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氧化油脂诱导泥鳅氧化应激的转录组分析及氧化油脂对fabp2表达的影响研究

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氧化油脂诱导泥鳅氧化应激的转录组分析及氧化油脂对fabp2表达的影响研究
论文目录
 
摘要第1-9页
Abstract第9-11页
缩略语表第11-13页
第一章 引言第13-20页
1.氧化油脂第13-14页
2.转录组概述第14-15页
  2.1 转录组的定义第14页
  2.2 转录组的研究意义第14-15页
  3. fabp2基因第15-17页
  3.1 FABPs家族简介第15-16页
  3.2 FABPs家族的分类第16页
  3.3 fabps基因表达的调控机制第16-17页
  3.4 FABPs的生物学特性第17页
4.研究目的和意义第17-20页
第二章 摄食氧化鱼油饲料的泥鳅幼鱼肝脏转录组分析第20-50页
1.前言第20-21页
2.材料和方法第21-33页
  2.1 饲料的准备和制作第21-23页
  2.2 实验鱼的饲养第23页
  2.3 样品收集和准备第23页
  2.4 抗氧化酶活性的测定第23-24页
  2.5 TBARS值的测定第24页
  2.6 油红O染色第24页
  2.7 总RNA提取,cDNA文库第24-26页
  2.8 转录组测序第26-27页
  2.9 测序数据处理与分析第27页
  2.10 测序原始数据的处理第27-29页
  2.11 Unigene的功能注释、GO分类与代谢通路分析第29-30页
  2.12 Unigene编码序列的预测第30页
  2.13 Unigene表达差异分析第30页
  2.14 RT-PCR验证RNA测序第30-31页
  2.15 统计分析第31-33页
3.结果与分析第33-47页
  3.1 不同氧化程度鱼油对泥鳅幼鱼抗氧化性能的影响第33页
  3.2 生长性能和油红O染色第33页
  3.3 转录组测序和Unigenes统计第33-36页
  3.4 Unigenes的功能注释和分类第36-39页
  3.5 差异表达基因的分析第39页
  3.6 差异表达基因的富集功能分析第39-43页
  3.7 RT-PCR对RNA-Seq结果的验证第43-47页
4.讨论第47-49页
5.小结第49-50页
第三章 泥鳅fabp2基因的克隆及氧化鱼油对fabp2表达的影响研究第50-72页
1.前言第50页
2.材料与方法第50-62页
  2.1 实验鱼第50页
  2.2 总RNA的提取和cDNA的合成第50-51页
  2.3 基因克隆第51-54页
  2.4 序列比对、进化树分析第54页
  2.5 不同组织和不同发育时期的基因表达分析第54-55页
  2.6 投喂含有不同氧化程度鱼油的饲料第55页
  2.7 样品采集与分析第55-56页
  2.8 HE染色和油红O染色第56页
  2.9 组织切片原位杂交第56-57页
  2.10 荧光原位杂交第57页
  2.11 荧光定量PCR第57-58页
  2.12 Western blotting第58-62页
3.结果与分析第62-69页
  3.1 基因克隆得到cDNA全长序列第62页
  3.2 泥鳅fabp2基因的序列比对和系统进化分析第62-64页
  3.3 泥鳅fabp2基因的时空表达第64-65页
  3.4 不同氧化程度鱼油的饲料对泥鳅肠道形态的影响第65页
  3.5 不同氧化程度鱼油的饲料对泥鳅肠道中fabp2基因定位的影响第65页
  3.6 不同氧化程度鱼油的饲料对泥鳅肠道中基因表达的影响第65-69页
  3.7 不同氧化程度鱼油的饲料对泥鳅肠道中FABP2蛋白表达的影响第69页
4.讨论第69-71页
5.小结第71-72页
第四章 总结第72-73页
参考文献第73-84页
附录第84-86页
致谢第86页

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