棉花隐性光子基因的定位及转录组表达差异分析

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棉花隐性光子基因的定位及转录组表达差异分析

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棉花隐性光子基因的定位及转录组表达差异分析

论文目录
摘要	第1-8页
ABSTRACT	第8-10页
主要缩略词表	第10-11页
第一部分文献综述	第11-23页
第一章棉纤维发育突变体的研究进展	第11-17页
1 棉纤维发育相关基因	第11-12页
2 棉花纤维发育相关突变体的遗传研究	第12-15页
· 棉纤维突变体遗传研究方法	第12-13页
· 光子突变体的遗传研究	第13-15页
3 光子棉育种	第15-16页
4 光子棉的杂种优势利用	第16-17页
第二章转录组测序技术及其应用	第17-22页
1 测序技术的发展	第17-18页
· 第一代测序技术	第17页
· 第二代测序技术	第17-18页
2 转录组学与转录组测序	第18-22页
· 转录组学研究进展	第18-19页
· 转录组测序技术及其应用	第19-21页
· RNA-Seq的应用领域	第21页
· RNA-Seq面临的挑战	第21页
· RNA-seq常见问题	第21-22页
本文研究目的意义	第22-23页
第二部分研究报告	第23-63页
第三章棉花隐性光子基因n_2的分子定位	第23-33页
1 材料与方法	第24-28页
· 实验材料及群体构建	第24页
· 性状调查	第24-25页
· 棉花DNA的提取	第25-27页
· SSR引物的来源与标记分析	第27-28页
· 分离比检测	第28页
· 标记基因型数据收集和图谱的构建	第28页
2 结果与分析	第28-31页
· 棉花光子性状的遗传分析	第28-29页
· 隐性光子基因n_2的分子定位	第29-31页
3 讨论	第31-33页
· 棉花光子性状的遗传	第31页
· 隐性光子基因n_2的染色体安排及遗传模式	第31页
· n_2基因的精细定位和候选基因的预测	第31-32页
· 下一步研究思路	第32-33页
第四章亚洲棉种重组自交系转录组表达差异分析	第33-63页
1 材料与方法	第33-47页
· 供试材料	第33-34页
· 方法	第34-36页
· 总RNA样品质量检测	第36-38页
· 测序cDNA文库的构建	第38-42页
· Illumina HiSeq 2000上机测序	第42-43页
· 实时定量荧光PCR	第43-45页
· 生物信息学分析	第45-47页
2 结果与分析	第47-60页
· 测序RNA样品的提取与检测	第47-48页
· 测序cDNA文库构建	第48-49页
· 测序原始数据质量评估及预处理	第49-54页
· 转录组de novo拼接	第54-55页
· 转录组数据差异比较分析	第55-57页
· 表达模式聚类分析	第57-58页
· 差异表达基因的功能富集分析	第58-60页
· 定位区段附近差异表达的基因	第60页
3 讨论	第60-63页
· 实验材料的选择	第60-61页
· 转录组测序实验的实验设计	第61页
· 转录组测序分析流程	第61-62页
· 棉花短绒纤维初始发育的表达调控机制	第62页
· 下一步研究思路	第62-63页
全文结论	第63-65页
参考文献	第65-71页
致谢	第71页

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