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巴马香猪全基因组拷贝数变异的检测及其与五块四肢骨骼长度的关联分析
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巴马香猪全基因组拷贝数变异的检测及其与五块四肢骨骼长度的关联分析
论文目录
 
摘要第1-7页
Abstract第7-8页
第一章 文献综述第8-17页
　　1.1 引言第8-9页
　　1.2 基因组拷贝变异研究进展第9-13页
　　　　1.2.1 CNV的定义和常见形式第9页
　　　　1.2.2 CNV形成机制第9-10页
　　　　1.2.3 CNV作用机制第10-12页
　　　　1.2.4 CNV的检测方法第12-13页
　　1.3 CNV在家畜基因组中的研究进展第13-15页
　　　　1.3.1 猪CNV的研究进展第14页
　　　　1.3.2 CNV在其它家畜基因组中研究进展第14-15页
　　1.4 猪四肢骨骼长度的研究进展第15页
　　1.5 巴马香猪概况第15-16页
　　1.6 研究目的和意义第16-17页
第二章 研究正文第17-39页
　　2.1 前言第17页
　　2.2 实验材料与方法第17-22页
　　　　2.2.1 实验动物第17页
　　　　2.2.2 表型的测定第17-18页
　　　　2.2.3 描述性统计分析第18页
　　　　2.2.4 基因分型和质量控制第18页
　　　　2.2.5 CNV的检测第18-20页
　　　　2.2.6 CNVR的定义第20页
　　　　2.2.7 CNVR中基因及其功能的发掘第20-21页
　　　　2.2.8 全基因组关联分析对CNVR的验证第21-22页
　　　　2.2.9 标记密度对CNV检验的影响第22页
　　　　2.2.10 CNVR对5个骨骼性状影响的统计检验第22页
　　2.3 结果第22-36页
　　　　2.3.1 表型数据统计结果第22页
　　　　2.3.2 芯片质控结果第22-23页
　　　　2.3.3 拷贝数变异区域图谱的构建第23-31页
　　　　2.3.4 标记密度对CNV检测的影响第31页
　　　　2.3.5 CNVR包含的基因及其功能分析第31-32页
　　　　2.3.6 全基因组关联分析对CNVR的验证第32页
　　　　2.3.7 CNVR与5个四肢骨骼长度关联分析结果第32-36页
　　2.4 讨论第36-38页
　　　　2.4.1 高密度SNP芯片的优势第36页
　　　　2.4.2 CNV不同检测方法的比较第36页
　　　　2.4.3 CNV的验证效率比较低第36页
　　　　2.4.4 SNP芯片密度对CNV检测率和准确性的影响第36-37页
　　　　2.4.5 关联的CNVR区域与前人研究结果的比较第37-38页
　　2.5 小结第38-39页
参考文献第39-45页
致谢第45-47页
附录 Appendix第47-55页
文章发表第55页

本篇论文共55页，点击这进入下载页面。
 
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