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应用mtDNA和Y染色体基因片段解析梅花鹿种公鹿的母系及父系类型

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应用mtDNA和Y染色体基因片段解析梅花鹿种公鹿的母系及父系类型
论文目录
 
摘要第1-7页
abstract第7-17页
第一章 引言第17-26页
  1.1 梅花鹿分类与资源现状第17-21页
    1.1.1 中国野生梅花鹿分类第17-18页
    1.1.2 中国野生梅花鹿资源现状第18页
    1.1.3 中国家养梅花鹿资源现状第18-20页
    1.1.4 梅花鹿种公鹿选择标准第20-21页
  1.2 动物线粒体DNA与母系起源研究第21-23页
    1.2.1 Cytb基因第21页
    1.2.2 D-loop区第21-22页
    1.2.3 12SrRNA和16SrRNA基因第22页
    1.2.4 线粒体DNA全序列第22-23页
  1.3 动物Y染色体与父系起源研究第23-24页
    1.3.1 Y染色体单核苷酸多态性第23页
    1.3.2 Y染色体微卫星多态性第23-24页
    1.3.3 Y染色体拷贝数变异第24页
    1.3.4 Y染色体多态性和Y染色体微卫星多态性联合第24页
  1.4 母系起源与父系起源联合研究第24-25页
  1.5 本研究的目的意义和研究内容第25-26页
    1.5.1 研究的目的意义第25页
    1.5.2 研究内容第25-26页
第二章 利用mtDNA分析梅花鹿种公鹿的母系类型第26-57页
  2.1 材料与方法第26-28页
    2.1.1 试验样品第26页
    2.1.2 试验试剂与仪器第26页
    2.1.3 梅花鹿种公鹿基因组DNA提取第26-27页
    2.1.4 DNA纯度及浓度检测第27页
    2.1.5 引物设计与合成第27页
    2.1.6 PCR扩增第27页
    2.1.7 PCR扩增产物检测第27页
    2.1.8 序列分析第27-28页
  2.2 结果与分析第28-48页
    2.2.1 梅花鹿种公鹿基因组DNA提取结果第28-29页
    2.2.2 PCR扩增结果第29页
    2.2.3 梅花鹿种公鹿遗传多样性与母系类型分析第29-48页
  2.3 讨论第48-55页
    2.3.1 梅花鹿种公鹿遗传多样性第49页
    2.3.2 梅花鹿种公鹿单倍型多样性第49页
    2.3.3 梅花鹿种公鹿母系类型第49-50页
    2.3.4 13个蛋白质编码基因和D-loop区的结果比较第50页
    2.3.5 梅花鹿种公鹿线粒体序列与NCBI中线粒体序列的比较第50-55页
    2.3.6 梅花鹿种公鹿群体母系的保种建议第55页
  2.4 小结第55-57页
    2.4.1 梅花鹿种公鹿13个蛋白质编码基因和D-loop区序列分析第55-56页
    2.4.2 梅花鹿种公鹿间的遗传距离第56页
    2.4.3 梅花鹿种公鹿遗传多样性分析第56页
    2.4.4 梅花鹿种公鹿系统进化分析第56-57页
第三章 利用Y染色体基因片段分析梅花鹿种公鹿的父系类型第57-76页
  3.1 材料与方法第57-58页
    3.1.1 试验样品第57页
    3.1.2 试验试剂与仪器第57页
    3.1.3 梅花鹿种公鹿基因组DNA提取第57页
    3.1.4 DNA纯度及浓度检测第57页
    3.1.5 引物设计与合成第57-58页
    3.1.6 PCR扩增第58页
    3.1.7 PCR扩增产物检测第58页
    3.1.8 序列分析第58页
  3.2 结果与分析第58-66页
    3.2.1 梅花鹿种公鹿基因组DNA提取结果第58-59页
    3.2.2 PCR扩增结果第59页
    3.2.3 梅花鹿种公鹿遗传多样性与父系类型分析第59-66页
  3.3 讨论第66-68页
    3.3.1 梅花鹿种公鹿遗传多样性第66页
    3.3.2 梅花鹿种公鹿单倍型多样性第66-67页
    3.3.3 梅花鹿种公鹿的父系类型第67页
    3.3.4 梅花鹿群体种公鹿选种选配方案探讨第67-68页
  3.4 小结第68-76页
    3.4.1 梅花鹿种公鹿Y染色体基因序列分析第68页
    3.4.2 梅花鹿种公鹿间的遗传距离第68页
    3.4.3 梅花鹿种公鹿遗传多样性分析第68-69页
    3.4.4 梅花鹿种公鹿系统进化分析第69-76页
第四章 鹿王评比梅花鹿的母系类型和父系类型检测第76-81页
  4.1 试验材料与方法第76-77页
    4.1.1 试验样品第76页
    4.1.2 试剂与仪器第76页
    4.1.3 鹿王评比梅花鹿基因组DNA提取第76页
    4.1.4 DNA纯度及浓度检测第76页
    4.1.5 引物设计与合成第76页
    4.1.6 引物扩增第76页
    4.1.7 PCR扩增产物检测第76-77页
    4.1.8 序列分析第77页
  4.2 结果与分析第77-80页
    4.2.1 基因组DNA提取结果第77页
    4.2.2 Y染色体基因扩增结果第77-78页
    4.2.3 线粒体基因组扩增结果第78页
    4.2.4 母系类型和父系类型检测第78-80页
  4.3 讨论第80页
  4.4 小结第80-81页
第五章 全文结论第81-82页
参考文献第82-87页
致谢第87-88页
作者简历第88页

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