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家蚕TIME-EA4进化及昼夜节律生物钟基因的克隆、进化和反馈环路研究

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家蚕TIME-EA4进化及昼夜节律生物钟基因的克隆、进化和反馈环路研究
论文目录
 
中文摘要第1-7页
Abstract第7-15页
第一章 文献综述第15-37页
  1 昆虫滞育的研究进展第15-19页
    · 昆虫滞育的诱导因素第15-16页
    · 昆虫滞育的生理生化基础第16-18页
    · 昆虫滞育的激素调节作用第18-19页
    · 昆虫滞育的解除第19页
  2 家蚕滞育发育生物钟蛋白时间间隔测定酶TIME-EA4 的研究进展第19-24页
    · 家蚕Time-ea4 的基因与蛋白结构第19-22页
    · 家蚕TIME-EA4 的分子测时机制第22-23页
    · 本研究室关于家蚕TIME-EA4 的研究历史第23-24页
  3 超氧化物歧化酶(Superoxide Dismutase,SOD)家族的进化研究第24-26页
    · SOD 家族的分类与分布第24-25页
    · SOD 家族基因的结构特征与分子进化第25-26页
  4 昼夜节律生物钟相关基因第26-29页
    · 隐花色素基因(Cryptochrome, Cry)第26-27页
    · 周期蛋白基因(Period, Per)第27-28页
    · 永恒蛋白基因(Timeless, Tim1)和逾时蛋白基因(Timeout, Tim2)第28页
    · 时钟蛋白基因(Clock,Clk)第28-29页
    · 周期循环蛋白基因(Cycle,Cyc)和Bmal 基因第29页
    · 旋转蛋白基因(Vrille,Vri)第29页
    · Pdp 基因(PAR domain protein)第29页
  5 昼夜节律生物钟分子机制第29-35页
    · 哺乳动物昼夜节律生物钟分子机制第29-31页
    · 昆虫昼夜节律生物钟分子机制第31-35页
  6 家蚕滞育发育生物钟TIME-EA4 与昼夜节律生物钟研究前景展望第35-37页
第二章 家蚕TIME-EA4 是起源于Cu/Zn SOD 的新型酯酶第37-62页
  第一节 家蚕Time-ea4 同源基因Time-likes 的数据库信息挖掘与克隆第37-44页
    1 材料与方法第37-40页
      · 数据资料第37-38页
      · 生物信息学分析工具第38-39页
      · 方法第39-40页
    2 结果与分析第40-42页
      · Time-likes 的数据库信息挖掘与克隆结果分析第40-41页
      · 昆虫物种TIME-likes 蛋白是有别于自身Cu/Zn SOD 的蛋白第41页
      · Time-likes 的电子表达谱分析第41-42页
    3 结论第42-44页
  第二节 家蚕TIME-EA4 的进化踪迹分析第44-51页
    1 材料与方法第44-45页
      · 数据资料第44-45页
      · 方法第45页
    2 结果与分析第45-50页
      · 蛋白序列比对结果第45页
      · 进化踪迹分析结果第45-50页
    3 讨论第50-51页
  第三节 TIME-EA4/TIME-likes, Cu/Zn SOD 和酯酶系统发生学分析第51-59页
    1 材料与方法第51-53页
      · 数据资料第51-53页
      · 方法第53页
    2 结果与分析第53-58页
      · MOTIFS 分析结果第53-55页
      · 序列特征位点比较第55-56页
      · 聚类分析第56-58页
    3 结论第58-59页
  第四节 本章结论第59-62页
第三章 家蚕昼夜节律生物钟相关基因的克隆、进化和反馈环路整合第62-108页
  第一节 家蚕Bmcry1 和Bmcry2 的基因克隆、全基因结构分析及染色体定位第62-75页
    1 材料与方法第62-66页
      · 材料第62-64页
      · 生物信息学分析工具第64页
      · 方法第64-66页
    2 结果与分析第66-74页
      · 家蚕Bmcry1 和Bmcry2 基因全长cDNA 克隆第66-70页
      · 家蚕Bmcry1 和Bmcry2 的全基因结构及染色体定位第70-73页
      · 家蚕Bmcry1 和Bmcry2 基因和蛋白在NCBI 登录第73-74页
    3 讨论第74-75页
  第二节 家蚕BmCRY1 和BmCRY2 蛋白的序列分析、空间建模及表面电荷分布第75-81页
    1 方法第75-76页
      · 数据资料第75页
      · 蛋白序列分析第75页
      · 蛋白质的同源建模及表面电荷分析第75-76页
    2 结果与分析第76-80页
      · 家蚕BmCRY1 和BmCRY2 蛋白序列分析第76-77页
      · 家蚕BmCRY1 和BmCRY2 蛋白空间结构预测第77-80页
    3 讨论第80-81页
  第三节 昆虫CRY 蛋白的分子进化分析第81-88页
    1 材料与方法第81-82页
      · 数据资料第81-82页
      · 蛋白序列分析第82页
      · 分子系统进化分析第82页
    2 结果与分析第82-87页
      · 昆虫CRY 蛋白序列的同源性第82-83页
      · 昆虫CRY 蛋白序列的特征分析第83-84页
      · 昆虫CRY 蛋白序列的功能域保守性第84-85页
      · 家蚕BmCRY1 和BmCRY2 的分子系统进化第85-87页
    3 讨论第87-88页
  第四节 家蚕昼夜节律相关基因的克隆、基因结构和芯片表达谱分析第88-94页
    1 材料与方法第88-89页
      · 数据资料第88-89页
      · 序列和染色体定位分析第89页
      · 芯片表达谱分析第89页
    2 结果与分析第89-93页
      · 确定和克隆家蚕中可能存在的昼夜节律生物钟基因第89-90页
      · 芯片检测表达谱分析第90页
      · 染色体定位和基因结构分析第90-93页
    3 讨论第93-94页
  第五节 家蚕昼夜节律生物钟基因进化分析和基因反馈环路初步整合第94-105页
    1 材料与方法第94-97页
      · 数据资料第94-96页
      · 蛋白序列分析第96页
      · 分子系统进化分析第96-97页
    2 结果与分析第97-103页
      · 家蚕昼夜节律生物钟蛋白的功能域及基序位点第97-99页
      · 系统发生关系第99-102页
      · 家蚕昼夜节律生物钟基因网络的初步整合第102-103页
    3 讨论第103-105页
  第六节 本章结论第105-108页
    1 家蚕具有两类昼夜节律核心钟基因Bmcry1 与Bmcry2第105-106页
    2 家蚕昼夜节律生物钟基因的挖掘与反馈环路的初步整合第106-108页
参考文献第108-122页
研究生期间发表文章第122-123页
研究生期间登录的基因第123-124页
论文资助项目第124-125页
附录第125-136页
致谢第136-137 页

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