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基于转录组的甘蓝型油菜硫苷含量关联分析

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基于转录组的甘蓝型油菜硫苷含量关联分析
论文目录
 
摘要第1-7页
abstract第7-11页
英文缩略表第11-12页
第一章 引言第12-20页
  1.1 硫苷的合成与调控第12-16页
    1.1.1 侧链的延长第12-13页
    1.1.2 硫苷核心结构的合成第13-14页
    1.1.3 二次修饰第14-15页
    1.1.4 硫苷的降解代谢第15-16页
    1.1.5 硫苷代谢的调控因子第16页
    1.1.6 硫苷的转运第16页
  1.2 硫苷的功能及毒害作用第16-17页
  1.3 关联分析的研究进展第17-19页
    1.3.1 全基因组关联分析在植物中的应用第17-18页
    1.3.2 转录组关联分析的优越性及进展第18-19页
  1.4 硫苷在油菜中的定位分析进展第19页
  1.5 本研究目的和意义第19-20页
第二章 甘蓝型油菜种子和角果皮硫苷含量的动态变化及转录组关联分析第20-33页
  2.1 材料与方法第20-22页
    2.1.1 实验材料及样品采集第20-21页
    2.1.2 硫苷检测方法第21页
    2.1.3 转录组测序及SNP和GEM的检测第21页
    2.1.4 SNP关联分析第21页
    2.1.5 GEM关联分析第21-22页
  2.2 结果与分析第22-30页
    2.2.1 不同组织硫苷含量的动态变化第22-24页
    2.2.2 SNP关联分析第24-26页
    2.2.3 GEM关联分析第26-28页
    2.2.4 不同标记关联分析比较第28-29页
    2.2.5 候选基因的预测第29-30页
  2.3 讨论第30-33页
    2.3.1 转录组关联分析的优越性第30-31页
    2.3.2 硫苷动态分析第31页
    2.3.3 不同时期及不同部位硫苷的候选基因第31-33页
第三章 甘蓝型油菜种子硫苷含量及组成的转录组关联分析第33-49页
  3.1 材料与方法第33-34页
    3.1.1 实验材料及样品采集第33页
    3.1.2 硫苷检测方法第33页
    3.1.3 转录组测序及SNP和GEM的检测第33页
    3.1.4 SNP关联分析第33-34页
    3.1.5 GEM关联分析第34页
    3.1.6 加权共表达网络分析第34页
    3.1.7 GO功能富集分析第34页
  3.2 结果与分析第34-47页
    3.2.1 甘蓝型油菜种子硫苷含量和组成的变异及相关性分析第34-35页
    3.2.2 SNP关联分析第35-38页
    3.2.3 GEM关联分析第38-41页
    3.2.4 候选基因预测第41-42页
    3.2.5 转录组关联分析的验证第42-44页
    3.2.6 加权共表达网络分析第44-47页
  3.3 讨论第47-49页
    3.3.1 三类硫苷的转录组关联分析第47-48页
    3.3.2 硫苷侧链修饰的转录组关联分析第48-49页
第四章 全文结论第49-50页
参考文献第50-60页
附录第60-62页
致谢第62-63页
作者简历第63页

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