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多胺代谢相关蛋白ODC&OAZ复合物的结构生物学研究

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多胺代谢相关蛋白ODC&OAZ复合物的结构生物学研究
论文目录
 
致谢第1-6页
摘要第6-7页
Abstract第7-8页
目次第9-12页
1 前言第12-27页
    1.1 多胺的简介及研究进展第12-15页
        1.1.1 什么是多胺第12页
        1.1.2 多胺的功能第12-13页
        1.1.3 多胺的代谢第13-15页
        1.1.4 多胺代谢与肿瘤治疗第15页
    1.2 鸟氨酸脱羧酶(ornithine decarboxylase,ODC)第15-18页
        1.2.1 ODC的基本表述第15-16页
        1.2.2 ODC的结构研究第16-18页
    1.3 抗酶蛋白(antizyme,OAZ)第18-23页
        1.3.1 OAZ的基本表述第18-19页
        1.3.2 OAZ的种类第19-20页
        1.3.3 OAZ的核糖体移码现象第20-21页
        1.3.4 OAZ的功能第21-22页
        1.3.5 OAZ的研究进展第22-23页
        1.3.6 OAZ的结构研究第23页
    1.4 鸟氨酸脱羧酶抗酶蛋白抑制因子(antizyme inhibitor,OAZI)第23-24页
    1.5 多胺在体内代谢第24页
    1.6 此项研究的意义第24-27页
2 材料第27-33页
    2.1 菌株和质粒第27页
    2.2 主要化学和生物试剂第27页
    2.3 主要仪器第27-29页
    2.4 蛋白纯化试剂柱第29页
    2.5 实验试剂的配制第29-33页
3 实验方法第33-47页
    3.1 克隆、表达第33-40页
        3.1.1 引物设计第33-34页
        3.1.2 ODC基因扩增第34-35页
        3.1.3 PCR产物纯化第35页
        3.1.4 酶切目的片段第35页
        3.1.5 连接反应第35-36页
        3.1.6 大肠杆菌感受态细胞制备第36页
        3.1.7 大肠杆菌感受态细胞转化第36-37页
        3.1.8 菌落PCR第37页
        3.1.9 挑选菌株,进行扩大培养第37页
        3.1.10 提取质粒pGEX-6p-1-ODC第37-38页
        3.1.11 酶切鉴定第38-39页
        3.1.12 测序第39页
        3.1.13 转化到表达菌E.coli BL21第39页
        3.1.14 菌落PCR及扩大培养第39页
        3.1.15 小量表达第39页
        3.1.16 大量诱导表达第39-40页
        3.1.17 SDS-PAGE第40页
        3.1.18 AZ1基因扩增第40页
    3.2 纯化第40-44页
        3.2.1 从细胞中得到较纯的融化蛋白第40-42页
            3.2.1.1 纯化柱预处理第41页
            3.2.1.2 菌液准备第41页
            3.2.1.3 融合蛋白纯化第41-42页
            3.2.1.4 GST纯化beads的再生第42页
            3.2.1.5 加入PreScission蛋白酶酶切去除GST标签第42页
        3.2.2 去除GST标签,得到较纯目的蛋白第42-44页
            3.2.2.1 蛋白质脱盐第42-43页
            3.2.2.2 Second GST,去除GST标签第43页
            3.2.2.3 过离子交换试验,得到较纯目的蛋白第43-44页
        3.2.3 分子筛层析,得到纯度达95%的目的蛋白第44页
    3.3 结晶第44-46页
        3.3.1 寻找合适的蛋白质结晶浓度第45页
        3.3.2 结晶条件的初步筛选第45页
        3.3.3 结晶条件的优化第45-46页
    3.4 X射线衍射数据的收集第46-47页
        3.4.1 选择合适的保护剂第46页
        3.4.2 数据收集及处理第46-47页
4 实验结果与分析第47-67页
    4.1 酵母鸟氨酸脱羧酶SPE和抗酶蛋白AZ的融合蛋白的实验研究第47-53页
        4.1.1 SPE和AZ目的基因的克隆第47-48页
        4.1.2 SPE和AZ蛋白的诱导表达第48-49页
        4.1.3 SPE和AZ蛋白的纯化第49-53页
    4.2 人类鸟氨酸脱羧酶ODC和抗酶蛋白OAZ的融合蛋白实验研究第53-61页
        4.2.1 ODC和OAZ目的基因的克隆及诱导表达第53-54页
        4.2.2 ODC和OAZ蛋白的纯化第54-59页
        4.2.3 ODC和OAZ蛋白的晶体分析第59页
        4.2.3.1 质谱鉴定第59页
        4.2.3.2 蛋白浓度测定第59页
        4.2.3.3 大规模筛选分析第59-60页
        4.2.3.4 晶体生长条件优化第60-61页
    4.3 人类鸟氨酸脱羧酶ODC和抗酶蛋白OAZ1-ORF2的融合蛋白研究第61-67页
        4.3.1 ODC和OAZ1-ORF2目的基因的克隆及诱导表达第61-62页
        4.3.2 ODC和OAZ1-ORF2蛋白的纯化第62-63页
        4.3.3 人类ODC和抗酶蛋白OAZ1-ORF2的融合蛋白结晶分析第63-66页
            4.3.3.1 ODC和OAZ1-ORF2的融合蛋白质谱鉴定第63-64页
            4.3.3.2 ODC和OAZ1-ORF2的融合蛋白蛋白浓度测定第64页
            4.3.3.3 ODC和OAZ1-ORF2的融合蛋白大规模筛选分析第61-66页
        4.3.4 ODC和OAZ1-ORF2的融合蛋白数据的收集第66-67页
5. 讨论与展望第67-69页
    5.1 结果总结分析第67页
    5.2 展望第67-69页
参考文献第69-74页
作者简介和科研成果第74页

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