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PDCoV和PEDV快速检测方法的建立与PDCoV遗传变异分析

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PDCoV和PEDV快速检测方法的建立与PDCoV遗传变异分析
论文目录
 
致谢第1-8页
摘要第8-10页
文献综述第10-15页
    1 猪流行性腹泻病毒诊断方法的研究进展第10-11页
        1.1 概述第10页
        1.2 分子生物学诊断方法第10-11页
    2 猪Dleta冠状病毒及其诊断方法研究进展第11-15页
        2.1 概述第11-12页
        2.2 流行情况分析第12页
        2.3 PDCoV全基因分析及其结构蛋白的功能特征第12-13页
        2.4 诊断方法第13-15页
引言第15-16页
试验一 猪Delta冠状病毒SYBR Green Ⅰ荧光定量RT-PCR检测方法的建立第16-26页
    1 材料与方法第16-21页
        1.1 材料第16页
        1.2 方法第16-21页
    2 结果与分析第21-25页
        2.1 PDCoV常规PCR扩增第21页
        2.2 质粒浓度的计算第21页
        2.3 SYBR Green Ⅰ荧光定量RT-PCR反应条件的优化结果第21-22页
        2.4 SYBR Green Ⅰ荧光定量RT-PCR标准曲线的建立第22页
        2.5 SYBR Green Ⅰ荧光定量RT-PCR的溶解曲线分析第22-23页
        2.6 PDCoV特异性试验结果第23页
        2.7 PDCoV重复性试验结果第23-24页
        2.8 PDCoV敏感性试验结果第24页
        2.9 临床样品检测结果第24-25页
    3 结论与讨论第25-26页
试验二 猪流行性腹泻病毒SYBR Green Ⅰ荧光定量RT-PCR检测方法的建立第26-32页
    1 材料与方法第26-28页
        1.1 材料第26页
        1.2 方法第26-28页
    2 结果与分析第28-31页
        2.1 PEDV常规PCR扩增第28页
        2.2 质粒浓度的计算第28页
        2.3 SYBR Green Ⅰ荧光定量RT-PCR反应条件的优化结果第28-29页
        2.4 SYBR Green Ⅰ荧光定量RT-PCR标准曲线的建立第29页
        2.5 SYBR Green Ⅰ荧光定量RT-PCR的溶解曲线分析第29页
        2.6 PEDV特异性试验结果第29-30页
        2.7 PEDV重复性试验结果第30页
        2.8 PEDV敏感性试验结果第30-31页
        2.9 临床样品检测结果第31页
    3 结论与讨论第31-32页
试验三 PDCoV与 PEDV双重SYBR Green Ⅰ荧光RT-PCR检测方法的建立第32-41页
    1 材料与方法第32-35页
        1.1 材料第32页
        1.2 方法第32-35页
    2 结果第35-40页
        2.1 常规PCR扩增第35-36页
        2.2 质粒浓度的计算第36页
        2.3 双重荧光RT-PCR反应条件优化结果第36页
        2.4 双重SYBR Green Ⅰ荧光RT-PCR反应体系的确定第36-37页
        2.5 双重荧光RT-PCR方法溶解曲线及TM值的确定第37页
        2.6 特异性试验结果第37页
        2.7 重复性试验结果第37-39页
        2.8 敏感性试验结果第39页
        2.9 临床腹泻样品检测结果第39-40页
    3 讨论第40-41页
试验四 猪Delta冠状病毒河南流行株全基因序列的测定及遗传变异分析第41-55页
    1 材料与方法第41-44页
        1.1 材料第41页
        1.2 引物设计第41-42页
        1.3 病毒RNA的提取、反转录及全基因序列的分段扩增第42-43页
        1.4 PCR产物的回收纯化第43页
        1.5 PDCoV全基因组序列的测定、拼接及遗传变异分析第43-44页
    2 结果与分析第44-53页
        2.1 PDCoV基因组的克隆与序列测定结果第44-45页
        2.2 PDCoV同源性分析第45-46页
        2.3 PDCoV(CH-01 株)遗传进化分析第46-47页
        2.4 PDCoV ORF1 基因及推导的氨基酸分析第47-49页
        2.5 PDCoV S基因及推导的氨基酸分析第49-51页
        2.6 PDCoV M基因及推导的氨基酸分析第51-52页
        2.7 PDCoV N基因及推导的氨基酸分析第52-53页
    3 结论与讨论第53-55页
全文总结第55-56页
参考文献第56-61页
ABSTRACT第61-63页

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