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呼伦贝尔羊尾部脂肪性状的全基因组关联分析和选择信号检测
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呼伦贝尔羊尾部脂肪性状的全基因组关联分析和选择信号检测
论文目录
摘要
第1-8页
abstract
第8-13页
第一章 引言
第13-22页
1.1 脂尾性状的研究意义
第13页
1.2 呼伦贝尔羊品种简介
第13-14页
1.3 全基因组关联分析
第14-19页
1.3.1 全基因组关联分析简介
第14页
1.3.2 GWAS在绵羊中的重要性状研究
第14-15页
1.3.3 绵羊重要性状的GWAS分析
第15-18页
1.3.4 GWAS存在问题及展望
第18-19页
1.4 全基因组选择信号检测
第19-21页
1.4.1 选择信号检测简介
第19页
1.4.2 选择信号的检测方法
第19-20页
1.4.3 选择信号在羊上的应用
第20-21页
1.4.4 选择信号检测展望
第21页
1.5 本研究的目的和意义
第21-22页
第二章 呼伦贝尔羊尾部脂肪相关性状全基因组关联分析
第22-33页
2.1 试验材料
第22-23页
2.1.1 试验样品采集
第22页
2.1.2 主要试验仪器与试剂
第22-23页
2.2 试验方法
第23-24页
2.2.1 绵羊样品基因组DNA提取与检测
第23页
2.2.2 样品基因型检测
第23页
2.2.3 SNP芯片数据的质量控制
第23-24页
2.2.4 统计模型图
第24页
2.2.5 候选基因的检测和注释
第24页
2.3 试验结果
第24-30页
2.3.1 表型和基因型数据处理结果
第24-25页
2.3.2 候选基因的确定
第25-30页
2.4 讨论
第30-32页
2.4.1 表型数据结果分析
第30页
2.4.2 与前人研究对比
第30-31页
2.4.3 候选基因功能讨论
第31-32页
2.5 小结
第32-33页
第三章 呼伦贝尔羊选择信号检测
第33-41页
3.1 试验材料
第33页
3.1.1 主要试验仪器与试剂
第33页
3.2 试验方法
第33-35页
3.2.1 绵羊样品基因组DNA提取与检测
第33页
3.2.2 样品基因型检测
第33页
3.2.3 SNP芯片数据的质量控制
第33-34页
3.2.4 选择信号检测方法
第34页
3.2.5 候选基因的检测和注释
第34-35页
3.2.6 GO分析
第35页
3.3 试验结果
第35-38页
3.3.1 选择信号分析
第35页
3.3.2 候选基因的确定
第35-38页
3.3.3 基因富集分析
第38页
3.4 讨论
第38-40页
3.4.1 可变窗口FST值进行选择信号检测的优势
第38-39页
3.4.2 呼伦贝尔羊品系间差异分析
第39页
3.4.3 与前期研究结果的比较
第39页
3.4.4 脂肪沉积相关基因功能讨论
第39-40页
3.5 小结
第40-41页
第四章 全文结论
第41-42页
参考文献
第42-52页
致谢
第52-53页
作者简历
第53页
本篇论文共
53
页,
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。
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