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基于MPI的并行DNA序列比对系统的设计与实现

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基于MPI的并行DNA序列比对系统的设计与实现
论文目录
 
摘要第1-5页
Abstract第5-8页
第1章 绪论第8-15页
  · 课题背景第8-9页
  · 研究的目的和意义第9-11页
  · 国内外研究现状第11-14页
  · 本文主要研究内容第14-15页
第2章 相关技术和方法第15-23页
  · 测序技术及测序数据第15-18页
  · DNA序列数据的主流比对方法第18-20页
    · 基于哈希索引的比对方法第18-19页
    · 基于BWT索引的比对方法第19-20页
  · MPI并行编程技术第20-22页
  · 本章小结第22-23页
第3章 基于MPI的并行比对方法第23-41页
  · MPI并行整体设计第23-24页
  · 参考基因数据预处理第24-28页
  · 测序数据预处理第28-30页
  · 多层过滤比对第30-34页
  · 比对结果统计第34-38页
  · 每节点多线程第38-40页
  · 本章小结第40-41页
第4章 基于排序的DNA序列比对算法第41-52页
  · 比对算法整体设计第41-42页
  · 分段排序算法第42-44页
  · 精确比对算法第44-45页
  · 模糊比对算法第45-50页
    · 碱基替换比对算法第45-47页
    · 邻位插入删除比对算法第47-50页
  · 时空复杂度分析第50-51页
  · 本章小结第51-52页
第5章 系统的实现与评测第52-71页
  · 系统实现第52-58页
  · 系统部署第58-60页
  · 测试实验第60-70页
    · 比对算法测试第60-65页
    · 并行方法测试第65-70页
  · 本章小结第70-71页
结论第71-72页
参考文献第72-78页
致谢第78页

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