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马铃薯表达谱平台的构建与应用

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马铃薯表达谱平台的构建与应用
论文目录
 
摘要第1-7页
Abstract第7-8页
1 前言第8-20页
  · 课题的提出第8-9页
  · 文献综述第9-19页
    · 测序技术的发展第9-10页
    · 转录组研究及优势第10页
    · 转录组技术在动植物中的应用第10-12页
    · 转录组RNA-Seq分析相关软件第12-17页
    · 马铃薯基因组研究现状第17-18页
    · 平台及数据库的建立第18-19页
  · 研究内容及目的第19-20页
2 数据与方法第20-27页
  · 数据的收集第20页
  · 数据的质量控制第20-22页
  · 马铃薯转录组整合第22-24页
  · SNP位点分析与亲缘关系图谱的建立第24页
  · 染色体转录本丰度分析第24-25页
  · 网站的构建及表达谱数据库的建立第25-27页
3 结果与分析第27-47页
  · 数据的质控第27-29页
  · 马铃薯转录组的整合及注释第29-37页
    · 转录组整合第29-32页
    · 马铃薯原参照基因组与组装的泛基因组比较分析第32-33页
    · 转录本的注释第33-37页
      · 新转录本的BLAST2GO注释第33-36页
      · 非编码预测第36-37页
  · SNP位点与亲缘关系分析第37-38页
  · 染色体转录本丰度分析第38-41页
  · 平台及数据库的构建第41-47页
    · Genome Browser基因组浏览器搭建第41-43页
    · BLAST查询数据库的建立第43-45页
    · 表达谱数据库的建立第45-47页
4 总结与展望第47-50页
  · 转录组整合第47页
  · 数据平台的利用第47-48页
  · 展望第48-50页
参考文献第50-58页
致谢第58页

本篇论文共58页,点击这进入下载页面
 
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