论文目录 | |
| 摘要 | 第1-9页 |
| ABSTRACT | 第9-13页 |
| 第一章 综述 | 第18-27页 |
| 1.1 原生动物纤毛虫简介 | 第18-19页 |
| 1.2 原生动物纤毛虫包囊形成现象的简介 | 第19-21页 |
| 1.2.1 原生动物纤毛虫包囊细胞分类 | 第19页 |
| 1.2.2 原生动物纤毛虫包囊细胞形成的原因 | 第19-20页 |
| 1.2.3 原生动物纤毛虫包囊细胞形成时的生命活动特征 | 第20-21页 |
| 1.3 原生动物纤毛虫包囊形成相关的生物学研究 | 第21-23页 |
| 1.3.1 原生动物纤毛虫包囊形成相关的形态学研究 | 第21-22页 |
| 1.3.2 原生动物纤毛虫包囊形成相关的分子生物学研究 | 第22-23页 |
| 1.4 原生动物纤毛虫转录组学研宄技术 | 第23-26页 |
| 1.4.1 转录组学简介 | 第24页 |
| 1.4.2 转录组测序的原理和优势 | 第24-25页 |
| 1.4.3 转录组测序的应用 | 第25-26页 |
| 1.5 本课题研究意义 | 第26-27页 |
| 第二章 冠突伪尾柱虫营养细胞和包囊细胞转录组文库的构建和测序分析 | 第27-50页 |
| 2.1 实验试剂 | 第27-28页 |
| 2.2 实验仪器 | 第28页 |
| 2.3 实验材料 | 第28-29页 |
| 2.4 实验方法 | 第29-32页 |
| 2.4.1 冠突伪尾柱虫营养细胞和包囊细胞总RNA的提取 | 第29页 |
| 2.4.2 转录组文库构建步骤: | 第29页 |
| 2.4.3 原始数据处理 | 第29页 |
| 2.4.4 转录本组装及差异基因的筛选 | 第29-30页 |
| 2.4.5 Unigene表达丰度 | 第30页 |
| 2.4.6 Unigene的基本注释 | 第30页 |
| 2.4.7 Unigene的GO分类和KOG注释 | 第30-31页 |
| 2.4.8 Unigene的代谢通路分析 | 第31页 |
| 2.4.9 Q-PCR验证 | 第31-32页 |
| 2.5 实验结果 | 第32-46页 |
| 第一节 冠突伪尾柱虫转录组测序的基本分析 | 第32-43页 |
| 2.5.1 RNA抽提结果 | 第32-33页 |
| 2.5.2 原始数据处理检测结果 | 第33-34页 |
| 2.5.3 转录本组装结果及差异基因的筛选 | 第34页 |
| 2.5.4 Unigene表达丰度结果 | 第34-35页 |
| 2.5.5 Unigene功能注释结果 | 第35-36页 |
| 2.5.6 KOG注释分析 | 第36页 |
| 2.5.7 GO注释及差异分析 | 第36-39页 |
| 2.5.8 KEGG代谢通路分析 | 第39-42页 |
| 2.5.9 Q-PCR验证结果分析 | 第42-43页 |
| 第二节 基于转录组数据对冠突伪尾柱虫包囊形成相关的信号通路及基因序列的分析筛选 | 第43-46页 |
| 2.5.10 钙离子运输相关信号通路及基因序列 | 第43-44页 |
| 2.5.11 依赖泛素降解信号通路及基因序列 | 第44-45页 |
| 2.5.12 MAPK相关信号通路及基因序列 | 第45-46页 |
| 2.6 讨论 | 第46-50页 |
| 第三章 Hsp70 shRNA的构建及对冠突伪尾柱虫的Hsp70基因干扰效果的鉴定 | 第50-58页 |
| 3.1 Hsp70 shRNA的构建 | 第50-54页 |
| 3.1.1 实验试剂 | 第50页 |
| 3.1.2 实验仪器 | 第50-51页 |
| 3.1.3 实验材料 | 第51页 |
| 3.1.4 实验方法 | 第51页 |
| 3.1.5 实验结果 | 第51-54页 |
| 3.2 冠突伪尾柱虫的Hsp70基因干扰效果的鉴定 | 第54-56页 |
| 3.2.1 实验试剂 | 第54页 |
