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神经氨酸酶新型抑制剂的分子动力学研究
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神经氨酸酶新型抑制剂的分子动力学研究
论文目录
 
摘要第1-6页
Abstract第6-10页
第1章 绪论第10-18页
　　1.1 流感病毒第10-11页
　　　　1.1.1 流感病毒的结构第10-11页
　　　　1.1.2 流感病毒的分类第11页
　　　　1.1.3 抗流感药物研究现状第11页
　　1.2 神经氨酸酶第11-14页
　　　　1.2.1 神经氨酸酶的结构第11-12页
　　　　1.2.2 NA活性位点第12-14页
　　　　1.2.3 150-loop区第14页
　　1.3 NA抑制剂的国内外研究现状第14-17页
　　　　1.3.1 唾液酸类第14页
　　　　1.3.2 苯甲酸类第14-15页
　　　　1.3.3 吡咯烷类第15页
　　　　1.3.4 环戊烷类第15页
　　　　1.3.5 环己烯类第15-16页
　　　　1.3.6 天然产物第16-17页
　　1.4 本文的研究内容第17-18页
第2章 理论基础及计算方法第18-25页
　　2.1 分子对接概述第18-21页
　　　　2.1.1 分子对接原理及原则第18-19页
　　　　2.1.2 分子对接方法的分类第19页
　　　　2.1.3 分子对接常用软件第19-21页
　　2.2 分子动力学模拟第21-24页
　　　　2.2.1 MD模拟的一般过程第21页
　　　　2.2.2 分子动力学思想的演化过程第21-22页
　　　　2.2.3 积分算法第22-23页
　　　　2.2.4 系综第23-24页
　　2.3 本章小结第24-25页
第3章 奥司他韦及其衍生物与神经氨酸酶分子对接第25-35页
　　3.1 引言第25页
　　3.2 分子对接方法的验证第25-30页
　　　　3.2.1 受体的选取和准备第25-28页
　　　　3.2.2 分子对接的步骤第28页
　　　　3.2.3 分子对接结果第28-30页
　　3.3 奥司他韦衍生物的分子对接结果第30-33页
　　　　3.3.1 配体的选取和准备第30-31页
　　　　3.3.2 分子对接参数设置第31页
　　　　3.3.3 分子对接结果第31-33页
　　3.4 本章小结第33-35页
第4章 奥司他韦及其衍生物与神经氨酸酶的分子动力学模拟第35-51页
　　4.1 引言第35页
　　4.2 GROMACS分子动力学模拟第35-37页
　　4.3 分子动力学模拟结果分析第37-49页
　　　　4.3.1 RMSD第37-38页
　　　　4.3.2 氢键分析第38-41页
　　　　4.3.3 主成分分析第41-45页
　　　　4.3.4 自由能面图第45-48页
　　　　4.3.5 结合自由能第48-49页
　　4.4 本章小结第49-51页
结论第51-52页
参考文献第52-59页
攻读学位期间发表的学术论文第59-60页
致谢第60页

本篇论文共60页，点击这进入下载页面。
 
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