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陆地棉野生种系基于转录组与代谢组学抗旱分子机制研究

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陆地棉野生种系基于转录组与代谢组学抗旱分子机制研究
论文目录
 
摘要第1-6页
abstract第6-10页
英文缩略表第10-11页
第一章 引言第11-16页
  1.1 干旱胁迫对植物的影响第11-12页
    1.1.1 干旱胁迫对植物形态的影响第11-12页
    1.1.2 干旱胁迫对植物抗氧化保护系统影响第12页
    1.1.3 干旱胁迫对植物光合作用的影响第12页
    1.1.4 干旱对棉花的影响第12页
  1.2 植物对干旱的响应机制第12-13页
  1.3 转录组研究现状第13-14页
  1.4 代谢组学研究现状第14-15页
  1.5 本研究的目的和意义第15-16页
第二章 干旱胁迫下陆地棉野生种系抗旱材料的筛选第16-22页
  2.1 材料与方法第16-18页
    2.1.1 实验材料第16页
    2.1.2 培养室鉴定半野生棉材料抗旱性方法第16-17页
    2.1.3 干旱胁迫下半野生棉材料抗旱性初筛第17-18页
    2.1.4 对初筛的抗感材料进行复筛第18页
  2.2 结果与分析第18-20页
  2.3 讨论第20-22页
第三章 陆地棉野生种系干旱胁迫转录组分析第22-38页
  3.1 实验材料第22页
  3.2 实验方法第22-24页
    3.2.1 实验材料的种植及取样方法第22-23页
    3.2.2 RNA提取第23页
    3.2.3 RNA的质量检测与要求第23页
    3.2.4 转录组文库构建第23-24页
    3.2.5 原始数据的处理第24页
    3.2.6 差异基因的筛选及功能富集分析第24页
  3.3 结果与分析第24-37页
    3.3.1 转录组测序数据分析第24-26页
    3.3.2 Clean reads比对分析第26-27页
    3.3.3 差异表达基因分析第27-29页
    3.3.4 荧光定量验证转录组数据准确性第29-30页
    3.3.5 差异基因表达趋势分析第30-31页
    3.3.6 GO功能富集分析第31-34页
    3.3.7 KEGG功能富集分析第34-35页
    3.3.8 谷胱甘肽代谢、黄酮类合成、萜类生物合成的差异表达基因第35-37页
  3.4 讨论第37-38页
第四章 陆地棉野生种系干旱胁迫代谢组分析及关联分析第38-49页
  4.1 实验材料第38页
  4.2 实验方法第38-39页
    4.2.1 代谢物提取第38-39页
    4.2.2 代谢物检测第39页
    4.2.3 代谢物数据分析第39页
  4.3 结果与分析第39-46页
    4.3.1 代谢组检测分析第39-41页
    4.3.2 差异代谢物分析第41-42页
    4.3.3 KEGG富集分析第42-43页
    4.3.4 转录组和代谢组关联分析第43-46页
  4.4 讨论第46-49页
第五章 全文结论第49-50页
参考文献第50-56页
附录第56-65页
致谢第65-66页
作者简历第66页

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