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基于MPI的并行DNA序列比对系统的设计与实现
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基于MPI的并行DNA序列比对系统的设计与实现
论文目录
摘要
第1-5页
Abstract
第5-8页
第1章 绪论
第8-15页
· 课题背景
第8-9页
· 研究的目的和意义
第9-11页
· 国内外研究现状
第11-14页
· 本文主要研究内容
第14-15页
第2章 相关技术和方法
第15-23页
· 测序技术及测序数据
第15-18页
· DNA序列数据的主流比对方法
第18-20页
· 基于哈希索引的比对方法
第18-19页
· 基于BWT索引的比对方法
第19-20页
· MPI并行编程技术
第20-22页
· 本章小结
第22-23页
第3章 基于MPI的并行比对方法
第23-41页
· MPI并行整体设计
第23-24页
· 参考基因数据预处理
第24-28页
· 测序数据预处理
第28-30页
· 多层过滤比对
第30-34页
· 比对结果统计
第34-38页
· 每节点多线程
第38-40页
· 本章小结
第40-41页
第4章 基于排序的DNA序列比对算法
第41-52页
· 比对算法整体设计
第41-42页
· 分段排序算法
第42-44页
· 精确比对算法
第44-45页
· 模糊比对算法
第45-50页
· 碱基替换比对算法
第45-47页
· 邻位插入删除比对算法
第47-50页
· 时空复杂度分析
第50-51页
· 本章小结
第51-52页
第5章 系统的实现与评测
第52-71页
· 系统实现
第52-58页
· 系统部署
第58-60页
· 测试实验
第60-70页
· 比对算法测试
第60-65页
· 并行方法测试
第65-70页
· 本章小结
第70-71页
结论
第71-72页
参考文献
第72-78页
致谢
第78页
本篇论文共
78
页,
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。
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