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菊花表型性状与SSR、SCoT分子标记的关联分析

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菊花表型性状与SSR、SCoT分子标记的关联分析
论文目录
 
摘要第1-6页
ABSTRACT第6-11页
1 文献综述第11-19页
  1.1 菊花育种现状以及存在的问题第11-12页
    1.1.1 菊花的简介第11-12页
  1.2 菊花的传统育种第12-14页
    1.2.1 引种第12页
    1.2.2 杂交育种第12-13页
    1.2.3 芽变育种第13页
    1.2.4 组织培养育种第13页
    1.2.5 辐射育种第13-14页
  1.3 菊花的现代育种第14-15页
    1.3.1 细胞工程育种第14页
    1.3.2 基因工程育种第14页
    1.3.3 分子标记辅助育种第14-15页
  1.4 关联分析第15-18页
    1.4.1 SSR分子标记第17页
    1.4.2 SCoT分子标记第17-18页
  1.5 本研究的目的及意义第18-19页
2 SSR引物开发第19-27页
  2.1 材料方法第19-23页
    2.1.1 实验材料第19页
    2.1.2 实验方法第19-23页
  2.2 结果第23-26页
    2.2.1 扩增条件优化第23页
    2.2.2 SSR引物筛选第23-25页
    2.2.3 菊花SSR引物遗传多样性第25-26页
  2.3 讨论第26页
  2.4 小结第26-27页
3 基于SSR引物的关联分析第27-41页
  3.1 材料与方法第27-28页
    3.1.1 实验材料第27页
    3.1.2 实验方法第27-28页
  3.2 数据处理第28-29页
    3.2.1 表型数据处理第28-29页
    3.2.2 SSR标记条带统计及处理第29页
    3.2.3 群体结构分析第29页
    3.2.4 LD衡量与关联分析第29页
  3.3 结果第29-37页
    3.3.1 菊花品种表型性状的变异分析第29-31页
    3.3.2 表型性状的主成分分析第31-32页
    3.3.3 SSR聚类分析第32-34页
    3.3.4 群体结构分析第34-35页
    3.3.5 连锁不平衡分析第35-36页
    3.3.6 数量性状与SSR标记的关联分析第36-37页
  3.4 讨论第37-40页
    3.4.1 实验材料的选择第37-38页
    3.4.2 菊花表型分析第38-39页
    3.4.3 对分子标记的选择第39页
    3.4.4 基于SSR标记的群体结构第39页
    3.4.5 SSR标记的数量性状的关联分析第39-40页
  3.5 小结第40-41页
4 基于SCoT引物的关联分析第41-53页
  4.1 材料与方法第41-42页
    4.1.1 实验材料第41页
    4.1.2 实验方法第41-42页
  4.2 数据处理第42-43页
    4.2.1 对表型数据处理第42页
    4.2.2 SCoT标记条带统计及处理第42页
    4.2.3 SCoT标记群体结构分析第42-43页
    4.2.4 LD衡量与关联分析第43页
  4.3 结果第43-50页
    4.3.1 表型性状的变异分析第43页
    4.3.2 主成分分析第43页
    4.3.3 SCoT标记分析第43-45页
    4.3.4 SCoT标记UPGMA聚类分析第45-46页
    4.3.5 SCoT标记的群体结构分析第46-47页
    4.3.6 连锁不平衡分析第47-48页
    4.3.7 数量性状与SCo T标记的关联分析第48-50页
  4.4 讨论第50-51页
    4.4.1 分子标记的选择第50页
    4.4.2 基于SCoT标记的群体结构分析第50-51页
    4.4.3 SCoT标记的数量性状的关联分析第51页
  4.5 小结第51-53页
5 结论第53-55页
参考文献第55-61页
致谢第61-63页
攻读学位期间发表的学术论文目录第63-64页

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