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棉花种质耐碱性鉴定及GhMGL11耐碱基因功能验证

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棉花种质耐碱性鉴定及GhMGL11耐碱基因功能验证
论文目录
 
摘要第1-7页
abstract第7-12页
英文缩略表第12-13页
第一章 引言第13-19页
  1.1 棉花耐碱性鉴定第13-14页
    1.1.1 棉花种质资源研究现状第13页
    1.1.2 土壤盐碱化及盐碱土分类第13-14页
    1.1.3 植物耐盐碱性鉴定第14页
  1.2 棉花耐碱性研究第14-16页
    1.2.1 棉花碱胁迫下变化第15页
    1.2.2 棉花耐碱性机制研究第15-16页
  1.3 新基因挖掘与耐碱相关基因研究第16-18页
    1.3.1 新基因挖掘手段第16-17页
    1.3.2 耐碱基因研究第17-18页
    1.3.3 GhMGL11基因研究现状第18页
  1.4 本研究目的和意义第18-19页
第二章 材料与方法第19-27页
  2.1 陆地棉萌发期耐碱性鉴定第19页
    2.1.1 碱胁迫条件筛选第19页
    2.1.2 种质耐碱性鉴定第19页
  2.2 陆地棉三叶期耐碱性鉴定第19-20页
    2.2.1 碱胁迫条件筛选第19页
    2.2.2 种质耐碱性鉴定第19-20页
  2.3 耐盐碱转录组分析及耐碱候选基因的筛选第20-22页
    2.3.1 供试材料和盐碱胁迫条件第20-21页
    2.3.2 文库构建和RNA-seq第21页
    2.3.3 数据质控和比对、基因差异表达分析第21页
    2.3.4 GO和pathway富集分析第21页
    2.3.5 qRT-PCR验证RNA-seq数据第21-22页
  2.4 GhMGL11耐碱基因克隆和表达分析第22-24页
    2.4.1 目的基因克隆第22-23页
    2.4.2 蛋白理化性质分析第23页
    2.4.3 同源序列分析及进化树分析第23-24页
    2.4.4 荧光定量qRT-PCR分析第24页
  2.5 基因功能的初步验证第24-27页
    2.5.1 植物重组载体的构建及农杆菌转化第24-25页
    2.5.2 pYL156:GhMGL11基因的VIGS沉默及表达量检测第25页
    2.5.3 花絮侵染转化拟南芥及后代检测第25-27页
第三章 结果与分析第27-51页
  3.1 陆地棉萌发期耐碱性鉴定第27-30页
    3.1.1 碱胁迫条件筛选第27-28页
    3.1.2 种质材料的鉴定第28-30页
  3.2 陆地棉三叶期耐碱性鉴定第30-32页
    3.2.1 碱胁迫条件筛选第30-31页
    3.2.2 碱胁迫对陆地棉三叶期根和叶相对含水量影响第31-32页
    3.2.3 碱胁迫对陆地棉三叶期叶片叶绿素含量的影响第32页
  3.3 耐盐碱转录组分析及耐碱候选基因的筛选第32-43页
    3.3.1 不同胁迫下幼苗的表型和生理变化第32-33页
    3.3.2 测序数据质控和比对第33-35页
    3.3.3 盐、碱、盐碱差异基因分析及耐碱基因筛选第35-38页
    3.3.4 差异表达基因GO功能富集分析第38-40页
    3.3.5 差异表达基因KEGG通路注释第40-41页
    3.3.6 盐碱特异差异基因转录因子注释第41-42页
    3.3.7 qRT-PCR验证RNA-seq数据第42-43页
  3.4 GhMGL11耐碱基因克隆和表达量分析第43-47页
    3.4.1 GhMGL11基因克隆第43-44页
    3.4.3 GhMGL11基因的序列同源性和系统进化分析第44-45页
    3.4.4 陆地棉中GhMGL11基因的序列同源性和系统进化分析第45-46页
    3.4.5 GhMGL11荧光定量qRT-PCR分析第46-47页
  3.5 GhMGL11基因的初步功能验证第47-51页
    3.5.1 植物pYL156:GhMGL11、pBI121:GhMGL11重组载体的构建第47-48页
    3.5.2 VIGS侵染与基因表达量检测第48页
    3.5.4 拟南芥转基因检测第48-49页
    3.5.5 拟南芥转基因种子萌发期耐碱性检测第49页
    3.5.6 拟南芥转基因植株耐碱性检测第49-51页
第四章 讨论第51-53页
  4.1 棉花耐盐与耐碱转录组比较分析第51-52页
  4.2 棉花GhMGL11基因功能分析第52-53页
第五章 全文总结第53-54页
参考文献第54-60页
致谢第60-61页
作者简历第61页

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