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一个新的棉花矮化突变体基因的精细定位及功能初步验证

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一个新的棉花矮化突变体基因的精细定位及功能初步验证
论文目录
 
摘要第1-6页
abstract第6-10页
英文缩略表第10-12页
第一章 引言第12-19页
  1.1 植物矮化第12-14页
    1.1.1 植物矮化与赤霉素(GA)第12-14页
    1.1.2 植物矮化与油菜素内脂(BR)第14页
    1.1.3 生长素(IAA)与植物矮化第14页
  1.2 棉花矮化资源及其国内外研究进展第14-15页
  1.3 一个新的矮化突变体的发现第15页
  1.4 分子标记与基因定位第15-17页
    1.4.1 分子标记的类型第15-17页
    1.4.2 QTL-seq,基因定位的新方法第17页
  1.5 本研究的目的及意义第17-19页
第二章 材料与方法第19-33页
  2.1 试验材料第19页
  2.2 试验方法第19-33页
    2.2.1 田间采样及性状调查第19-20页
    2.2.2 配制提取棉花基因组DNA的溶液第20-21页
    2.2.3 提取棉花基因组DNA第21-22页
    2.2.4 利用BSA(BulkedSegregantAnalysis)对初定位区间进行验证第22页
    2.2.5 棉花组织总RNA的提取第22-23页
    2.2.6 cDNA的合成第23-24页
    2.2.7 候选基因的qRT-PCR分析第24-25页
    2.2.8 InDel标记的开发及群体基因分型第25-27页
    2.2.9 遗传连锁图谱的构建及基因定位第27页
    2.2.10 候选区段Bam文件重分析及新的候选基因的发现第27页
    2.2.11 候选基因表达量的分析第27页
    2.2.12 候选基因克隆第27-31页
    2.2.13 VIGS对候选基因功能进行验证第31-33页
第三章 结果分析第33-43页
  3.1 性状调查第33页
  3.2 BSA(BulkedSegregantAnalysis)基因定位第33-35页
  3.3 候选基因的差异表达量分析第35-36页
  3.4 SSR和InDel标记对候选区间加密实现精细定位第36-38页
  3.5 候选区段串联重复的发现及验证第38-39页
  3.6 新的候选基因的发现及定量分析结果第39页
  3.7 VIGS验证结果第39-43页
第四章 讨论第43-45页
  4.1 矮化突变体AS98遗传分析第43页
  4.2 AS98基因的定位分析第43页
    4.2.1 测序结果与初定位第43页
    4.2.2 精细定位第43页
  4.3 AS98基因组拷贝数变异(Copynumbervariations,CNVS)与其表型的关系第43-44页
  4.4 本研究的应用第44-45页
第五章 全文结论第45-46页
参考文献第46-51页
致谢第51-52页
作者简历第52页

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