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水稻种子发育相关的lncRNAs的鉴定及其功能研究

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水稻种子发育相关的lncRNAs的鉴定及其功能研究
论文目录
 
摘要第1-7页
abstract第7-12页
第一章 前言第12-22页
  1.1 植物长链非编码RNA的概述第12-14页
  1.2 植物长链非编码RNA的主要作用第14-18页
    1.2.1 植物长链非编码RNA作为sRNA的前体第14页
    1.2.2 植物长链非编码RNA作为miRNA的伪靶标第14-15页
    1.2.3 植物长链非编码RNA与春化作用第15-16页
    1.2.4 植物长链非编码RNA与光形态建成第16页
    1.2.5 植物长链非编码RNA与植物育性第16-17页
    1.2.6 植物长链非编码RNA与逆境调控第17-18页
  1.3 植物长链非码RNA主要的数据库第18页
  1.4 水稻种子发育研究进展第18-20页
    1.4.1 水稻粒形的研究第18-19页
    1.4.2 水稻胚乳的研究第19页
    1.4.3 垩白形成的研究第19-20页
    1.4.4 温度对水稻种子发育的影响第20页
  1.5 本研究的目的和意义第20-22页
第二章 种子发育相关的长链非编码RNA的鉴定第22-32页
  2.1 实验材料第22页
  2.2 实验方法第22-26页
    2.2.1 lncRNA生物信息学分析第22页
    2.2.2 lncRNA半定量引物设计第22页
    2.2.3 常规PCR反应第22-23页
    2.2.4 水稻组织RNA提取第23页
    2.2.5 cDNA第一链的合成第23-24页
    2.2.6 半定量PCR第24页
    2.2.7 荧光定量PCR第24页
    2.2.8 Gateway技术构建RNAi载体第24-25页
    2.2.9 遗传转化第25-26页
    2.2.10 转基因植株阳性鉴定第26页
  2.3 结果与分析第26-31页
    2.3.1 胚乳特异表达的lncRNA第26-27页
    2.3.2 转基因植株阳性检测结果第27页
    2.3.3 转基因T0代表达量检测第27-28页
    2.3.4 转基因考种分析第28-31页
  2.4 小结与讨论第31-32页
第三章 温度调控种子发育过程中的lncRNA组学研究第32-43页
  3.1 实验材料第32页
  3.2 实验方法第32-34页
    3.2.1 温度处理第32页
    3.2.2 种子粒长、粒宽、粒厚及粒重测定第32页
    3.2.3 种子自然横断面扫描电镜观察第32页
    3.2.4 种子总淀粉含量测定第32-33页
    3.2.5 直链淀粉含量测定第33页
    3.2.6 蛋白质含量测定第33页
    3.2.7 DSC测定第33-34页
    3.2.8 RNA文库构建及测序第34页
    3.2.9 lncRNA的鉴定及其差异表达分析第34页
    3.2.10 lncRNA靶基因的预测第34页
  3.3 结果与分析第34-41页
    3.3.1 高温处理影响宁粳1号稻米品质第34-35页
    3.3.2 全基因组lncRNA的鉴定第35-36页
    3.3.3 lncRNA的结构特征第36-37页
    3.3.4 lncRNA的差异表达分析第37-38页
    3.3.5 lncRNA的靶功能分析第38-40页
    3.3.6 mRNA差异表达分析第40-41页
  3.4 小结与讨论第41-43页
第四章 全文结论第43-44页
参考文献第44-50页
附录第50-52页
致谢第52-53页
作者简历第53页

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