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马铜绿假单胞菌全基因组重测序研究

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马铜绿假单胞菌全基因组重测序研究
论文目录
 
摘要第1-4页
Abstract第4-6页
縮略语表第6-7页
1 引言第7-14页
  · 铜绿假单胞菌简介第7-8页
    · 铜绿假单胞菌概况第7页
    · 铜绿假单胞菌基因组结构特点及研究现状第7-8页
  · 微生物基因组学第8-11页
    · 微生物基因组学的研究历史第8-9页
    · 微生物基因组学研究内容及应用第9-11页
  · 全基因组重测序研究第11-14页
    · 全基因组重测序研究进展第11-12页
    · 全基因组测序技术简介第12-14页
  · 本研究目的和意义第14页
2 材料与方法第14-20页
  · 材料第14页
  · 主要仪器和设备第14页
  · 主要试剂第14页
  · 方法第14-20页
    · 构建TruSeq DNA文库第14-19页
    · 全基因组测序第19页
    · 筛选SNPs和InDels第19页
    · 功能注释第19-20页
3 结果与分析第20-35页
  · 全基因组测序第20-24页
    · 测序方案第20页
    · 原始下机数据和过滤第20-21页
    · 统计长度分布第21-23页
    · 将clean reads map到参考基因组上第23-24页
    · SNPs和InDels的筛选第24页
  · 功能注释第24-35页
    · SNPs功能注释第24-29页
      · COG功能分类第24-27页
      · 总SNPs分布的GO(Gene Ontology)分类第27-29页
      · KEGG Pathway 功能分类第29页
    · InDels位点功能注释第29-35页
4 讨论第35-36页
致谢第36-37页
参考文献第37-41页
附录第41-48页
作者简介第48 页

本篇论文共48页,点击这进入下载页面
 
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