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我国辣椒核心种质评价及其主要园艺性状的全基因组关联分析

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我国辣椒核心种质评价及其主要园艺性状的全基因组关联分析
论文目录
 
摘要第1-7页
abstract第7-12页
英文缩略表第12-13页
第一章 引言第13-19页
  1.1 辣椒园艺性状的研究进展第13-14页
    1.1.1 辣椒的起源与分类第13页
    1.1.2 辣椒园艺性状遗传位点的研究进展第13-14页
    1.1.3 传统QTL定位存在的问题第14页
  1.2 全基因组关联分析第14-17页
    1.2.1 全基因组关联分析的提出第15页
    1.2.2 全基因组关联分析的基本原理和优势第15页
    1.2.3 连锁不平衡的意义和计算方法第15页
    1.2.4 全基因组关联分析基本路线第15-16页
    1.2.5 全基因组关联分析在植物中的应用第16-17页
  1.3 全基因组关联分析在辣椒作物中的应用第17页
  1.4 本研究的目的和技术路线第17-19页
    1.4.1 研究目的第17-18页
    1.4.2 技术路线第18-19页
第二章 我国辣椒核心种质主要园艺性状多样性的分析和评价第19-27页
  2.1 材料与方法第19-21页
    2.1.1 试验材料第19页
    2.1.2 试验方法第19-21页
  2.2 结果与分析第21-25页
    2.2.1 我国辣椒核心种质主要园艺性状的多样性分析第21-23页
      2.2.1.1 质量性状多样性第21-22页
      2.2.1.2 数量性状多样性第22-23页
    2.2.2 我国辣椒核心种质主要园艺性状的聚类分析第23-25页
  2.3 结论与讨论第25-27页
    2.3.1 我国辣椒核心种质主要园艺性状的多样性第25-26页
    2.3.2 我国辣椒核心种质植物学性状的聚类比较第26-27页
第三章 我国辣椒核心种质基于全基因组SNP的群体结构分析第27-34页
  3.1 材料与方法第27-28页
    3.1.1 试验材料第27页
    3.1.2 测序样品的制备第27页
    3.1.3 全基因组高倍重测序第27-28页
    3.1.4 测序数据与参考基因组的比对分析第28页
    3.1.5 我国辣椒核心种质进化树的构建第28页
    3.1.6 我国辣椒核心种质主成分分析第28页
    3.1.7 我国辣椒核心种质群体结构分析第28页
  3.2 结果与分析第28-32页
    3.2.1 全基因组SNPs的鉴定第28-30页
    3.2.2 我国辣椒核心种质群体进化树分析第30-31页
    3.2.3 我国辣椒核心种质群体主成分分析第31页
    3.2.4 我国辣椒核心种质群体结构分析第31-32页
  3.3 讨论第32-34页
    3.3.1 SNP标记的挖掘第32页
    3.3.2 群体结构分析第32-34页
第四章 我国辣椒核心种质主要园艺性状的全基因组关联分析第34-45页
  4.1 材料与方法第34-35页
    4.1.1 试验材料第34页
    4.1.2 主要园艺性状的调查第34页
    4.1.3 全基因组高倍重测序第34页
    4.1.4 连锁不平衡分析第34-35页
    4.1.5 全基因组关联分析第35页
  4.2 结果与分析第35-43页
    4.2.1 表型鉴定第35-36页
    4.2.2 连锁不平衡分析第36页
    4.2.3 主要园艺性状关联分析第36-43页
  4.3 结论与讨论第43-45页
    4.3.1 表型调查相关性的讨论第43页
    4.3.2 连锁不平衡程度第43页
    4.3.3 全基因组关联分析第43-45页
第五章 全文结论第45-46页
参考文献第46-53页
附录第53-65页
致谢第65-66页
作者简历第66页

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