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烟草抗青枯病突变体的鉴定与转录组分析

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烟草抗青枯病突变体的鉴定与转录组分析
论文目录
 
摘要第1-7页
abstract第7-15页
第一章 引言第15-22页
  1.1 烟草青枯病概况第15-17页
    1.1.1 烟草青枯病的分布范围及危害第15页
    1.1.2 病害症状第15-16页
    1.1.3 病原特性及菌种分化第16页
    1.1.4 致病机理及发生规律第16-17页
  1.2 烟草青枯病的综合防治第17-18页
    1.2.1 农业防治第17页
    1.2.2 生物防治第17页
    1.2.3 化学防治第17-18页
    1.2.4 选育抗青枯病烟草品种第18页
  1.3 突变体的创制以及作用第18-19页
    1.3.1 突变体库的创制第18-19页
    1.3.2 突变体库的作用第19页
  1.4 转录组测序技术的原理和应用第19-20页
    1.4.1 转录组测序的原理第19-20页
    1.4.2 转录组测序在植物育种研究中的应用第20页
  1.5 本研究的目的、意义以及技术路线第20-22页
    1.5.1 本研究的目的和意义第20-21页
    1.5.2 技术路线第21-22页
第二章 福建和安徽宣城烟草青枯病菌菌系分化研究第22-25页
  2.1 试验材料第22页
    2.1.1 植物材料第22页
    2.1.2 供试培养基第22页
    2.1.3 主要仪器与试剂第22页
  2.2 试验方法第22-24页
    2.2.1 青枯菌的分离第22-23页
    2.2.2 纯化和保存第23页
    2.2.3 测定菌株对3种双糖和3种己醇的利用能力第23页
    2.2.4 青枯菌生化型划分标准第23-24页
  2.3 结果与分析第24页
    2.3.1 菌株对3种双糖和3种已醇的利用结果第24页
  2.4 讨论第24-25页
第三章 烟草抗青枯病室内接种鉴定体系的确立第25-30页
  3.1 试验材料第25页
    3.1.1 植物材料与菌株第25页
    3.1.2 供试培养基第25页
    3.1.3 主要仪器和试剂第25页
  3.2 试验方法第25-26页
    3.2.1 青枯病菌悬液的制备与特异性检测第25-26页
    3.2.2 最适接种菌液浓度和调查天数探索第26页
    3.2.3 病情统计标准第26页
  3.3 结果与分析第26-28页
    3.3.1 青枯病菌悬液特异性检测第26-27页
    3.3.2 抗青枯病突变体的室内接种鉴定体系的确立第27-28页
  3.4 讨论第28-30页
第四章 抗青枯病突变体的接种鉴定第30-35页
  4.1 试验材料第30-31页
    4.1.1 植物材料与菌株第30页
    4.1.2 供试培养基第30页
    4.1.3 主要仪器和试剂第30-31页
  4.2 试验方法第31页
    4.2.1 抗青枯病突变体的室内鉴定第31页
    4.2.2 自然病圃的抗病表现进行比较与统计学分析第31页
    4.2.3 抗病基因的遗传分析第31页
  4.3 结果与分析第31-33页
    4.3.1 抗青枯病突变体的伤根浸泡法室内接种鉴定第31-33页
    4.3.2 抗青枯病突变体的室内接种抗病性和自然病圃抗病性的相关分析第33页
    4.3.3 抗性遗传分析第33页
  4.4 讨论第33-35页
第五章 烟草抗青枯病突变体侵染的转录组分析和差异基因表达分析第35-51页
  5.1 试验材料第35页
    5.1.1 试验材料与菌株第35页
    5.1.2 主要仪器与试剂第35页
  5.2 实验方法第35-39页
    5.2.1 RNA的提取第35-36页
    5.2.2 转录组文库构建与测序分析第36-37页
    5.2.3 序列的过滤以及组装第37页
    5.2.4 Unigene的功能注释和功能分类第37页
    5.2.5 差异表达基因qRT-PCR验证第37-39页
  5.3 结果与分析第39-49页
    5.3.1 转录组测序产量统计以及质量评价第39-40页
    5.3.2 转录组测序结果比对统计第40-41页
    5.3.3 样品间共有表达基因及特异表达基因分析第41-44页
    5.3.4 差异表达基因GO分析第44-46页
    5.3.5 KEGG代谢通路分析第46-47页
    5.3.6 候选抗性基因在抗感材料中的表达第47-49页
  5.4 讨论第49-51页
第六章 全文结论第51-53页
  6.1 结论第51-52页
  6.2 创新点第52页
  6.3 工作展望第52-53页
参考文献第53-61页
附表第61-63页
致谢第63-64页
作者简历第64页

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