实验内容和实验样本第47-49页
    2.1.1 黄颡鱼成鱼组织样本采集第47页
    2.1.2 黄颡鱼早期发育阶段样本采集第47-48页
    2.1.3 灭活嗜水气单胞菌刺激后组织样本的采集第48-49页
    2.1.4 不同配体刺激淋巴细胞后样品的采集第49页
  2.2 主要实验仪器与设备第49-50页
  2.3 药品与试剂第50页
  2.4 引物设计第50-51页
  2.5 实验方法第51-52页
    2.5.1 总RNA的提取第51页
    2.5.2 cDNA模板制备第51页
    2.5.3 荧光定量PCR引物检测第51-52页
    2.5.4 数据分析第52页
3 结果与分析第52-64页
  3.1 黄颡鱼Pf_TLR18、Pf_TLR19和Pf_TLR21基因mRN A在成鱼组织中的表达第52-54页
    3.1.1 黄颡鱼Pf_TLR18基因mRNA的组织表达第52-54页
    3.1.2 黄颡鱼Pf_TLR19基因mRNA的组织表达第54页
    3.1.3 黄颡鱼Pf_TLR21基因mRNA的组织表达第54页
  3.2 黄颡鱼Pf_TLR18、Pf_TLR19和Pf_TLR21 mRNA在胚胎和早期发育阶段的表达第54-57页
    3.2.1 黄颡鱼Pf_TLR18基因mRNA在胚胎和早期发育阶段的表达第54-56页
    3.2.2 黄颡鱼Pf_TLR19基因mRN A在胚胎和早期发育阶段的表达第56页
    3.2.3 黄颡鱼Pf_TLR21基因mRNA在胚胎和早期发育阶段的表达第56-57页
  3.3 灭活嗜水气单胞菌刺激前后黄颡鱼Pf_TLR18、Pf_TLR19和Pf_TLR21 mRN A在5个组织中表达量的变化第57-62页
    3.3.1 Pf_TLR18 mRN A表达量的变化第57-59页
    3.3.2 Pf_TLR19基因mRNA表达量的变化第59-60页
    3.3.3 Pf_TLR21基因mRNA表达量的变化第60-62页
  3.4 LPS、PGN和Poly (I:C)刺激后黄颡鱼Pf_TLR18、Pf_TLR19和Pf_TLR21 mRN A在黄颡鱼外周血淋巴细胞中表达量的变化第62-64页
4 讨论第64-69页
  4.1 黄颡鱼Pf_TLR18、Pf_TLR19和Pf_TLR21基因mRN A的组织特异性表达第64-65页
  4.2 黄颡鱼Pf_TLR18、Pf_TLR19和Pf_TLR21基因mRN A在胚胎和早期发育阶段的表达特征第65-66页
  4.3 灭活细菌刺激后黄颡鱼Pf_TLR18、Pf_TLR19和Pf_TLR21基因mRNA在5个组织中表达量的变化第66-69页
第四章 黄颡鱼LRR18、LRR19和LRR21的原核表达第69-79页
1 前言第69页
2 材料和方法第69-75页
  2.1 主要实验仪器与设备第69页
  2.2 药品与试剂第69-70页
    2.2.1 试剂盒及药品第69页
    2.2.2 主要试剂配置第69-70页
  2.3 引物设计第70-71页
  2.4 实验方法第71-75页
    2.4.1 胞外区片段的克隆第71页
    2.4.2 质粒的提取与检测第71-72页
    2.4.3 PCR产物与pGEX-4T-1 载体的连接和转化第72-73页
    2.4.4 重组质粒的诱导表达表达第73-74页
    2.4.5 SDS-PAGE电泳第74-75页
    2.4.6 表达产物的鉴定第75页
3 结果与分析第75-78页
  3.1 构建黄颡鱼胞外区重组质粒第75-76页
  3.2 黄颡鱼外区片段LRR18、LRR19和LRR21的诱导表达第76-78页
4 讨论第78-79页
参考文献第79-87页
攻读学位期间发表论文情况第87-88页
致谢第88页

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