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β-酮脂酰-ACP还原酶(FabG)抑制剂分子作用机制及药物设计研究

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β-酮脂酰-ACP还原酶(FabG)抑制剂分子作用机制及药物设计研究
论文目录
 
摘要第1-5页
abstract第5-8页
第一章 文献综述第8-22页
  1.1 抗菌药物发展与现状第8-9页
  1.2 耐药性细菌的种类第9-10页
  1.3 抗菌药物的作用机制和细菌耐药性机制第10-11页
    1.3.1 抗菌药物作用机制第10-11页
    1.3.2 细菌耐药性机制第11页
  1.4 生物体内脂肪酸合成途径与靶点第11-13页
    1.4.1 人和细菌脂肪酸合成途径的差异第11-12页
    1.4.2 细菌的脂肪酸合成途径第12-13页
  1.5 β-酮脂酰-ACP还原酶(FabG)简介第13-15页
  1.6 计算机辅助药物设计简介第15-20页
    1.6.1 分子对接第16-19页
    1.6.2 分子动力学模拟第19-20页
  1.7 本论文的研究内容及意义第20-22页
    1.7.1 研究目的及意义第20-21页
    1.7.2 本论文主要研究内容第21页
    1.7.3 研究的创新点第21-22页
第二章 表没食子儿茶素没食子酸酯(EGCG)及相关植物多酚对FabG的分子动力学研究第22-35页
  2.1 分子作用机制模拟实验第23-24页
    2.1.1 蛋白质晶体结构准备第23页
    2.1.2 受体与配体的动力学模拟初始构象的确定第23页
    2.1.3 分子动力学模拟第23-24页
    2.1.4 结合自由能的计算方法第24页
  2.2 结果分析与讨论第24-34页
    2.2.1 分子动力学模拟稳定性的探究第24-26页
    2.2.2 各个体系Loop区氨基酸残基波动变化第26-27页
    2.2.3 各体系中蛋白质氨基酸残基二级结构变化情况第27-29页
    2.2.4 FabG复合物体系的氢键分析及聚类分析第29-33页
    2.2.5 MM-PBSA结合自由能分析第33-34页
  2.3 小结第34-35页
第三章 含邻羟苯基的三唑类化合物对细菌多靶标抑制作用研究第35-48页
  3.1 实验方法第35-36页
    3.1.1 准备受体靶标与配体小分子库第35页
    3.1.2 受体蛋白与小分子配体的分子对接第35-36页
    3.1.3 分子对接打分第36页
  3.2 蛋白受体与配体分子对接结果第36-46页
    3.2.1 含邻羟苯基的三唑类化合物的分类第36-38页
    3.2.2 第Ⅰ类化合物的分子对接第38-40页
    3.2.3 第Ⅱ类化合物的分子对接第40-43页
    3.2.4 第Ⅲ类化合物的分子对接第43-45页
    3.2.5 第Ⅳ类化合物的分子对接第45-46页
  3.3 小结第46-48页
第四章 结论第48-49页
参考文献第49-57页
发表论文和科研情况说明第57-58页
致谢第58页

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