论文目录 | |
| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 引言 | 第10-21页 |
| 1.1 水稻多倍体的概述 | 第10-12页 |
| 1.1.1 同源多倍体水稻 | 第11页 |
| 1.1.2 异源多倍体水稻 | 第11-12页 |
| 1.2 减数分裂中同源重组的研究 | 第12-16页 |
| 1.2.1 DSB的产生和修复 | 第13-14页 |
| 1.2.2 不同生物中的同源重组的研究 | 第14-16页 |
| 1.2.2.1 微生物中的同源重组研究 | 第15页 |
| 1.2.2.2 植物中的同源重组研究 | 第15页 |
| 1.2.2.3 昆虫中的同源重组研究 | 第15-16页 |
| 1.2.2.4 哺乳动物中的同源重组研究 | 第16页 |
| 1.3 表观遗传学与同源重组 | 第16-19页 |
| 1.3.1 表观遗传学的概述 | 第17页 |
| 1.3.2 DNA甲基化与同源重组 | 第17-18页 |
| 1.3.3 组蛋白修饰与同源重组 | 第18-19页 |
| 1.3.3.1 组蛋白修饰的概述 | 第18页 |
| 1.3.3.2 不同物种中组蛋白修饰与同源重组的研究 | 第18-19页 |
| 1.4 本研究的目的和意义 | 第19-21页 |
| 材料与方法 | 第21-30页 |
| 2.1 实验材料及方法 | 第21-26页 |
| 2.1.1 水稻植株的来源与信息 | 第21-22页 |
| 2.1.2 实验试剂及仪器 | 第22-24页 |
| 2.1.3 提取DNA | 第24-25页 |
| 2.1.4 Ch IP-seq实验 | 第25-26页 |
| 2.1.5 测序 | 第26页 |
| 2.2 数据处理 | 第26-30页 |
| 2.2.1 测序数据的回帖和SNP获取 | 第26-27页 |
| 2.2.2 重组形式的鉴定 | 第27-28页 |
| 2.2.3 染色质免疫沉淀-测序(Ch IP-sequencing)数据处理 | 第28-30页 |
| 结果与分析 | 第30-48页 |
| 3.1 Ch IP-seq实验检测 | 第30页 |
| 3.2 重测序数据的总体评估 | 第30-31页 |
| 3.3 重组位点在基因组上分布及特性 | 第31-36页 |
| 3.3.1 重组位点在水稻四倍体中的数目和分布 | 第31-33页 |
| 3.3.2 重组在水稻四倍体基因组中的遗传特性 | 第33-36页 |
| 3.4 组蛋白修饰H3K4me3和H3K27me3与重组位点的相关性 | 第36-48页 |
| 3.4.1 峰数目分析H3K4me3和H3K27me3与重组位点的相关性 | 第36-38页 |
| 3.4.2 峰覆盖度分析H3K4me3和H3K27me3与重组位点的相关性 | 第38-41页 |
| 3.4.3 全基因组与重组位点比较分析H3K4me3和H3K27me3的富集情况 | 第41-45页 |
| 3.4.4 全基因组与重组位点比较分析H3K4me3和H3K27me3读段密度 | 第45-48页 |
| 讨论 | 第48-50页 |
| 结论 | 第50-51页 |
| 参考文献 | 第51-61页 |
| 附录 | 第61-82页 |
| 致谢 | 第82页 |
