基于GMM的基因外显子预测算法研究

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基于GMM的基因外显子预测算法研究

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基于GMM的基因外显子预测算法研究

论文目录
摘要	第1-4页
ABSTRACT	第4页
第一章绪论	第7-12页
1.1 生物信息学	第7-9页
1.1.1 生物信息学的含义和发展历史	第7-8页
1.1.2 生物信息学的任务	第8页
1.1.3 生物信息学的研究内容	第8-9页
1.2 基因预测的研究现状及意义	第9-11页
1.3 本文的内容安排	第11-12页
第二章 DNA序列的结构和数值映射	第12-19页
2.1 DNA序列的结构	第12-13页
2.2 基因编码区的周期三特性	第13页
2.3 DNA序列的数值映射	第13-17页
2.3.1 VOSS映射	第14页
2.3.2 复数描述	第14-15页
2.3.3 Z曲线描述	第15页
2.3.4 成对数值映射	第15-17页
2.4 小结	第17-19页
第三章基因预测的特征提取	第19-30页
3.1 频域处理方法	第19-23页
3.1.1 基于DFT的特征提取	第19-22页
3.1.2 PWSR方法提取特征	第22-23页
3.2 时域处理方法	第23-26页
3.2.1 反陷波滤波器	第24-25页
3.2.2 AMDF以及CAMDF特征计算	第25页
3.2.3 奇异值分解SVD提取特征	第25-26页
3.3 改进的特征提取方法	第26-28页
3.3.1 基于信息熵(IE)的特征提取	第26-27页
3.3.2 SMDSF特征的提取	第27-28页
3.4 多维特征的后处理	第28-29页
3.5 小结	第29-30页
第四章 GMM分类算法研究	第30-37页
4.1 GMM概述	第30-31页
4.2 GMM中参数估计中的EM算法研究	第31-34页
4.3 GMM分类在生物序列中的应用	第34-35页
4.4 小结	第35-37页
第五章评估标准和结果分析	第37-53页
5.1 数据库的选取	第37-38页
5.2 评估标准	第38-40页
5.3 结果分析	第40-52页
5.3.1 四种映射方法的比较	第40-42页
5.3.2 特征提取方法的比较	第42-52页
5.4 小结	第52-53页
第六章总结与展望	第53-55页
6.1 总结	第53-54页
6.2 展望	第54-55页
参考文献	第55-58页
发表论文和参加科研情况说明	第58-59页
致谢	第59

本篇论文共59页，点击这进入下载页面。

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