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小麦叶片环状RNA高通量鉴定及其在干旱胁迫应答中的功能初探

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小麦叶片环状RNA高通量鉴定及其在干旱胁迫应答中的功能初探
论文目录
 
致谢第1-8页
摘要第8-9页
1 文献综述第9-21页
  1.1 植物干旱胁迫生理及分子机制第9-10页
    1.1.1 干旱对小麦正常生长的危害第9页
    1.1.2 干旱对小麦光合作用的影响第9-10页
  1.2 高通量测序技术在植物抗逆机制研究中的应用第10-12页
    1.2.1 高通量测序技术的发展第10页
    1.2.2 RNA-seq在植物抗逆机制研究中的应用第10-12页
  1.3 非编码RNA第12-14页
    1.3.1 小RNA和在植物抗逆中的原理第12-13页
    1.3.2 长非编码RNA的定义和功能第13-14页
    1.3.3 长非编码RNA在植物中特别是抗逆性研究中应用第14页
  1.4 circRNA第14-21页
    1.4.1 circRNA的定义第14-15页
    1.4.2 circRNA的功能第15-16页
    1.4.3 circRNA的发展过程第16-17页
    1.4.4 基于RNA-seq的circRNA不同算法的比较第17-19页
    1.4.5 植物circRNA在抗逆胁迫中的可能作用第19-20页
    1.4.6 本研究的技术路线第20-21页
2 引言第21-22页
3 材料与方法第22-28页
  3.1 试验设计第22页
  3.2 试验仪器与试剂第22-24页
    3.2.1 主要试验仪器第22-23页
    3.2.2 主要试剂第23页
    3.2.3 主要数据库和分析工具第23页
    3.2.4 实时定量PCR引物第23-24页
  3.3 试验方法第24-28页
    3.3.1 相对水含量的测定第24页
    3.3.2 超氧化物歧化酶(SOD)活性的测定第24-25页
    3.3.3 过氧化氢酶(CAT)活性的测定第25页
    3.3.4 过氧化物酶(POD)活性的测定第25页
    3.3.5 过氧化氢(H2O2)含量的测定第25页
    3.3.6 丙二醛(MDA)含量的测定第25页
    3.3.7 总RNA提取和质控第25-26页
    3.3.8 circRNA建库和测序第26页
    3.3.9 circRNA的鉴定第26-27页
    3.3.10 预测circ RNA的miRNA靶标、miRNA的mRNA靶标和功能注释第27页
    3.3.11 验证差异化表达的circ RNA第27-28页
4 结果与讨论第28-38页
  4.1 生理指标第28-30页
    4.1.1 干旱对小麦幼苗叶片生长的影响第28页
    4.1.2 干旱对小麦幼苗叶片中相对水含量的影响第28-29页
    4.1.3 干旱对小麦幼苗叶片中MDA和H2O2的影响第29页
    4.1.4 干旱对小麦幼苗叶片中抗氧化酶活性的影响第29-30页
  4.2 小麦幼苗叶片circRNA分析第30-35页
    4.2.1 小麦幼苗叶片总RNA质控结果第30-31页
    4.2.2 小麦幼苗叶片circRNA的筛选和鉴定第31-32页
    4.2.3 干旱条件下小麦幼苗叶片circRNA的差异化表达模式第32页
    4.2.4 小麦幼苗叶片circRNA作为miRNA“海绵”的调控功能推断第32-34页
    4.2.5 小麦幼苗叶片中差异化表达circRNA的验证第34-35页
  4.3 预测mRNA的功能分类第35-38页
5 讨论第38-41页
  5.1 干旱对小麦正常生长的危害第38页
  5.2 干旱下小麦幼苗叶片circRNA与其他高等植物circRNA的对比第38-39页
  5.3 干旱下小麦幼苗叶片circRNA对其miRNA的海绵作用第39页
  5.4 干旱下小麦幼苗叶片circRNA对光合作用网络和激素调控网络的应答第39-41页
参考文献第41-52页
英文摘要第52-54页
附表第54-79页

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