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呼伦贝尔羊尾部脂肪性状的全基因组关联分析和选择信号检测

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呼伦贝尔羊尾部脂肪性状的全基因组关联分析和选择信号检测
论文目录
 
摘要第1-8页
abstract第8-13页
第一章 引言第13-22页
  1.1 脂尾性状的研究意义第13页
  1.2 呼伦贝尔羊品种简介第13-14页
  1.3 全基因组关联分析第14-19页
    1.3.1 全基因组关联分析简介第14页
    1.3.2 GWAS在绵羊中的重要性状研究第14-15页
    1.3.3 绵羊重要性状的GWAS分析第15-18页
    1.3.4 GWAS存在问题及展望第18-19页
  1.4 全基因组选择信号检测第19-21页
    1.4.1 选择信号检测简介第19页
    1.4.2 选择信号的检测方法第19-20页
    1.4.3 选择信号在羊上的应用第20-21页
    1.4.4 选择信号检测展望第21页
  1.5 本研究的目的和意义第21-22页
第二章 呼伦贝尔羊尾部脂肪相关性状全基因组关联分析第22-33页
  2.1 试验材料第22-23页
    2.1.1 试验样品采集第22页
    2.1.2 主要试验仪器与试剂第22-23页
  2.2 试验方法第23-24页
    2.2.1 绵羊样品基因组DNA提取与检测第23页
    2.2.2 样品基因型检测第23页
    2.2.3 SNP芯片数据的质量控制第23-24页
    2.2.4 统计模型图第24页
    2.2.5 候选基因的检测和注释第24页
  2.3 试验结果第24-30页
    2.3.1 表型和基因型数据处理结果第24-25页
    2.3.2 候选基因的确定第25-30页
  2.4 讨论第30-32页
    2.4.1 表型数据结果分析第30页
    2.4.2 与前人研究对比第30-31页
    2.4.3 候选基因功能讨论第31-32页
  2.5 小结第32-33页
第三章 呼伦贝尔羊选择信号检测第33-41页
  3.1 试验材料第33页
    3.1.1 主要试验仪器与试剂第33页
  3.2 试验方法第33-35页
    3.2.1 绵羊样品基因组DNA提取与检测第33页
    3.2.2 样品基因型检测第33页
    3.2.3 SNP芯片数据的质量控制第33-34页
    3.2.4 选择信号检测方法第34页
    3.2.5 候选基因的检测和注释第34-35页
    3.2.6 GO分析第35页
  3.3 试验结果第35-38页
    3.3.1 选择信号分析第35页
    3.3.2 候选基因的确定第35-38页
    3.3.3 基因富集分析第38页
  3.4 讨论第38-40页
    3.4.1 可变窗口FST值进行选择信号检测的优势第38-39页
    3.4.2 呼伦贝尔羊品系间差异分析第39页
    3.4.3 与前期研究结果的比较第39页
    3.4.4 脂肪沉积相关基因功能讨论第39-40页
  3.5 小结第40-41页
第四章 全文结论第41-42页
参考文献第42-52页
致谢第52-53页
作者简历第53页

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