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海拔高度及饲养方式对藏猪肠道菌群结构及其特征的影响

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海拔高度及饲养方式对藏猪肠道菌群结构及其特征的影响
论文目录
 
摘要第1-6页
Abstract第6-8页
第一章 文献综述第8-18页
  1.1 肠道微生物的重要功能第8-11页
    1.1.1 对营养物质的代谢第8-9页
    1.1.2 对免疫功能的调控第9页
    1.1.3 对大脑和行为的影响第9-10页
    1.1.4 对疾病的影响第10-11页
  1.2 猪肠道微生物的组成第11-12页
    1.2.1 猪肠道微生物的定植第11页
    1.2.2 猪不同肠道部位的微生物组成第11-12页
  1.3 影响猪肠道微生物组成的因素第12-14页
    1.3.1 饲料类型第12页
    1.3.2 日龄第12-13页
    1.3.3 抗生素第13页
    1.3.4 遗传背景第13-14页
    1.3.5 海拔第14页
  1.4 研究肠道微生物的主要方法第14-15页
    1.4.1 16S rRNA基因高通量测序技术第14-15页
    1.4.2 宏基因组测序技术第15页
    1.4.3 宏转录组测序技术第15页
    1.4.4 宏蛋白质组技术第15页
  1.5 藏猪优良种质特性研究进展第15-17页
    1.5.1 藏猪概况第15-16页
    1.5.2 藏猪优良种质特性研究现状第16-17页
  1.6 研究目的和意义第17-18页
    1.6.1 研究目的第17页
    1.6.2 研究意义第17-18页
第二章 研究正文第18-31页
  2.1 引言第18页
  2.2 材料与方法第18-20页
    2.2.1 实验材料第18-19页
    2.2.2 实验方法第19-20页
  2.3 结果第20-28页
    2.3.1 16S rRNA基因测序数据第20-21页
    2.3.2 藏猪肠道菌群组成和互作第21-23页
    2.3.3 影响藏猪肠道菌群组成的因素第23-25页
      2.3.3.1 饲养方式对藏猪肠道菌群结构的影响第23-24页
      2.3.3.2 海拔高度对藏猪肠道菌群组成影响第24页
      2.3.3.3 日龄对藏猪肠道菌群组成的影响第24-25页
    2.3.4 与其它猪种相比藏猪肠道菌群的特点第25-28页
      2.3.4.1 不同品种猪肠道微生物多样性分析第26页
      2.3.4.2 藏猪群体显著富集或特有的肠道菌群第26-27页
      2.3.4.3 藏猪肠道微生物富集的功能第27-28页
  2.4 讨论第28-31页
第三章 总结与展望第31-32页
参考文献第32-42页
附录1 藏猪肠道微生物高丰度核心菌群第42-45页
附录2 显著富集于不同饲养方式的藏猪的微生物菌属第45-47页
附录3 不同饲养方式的藏猪肠道微生物KEGG功能预测富集情况第47-50页
附录4 与海拔高度变化趋势成正相关的OTU第50-51页
致谢第51页

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