| 3.2.2 实验仪器 | 第54页 |
| 3.2.3 实验材料 | 第54页 |
| 3.2.4 实验方法 | 第54-55页 |
| 3.2.5 实验结果 | 第55-56页 |
| 3.3 讨论 | 第56-58页 |
| 第四章 应用比较转录组技术分析沉默Hsp70基因对冠突伪尾柱虫包囊形成的影响 | 第58-72页 |
| 4.1 实验试剂 | 第58页 |
| 4.2 实验仪器 | 第58页 |
| 4.3 实验材料 | 第58页 |
| 4.4 实验方法 | 第58-59页 |
| 4.4.1 转录组文库构建步骤 | 第58页 |
| 4.4.2 原始数据处理及差异基因的筛选 | 第58页 |
| 4.4.3 转录本组装 | 第58页 |
| 4.4.4 Unigene表达丰度 | 第58页 |
| 4.4.5 Unigene的基本注释 | 第58页 |
| 4.4.6 Unigene的KOG注释 | 第58-59页 |
| 4.4.7 Unigene的GO注释及差异分析 | 第59页 |
| 4.4.8 Unigene KEGG注释及差异分析 | 第59页 |
| 4.4.9 Q-PCR验证 | 第59页 |
| 4.5 实验结果 | 第59-68页 |
| 4.5.1 RNA抽提结果 | 第59-60页 |
| 4.5.2 原始数据处理检测结果 | 第60-61页 |
| 4.5.3 转录本组装结果及差异基因的筛选 | 第61页 |
| 4.5.4 Unigene表达丰度结果 | 第61-62页 |
| 4.5.5 Unigene功能注释结果 | 第62-63页 |
| 4.5.6 Unigene的KOG注释分析 | 第63页 |
| 4.5.7 Unigene的GO注释及差异分析 | 第63-65页 |
| 4.5.8 Unigene代谢通路的比较分析 | 第65-67页 |
| 4.5.9 Q-PCR验证结果分析 | 第67-68页 |
| 4.6 讨论 | 第68-72页 |
| 第五章 比较转录组技术分析Hsp70 shRNA2干扰后冠突伪尾柱虫包囊细胞与冠突伪尾柱虫营养细胞的基因表达的差异 | 第72-82页 |
| 5.1 实验试剂 | 第72页 |
| 5.2 实验仪器 | 第72页 |
| 5.3 实验材料 | 第72页 |
| 5.4 实验方法 | 第72-73页 |
| 5.4.1 转录组文库构建步骤 | 第72页 |
| 5.4.2 原始数据处理及差异基因的筛选 | 第72页 |
| 5.4.3 转录本组装 | 第72页 |
| 5.4.4 Unigene的基本注释 | 第72页 |
| 5.4.5 Unigene的KOG分析 | 第72-73页 |
| 5.4.6 Unigene的GO比较分析 | 第73页 |
| 5.4.7 Unigene代谢通路的比较分析 | 第73页 |
| 5.5 实验结果 | 第73-80页 |
| 5.5.1 RNA抽提结果 | 第73页 |
| 5.5.2 原始数据处理检测结果 | 第73-74页 |
| 5.5.3 转录本组装结果及差异基因的筛选 | 第74-75页 |
| 5.5.4 Unigene功能注释结果 | 第75-76页 |
| 5.5.5 Unigene的KOG注释分析 | 第76页 |
| 5.5.6 Unigene的GO注释分析 | 第76-79页 |
| 5.5.7 Unigene代谢通路的比较分析 | 第79-80页 |
| 5.6 讨论 | 第80-82页 |
| 全文总结 | 第82页 |
| 本研究的创新点与展望 | 第82-83页 |
| 附录1 | 第83-84页 |
| 附录2 | 第84-85页 |
| 附录3 | 第85-86页 |
| 附录4 | 第86-87页 |
| 攻读硕士期间发表的论文 | 第87页 |
| 研宄生期间参与的科研项目 | 第87-88页 |
| 参考文献 | 第88-96页 |
| 致谢 | 第96页 |
