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葡萄SnRK2基因家族的全基因组鉴定、表达分析及VvSnRK2.2基因的功能验证

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葡萄SnRK2基因家族的全基因组鉴定、表达分析及VvSnRK2.2基因的功能验证
论文目录
 
摘要第1-10页
ABSTRACT第10-12页
缩略语第12-13页
引言第13-14页
第一章 文献综述第14-34页
  1 蛋白激酶第14-19页
    · 蛋白激酶的分类第14页
    · 植物蛋白激酶研究进展第14-19页
      · 受体蛋白激酶(RLK)第15-16页
      · 分裂原激活蛋白激酶(MAPK)第16-17页
      · 钙依赖而钙调素不依赖蛋白激酶(CDPK)第17页
      · 蔗糖非发酵1型相关蛋白激酶(SnRK)第17-19页
  2 S RK2蛋白激酶家族结构第19-20页
  3 S RK2蛋白激酶的活性及表达第20-21页
  4 SnRK2蛋白激酶家族的调控网络第21-23页
  5 本研究的目的和意义第23-25页
  参考文献第25-34页
第二章 葡萄SnRK2基因家族的全基因组鉴定和生物信息学分析第34-48页
  摘要第34-35页
  1 材料和方法第35-37页
    · 数据库的搜索第35-36页
    · 序列分析和系统进化树的构建第36页
    · S RK2蛋白质结构分析第36页
    · SnRK2基因结构分析第36页
    · SnRK2 C-末端motif分析第36页
    · SnRK2 C-末端序列比对分析第36-37页
    · SnRK2的EST分析第37页
  2 结果与分析第37-44页
    · 葡萄SnRK2候选基因的确定和染色体的定位第37-38页
    · 葡萄SnRK2蛋白质理化性质分析第38页
    · 葡萄SnRK2蛋白二级结构分析第38页
    · 葡萄SnRK2的系谱发生第38-41页
    · 葡萄SnRK2的基因结构分析第41-42页
    · 葡萄SnRK2的C末端motif分析第42-43页
    · 葡萄SnRK2 C-末端序列比对分析第43页
    · 葡萄SnRK2的EST表达分析第43-44页
  3 讨论第44-46页
  参考文献第46-48页
第三章 葡萄SnRK2家族基因的表达分析第48-72页
  摘要第48-49页
  1 材料和方法第49-53页
    · 芯片数据第49页
    · 材料和处理第49-50页
    · 引物第50-51页
    · 试剂和仪器第51页
    · 方法第51-53页
      · 总RNA的提取第51页
      · 总RNA中DNA的消化及cDNA第一链的合成第51-52页
      · 荧光定量PCR分析第52-53页
  2 结果与分析第53-61页
    · 葡萄SnRK2基于芯片数据的表达分析第53-56页
      · 葡萄SnRK2基因在不同组织、器官及其不同发育阶段的表达情况第53-55页
      · 葡萄SnRK2响应生物和非生物胁迫的表达情况第55-56页
      · 葡萄SnRK2响应外源ABA的表达情况第56页
    · 葡萄SnRK2基于荧光定量PCR(qRT-PCR)的表达分析第56-61页
      · 处理材料RNA的提取第56-57页
      · 葡萄SnRK2基因荧光引物筛选第57-58页
      · 干旱处理条件下葡萄中6个SnRK2基因的表达情况第58页
      · NaCl处理条件下葡萄中6个SnRK2基因的表达情况第58页
      · 高温处理条件下葡萄6个SnRK2基因的表达情况第58-59页
      · 低温处理条件下葡萄中6个VvSnRK2基因的表达情况第59页
      · ABA处理条件下葡萄中6个SnRK2基因的表达情况第59-61页
  3 讨论第61-62页
  参考文献第62-72页
第四章 葡萄VvSnRK·的克隆、序列分析及拟南芥遗传转化第72-88页
  摘要第72-73页
  1 材料和方法第73-79页
    · 材料第73-74页
      · 植物材料第73页
      · 仪器、试剂和耗材第73页
      · 载体质粒和农杆菌菌株第73-74页
    · 方法第74-79页
      · 基因克隆第74-77页
      · 载体构建第77-78页
      · 拟南芥遗传转化(花粉管通道法)第78-79页
  2 结果与分析第79-86页
    · 基因的克隆与序列分析第79-83页
      · 总RNA的提取第79-80页
      · VvSnRK·基因的克隆第80页
      · VvSnRK·基因的序列分析第80-83页
    · 植物表达载体的构建第83-84页
      · 带酶切位点的VvSnRK·基因的克隆第83页
      · 载体构建成功农杆菌菌液检测第83-84页
    · 拟南芥转基因株系的检测第84-86页
      · TO代转基因种子的初步筛选第84页
      · 转基因拟南芥GUS染色结果第84-85页
      · 转基因株系T3代GUS染色第85页
      · RT-PCR检测第85-86页
  3 讨论第86-87页
  参考文献第87-88页
第五章 VvSnRK·基因的功能验证第88-98页
  摘要第88-89页
  1 材料和方法第89-90页
    · 材料第89页
      · 植物材料第89页
      · 仪器和试剂第89页
    · 方法第89-90页
      · 转基因株系在正常生长条件下的表型观察第89页
      · 转基因株系在各种胁迫处理条件下的表型观察第89-90页
  2 结果与分析第90-96页
    · 野生型拟南芥和转基因株系的发芽状态第90页
    · 野生型拟南芥和转基因株系的初生根长度第90-91页
    · 野生型拟南芥和转基因株系非生物胁迫抗性分析第91-96页
      · 野生型拟南芥和转基因拟南芥在对照培养基上的生长情况第91页
      · NaCl(100mM)处理条件下的表型观察第91-92页
      · ABA(1OμM和50μM)处理条件下的表型观察第92-94页
      · 转基因株系抗旱性分析第94-96页
  3 讨论第96-97页
  参考文献第97-98页
全文结论第98-100页
主要创新点第100-102页
附录第102-106页
攻读硕士学位期间所发表论文第106-108页
致谢第108 页

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