基于BioNano图谱的基因组结构变异检测方法研究和应用

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基于BioNano图谱的基因组结构变异检测方法研究和应用

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基于BioNano图谱的基因组结构变异检测方法研究和应用

论文目录
摘要	第1-4页
Abstract	第4-8页
第1章绪论	第8-15页
· 研究背景	第8-10页
· 研究目的和意义	第10页
· 研究内容、方法和技术路线	第10-13页
· 本文的主要贡献	第13-15页
第2章相关理论与文献综述	第15-35页
· 相关理论	第15-27页
· 基本概念与术语	第15-16页
· 光学图谱	第16-17页
· 序列比对算法	第17-20页
· 隐马尔科夫模型	第20-27页
· 文献综述	第27-35页
· 基因组结构变异的研究内容	第28-30页
· 基因组结构变异的检测方法	第30-33页
· 隐马尔科夫模型在生物信息学中的应用	第33-35页
第3章基于光学图谱数据模型的理论分析与模型构建	第35-45页
· 基因组光学图谱数据	第35-38页
· 光学图谱数据	第35-36页
· 光学图谱数据的误差	第36-38页
· 基因组光学图谱误差数据的建模	第38-41页
· 模型的假设	第38-39页
· 光学图谱数据误差模型	第39-41页
· 光学图谱数据拷贝数建模	第41-45页
· 光学图谱数据拷贝数建模的背景	第41页
· 模型的简化	第41-43页
· 光学图谱数据拷贝数建模	第43-45页
第4章基于光学图谱模型对基因组结构变异的实证研究	第45-59页
· 数据的来源	第45页
· 光学图谱数据的拼装与比对	第45-48页
· 光学图谱数据的拼装	第45-47页
· 光学图谱数据的比对	第47-48页
· 对隐马尔科夫模型算法的应用	第48-51页
· 隐马尔科夫模型的计算	第48-49页
· Baum-Welch算法的应用	第49-51页
· 软件与代码	第51-52页
· 基于光学图谱模型的结构变异结果分析	第52-57页
· 基因组结构变异汇总	第52-53页
· 基于隐马尔科夫模型的基因组拷贝数多态性的检测	第53-57页
· 基于光学图谱模型的结构变异结果讨论	第57-59页
第5章总结与展望	第59-61页
致谢	第61-62页
参考文献	第62-68页
附录	第68-74页

本篇论文共74页，点击这进入下载页面。

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