G蛋白偶联受体—配体计算对接研究

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G蛋白偶联受体—配体计算对接研究

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G蛋白偶联受体—配体计算对接研究

论文目录
摘要	第1-5页
Abstract	第5-12页
第一章引言	第12-18页
· 课题背景	第12-15页
· 研究内容	第15页
· 研究意义	第15-16页
· 本文组织结构	第16-18页
第二章 GPCR―配体计算对接技术概述	第18-30页
· GPCR的结构与功能	第18-19页
· 蛋白质结构及其面向计算机的描述	第19-22页
· 蛋白质结构	第19-20页
· 面向计算机的蛋白质表示方法	第20-22页
· 蛋白质小分子对接	第22-24页
· RosettaLigand蛋白质―配体对接系统建模	第24-29页
· 蛋白质―配体对接系统表示	第24-25页
· 对接过程	第25-27页
· 能量函数	第27-29页
· 本章小结	第29-30页
第三章基于SVR的复合物近天然构象分辨方法	第30-40页
· 引言	第30-31页
· 方法和材料	第31-36页
· SVR 基本原理	第31-32页
· 数据集构造	第32-33页
· 特征选取	第33-34页
· SVR训练	第34-36页
· 结果与分析	第36-39页
· 比较PLRMSD和LRMSD	第36-37页
· 比较基于SVR的方法与RosettaLigand方法	第37页
· 分析	第37-39页
· 本章小结	第39-40页
第四章 GPCR―配体对接过程中的受体柔性支持技术	第40-52页
· 引言	第40-41页
· 局部柔性支持	第41-47页
· 对接过程中的GPCR柔性建模	第41-42页
· 引进受体柔性的对接算法	第42页
· 实验数据来源	第42-43页
· 比较LRMSD	第43-46页
· 受体柔性效果	第46-47页
· 全局柔性支持	第47-49页
· 多受体构象对接方法	第47-48页
· 实验设计与比较策略	第48-49页
· 结果与分析	第49页
· 本章小结	第49-52页
第五章总结与展望	第52-54页
· 工作总结	第52-53页
· 研究展望	第53-54页
参考文献	第54-58页
发表文章目录及科研项目	第58-59页
致谢	第59-60 页

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