论文目录 | |
| 摘要 | 第1-9页 |
| Abstract | 第9-11页 |
| 缩略语表（Abbreviation） | 第11-13页 |
| 1 文献综述 | 第13-23页 |
| 1.1 鲤春病毒血症研究进展 | 第13-17页 |
| 1.1.1 引言 | 第13页 |
| 1.1.2 SVC的流行特点 | 第13-14页 |
| 1.1.3 临床症状 | 第14页 |
| 1.1.4 SVCV概述 | 第14-15页 |
| 1.1.5 SVCV结构蛋白 | 第15-17页 |
| 1.1.6 SVCV检测方法 | 第17页 |
| 1.2 TRIM家族研究进展 | 第17-23页 |
| 1.2.1 引言 | 第17-18页 |
| 1.2.2 RING结构域 | 第18-19页 |
| 1.2.3 B-box结构域 | 第19页 |
| 1.2.4 Coiled-coil结构域 | 第19-20页 |
| 1.2.5 PRY/SPRY结构域 | 第20页 |
| 1.2.6 TRIM蛋白与天然免疫 | 第20-21页 |
| 1.2.7 鱼类TRIM家族 | 第21-22页 |
| 1.2.7.1 鱼类TRIM基因的多样性 | 第21页 |
| 1.2.7.2 鱼类TRIM的免疫活性 | 第21-22页 |
| 1.2.8 TRIM47研究进展 | 第22-23页 |
| 2 研究目的及意义 | 第23-24页 |
| 3 材料与方法 | 第24-38页 |
| 3.1 实验材料 | 第24-28页 |
| 3.1.1 毒株、细胞系、斑马鱼、鲤及不同发育时期的鲤胚胎 | 第24页 |
| 3.1.2 载体与质粒 | 第24-25页 |
| 3.1.3 主要药品及试剂 | 第25-26页 |
| 3.1.4 主要培养基及其配制 | 第26页 |
| 3.1.5 主要缓冲液、溶液及其配制 | 第26-27页 |
| 3.1.6 主要实验仪器及设备 | 第27-28页 |
| 3.2 实验方法 | 第28-38页 |
| 3.2.1 FHM细胞复苏 | 第28页 |
| 3.2.2 FHM细胞传代培养 | 第28页 |
| 3.2.3 FHM细胞冻存 | 第28-29页 |
| 3.2.4 SVCV感染FHM细胞 | 第29页 |
| 3.2.5 SVCV感染鱼体（鲤和斑马鱼） | 第29页 |
| 3.2.6 总RNA的提取 | 第29-30页 |
| 3.2.7 重组质粒的构建 | 第30-31页 |
| 3.2.7.1 鲤TRIM47的克隆与鉴定 | 第30页 |
| 3.2.7.2 真核表达质粒的构建 | 第30-31页 |
| 3.2.8 细胞转染及间接免疫荧光实验 | 第31-32页 |
| 3.2.9 荧光定量PCR实验 | 第32-33页 |
| 3.2.10 Western blot实验 | 第33-34页 |
| 3.2.11 病毒滴度测定实验 | 第34页 |
| 3.2.12 组织病理切片的制作 | 第34-35页 |
| 3.2.13 转录组数据分析 | 第35-37页 |
| 3.2.13.1 差异基因筛选（DEGs） | 第35-36页 |
| 3.2.13.2 差异基因的GO功能显著性富集分析 | 第36-37页 |
| 3.2.14 统计学方法 | 第37-38页 |
| 4 实验结果 | 第38-60页 |
| 4.1 TRIM47基因克隆、序列分析及生物学特性 | 第38-46页 |
| 4.1.1 TRIM47基因克隆载体构建 | 第38-39页 |
| 4.1.2 TRIM47序列分析 | 第39-41页 |
| 4.1.3 TRIM47组织分布及胚胎发育早期表达特性 | 第41页 |
| 4.1.4 SVCV感染后鲤TRIM47体外、体内表达谱特点 | 第41-43页 |
| 4.1.5 鲤TRIM47体外真核表达及亚细胞定位 | 第43-45页 |
| 4.1.6 过表达TRIM47抑制SVCV复制 | 第45-46页 |
| 4.2 SVCV感染斑马鱼转录组分析 | 第46-60页 |
| 4.2.1 病毒检测 | 第46-50页 |
| 4.2.2 转录组测序及片段比对 | 第50-51页 |
| 4.2.3 差异表达基因及分析 | 第51-52页 |
| 4.2.4 差异基因聚类 | 第52-53页 |
| 4.2.5 差异基因GO功能分析 | 第53-54页 |
| 4.2.6 KEGG信号通路分析 | 第54-55页 |
| 4.2.7 SVCV感染后3’和5’可变剪接统计分析 | 第55-57页 |
| 4.2.8 RSAD2基因参与调控的信号通路及蛋白互作网络预测 | 第57-58页 |
| 4.2.9 差异表达基因的验证 | 第58页 |
| 4.2.10 RSAD2可变剪接的验证 | 第58-60页 |
| 5 讨论与结论 | 第60-64页 |
| 5.1 讨论 | 第60-62页 |
| 5.1.1 鲤TRIM47生物特性分析及功能初步探究 | 第60-61页 |
| 5.1.2 SVCV感染斑马鱼转录组分析 | 第61-62页 |
| 5.2 结论 | 第62-64页 |
| 5.2.1 鲤TRIM47生物特性分析及功能初步探究 | 第62-63页 |
| 5.2.2 SVCV感染斑马鱼转录组分析 | 第63-64页 |
| 参考文献 | 第64-73页 |
| 附录 | 第73-75页 |
| 致谢 | 第75页 |
