蛋白质结构柔性的计算建模研究

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蛋白质结构柔性的计算建模研究

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蛋白质结构柔性的计算建模研究

论文目录
摘要	第1-5页
Abstract	第5-11页
第一章引言	第11-17页
· 课题背景	第11-12页
· 研究现状	第12-13页
· 课题内容	第13-14页
· 研究意义	第14-15页
· 本文的组织结构	第15-17页
第二章蛋白质结构柔性建模概述	第17-27页
· 蛋白质结构柔性介绍	第17-18页
· 蛋白质结构柔性的面向计算机的表达	第18-20页
· 侧链残基旋转异构体替换	第18-20页
· 骨架残基扭转角的重定位	第20页
· 蛋白质结构柔性的一般建模方法	第20-22页
· Backrub运动模型	第22-23页
· 蛋白质点突变简介	第23-24页
· GPCR-Ligand对接简介	第24-26页
· G蛋白偶联受体简介	第24-25页
· GPCR-Ligand对接简介	第25-26页
· 本章小结	第26-27页
第三章基于Backrub的柔性并行建模技术	第27-41页
· 问题描述	第27-28页
· 打分函数	第28页
· 融合并行扰动后多构象的柔性建模技术	第28-34页
· 建模描述	第28-30页
· 模型测试	第30-31页
· 能量结果比较	第31-32页
· 侧链χ角度的比较	第32-33页
· 突变残基的构象比较	第33-34页
· 并行扰动单构象的柔性建模技术	第34-40页
· 建模描述	第34-36页
· 模型测试	第36页
· 运行时间比较	第36-37页
· 侧链χ角度的比较	第37-40页
· 本章小结	第40-41页
第四章柔性建模在GPCR-Ligand对接中的应用	第41-49页
· GPCR-Ligand对接的重要性	第41-42页
· 柔性在对接中的重要性和难点	第42-43页
· GPCR柔性的实现	第43-45页
· GPCR-Ligand对接中柔性的体现	第45-47页
· 本章小结	第47-49页
第五章总结与展望	第49-52页
· 工作总结	第49-50页
· 研究展望	第50-52页
参考文献	第52-60页
发表文章目录及科研项目	第60-61页
致谢	第61-62 页

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