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大黄鱼（Larimichthys crocea）胚胎发育转录组分析
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大黄鱼（Larimichthys crocea）胚胎发育转录组分析
论文目录
 
摘要第1-7页
ABSTRACT第7-9页
基因名称缩略表（Gene name abbreviations）第9-12页
1 胚胎发育生物学简介第12-22页
　　1.1 胚胎发育生物学发展第12-14页
　　1.2 高通量基因组学研究技术在胚胎发育中的应用第14-16页
　　　　1.2.1 生物芯片技术第14-15页
　　　　1.2.2 高通量测序技术第15-16页
　　1.3 大黄鱼胚胎发育研究进展第16-22页
　　　　1.3.1 形态学研究第17-18页
　　　　1.3.2 分子学研究第18-20页
　　　　1.3.3 高通量基因表达谱的研究第20-22页
2 研究目的及意义第22-23页
3 实验材料和方法第23-31页
　　3.1 实验材料第23-25页
　　　　3.1.1 胚胎材料的获取第23-24页
　　　　3.1.2 主要仪器第24页
　　　　3.1.3 主要引物第24-25页
　　3.2 实验方法第25-31页
　　　　3.2.1 总RNA提取第25页
　　　　3.2.2 去除RNA中残留的基因组第25-26页
　　　　3.2.3 m RNA的浓度及质量检测第26页
　　　　3.2.4 转录组测序第26-27页
　　　　3.2.5 转录组信息分析第27-28页
　　　　3.2.6 转录本的表达丰度第28-29页
　　　　3.2.7 反转录反应第29页
　　　　3.2.8 Real time PCR反应第29-30页
　　　　3.2.9 样本层次聚类树及主成分分析（PCA）第30页
　　　　3.2.10 共表达模块划分第30-31页
4 结果与分析第31-49页
　　4.1 胚胎收集结果第31页
　　4.2 RNA提取结果第31-32页
　　4.3 转录组概况第32-38页
　　　　4.3.1 转录本打断随机性第32页
　　　　4.3.2 样品测序分析第32-33页
　　　　4.3.3 样本关系分析第33-35页
　　　　4.3.4 显著差异表达基因统计第35-37页
　　　　4.3.5 基因共表达网络分析第37-38页
　　4.4 特定时期功能基因分析第38-47页
　　　　4.4.1 母源基因第38-42页
　　　　4.4.2 能量代谢第42-45页
　　　　4.4.3 器官的发生第45-47页
　　4.5 RT-PCR验证第47-49页
　　5. 结论第49-51页
参考文献第51-60页
在学期间发表论文第60-61页
致谢第61页

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