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马铜绿假单胞菌全基因组重测序研究
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马铜绿假单胞菌全基因组重测序研究
论文目录
摘要
第1-4页
Abstract
第4-6页
縮略语表
第6-7页
1 引言
第7-14页
· 铜绿假单胞菌简介
第7-8页
· 铜绿假单胞菌概况
第7页
· 铜绿假单胞菌基因组结构特点及研究现状
第7-8页
· 微生物基因组学
第8-11页
· 微生物基因组学的研究历史
第8-9页
· 微生物基因组学研究内容及应用
第9-11页
· 全基因组重测序研究
第11-14页
· 全基因组重测序研究进展
第11-12页
· 全基因组测序技术简介
第12-14页
· 本研究目的和意义
第14页
2 材料与方法
第14-20页
· 材料
第14页
· 主要仪器和设备
第14页
· 主要试剂
第14页
· 方法
第14-20页
· 构建TruSeq DNA文库
第14-19页
· 全基因组测序
第19页
· 筛选SNPs和InDels
第19页
· 功能注释
第19-20页
3 结果与分析
第20-35页
· 全基因组测序
第20-24页
· 测序方案
第20页
· 原始下机数据和过滤
第20-21页
· 统计长度分布
第21-23页
· 将clean reads map到参考基因组上
第23-24页
· SNPs和InDels的筛选
第24页
· 功能注释
第24-35页
· SNPs功能注释
第24-29页
· COG功能分类
第24-27页
· 总SNPs分布的GO(Gene Ontology)分类
第27-29页
· KEGG Pathway 功能分类
第29页
· InDels位点功能注释
第29-35页
4 讨论
第35-36页
致谢
第36-37页
参考文献
第37-41页
附录
第41-48页
作者简介
第48 页
本篇论文共
48
页,
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更多论文
马铜绿假单胞菌全基因组重测序研究
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