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胡萝卜软腐欧文氏菌黑胫亚种蛋白质互作网络预测

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胡萝卜软腐欧文氏菌黑胫亚种蛋白质互作网络预测
论文目录
 
摘要第1-7页
Abstract第7-8页
缩略表(Abbreviation)第8-9页
1 前言第9-17页
  · 欧文氏菌的介绍第9-10页
  · 致病菌的重要特性分析第10-13页
    · 细菌的分泌系统第10-12页
    · 鞭毛合成以及趋化系统第12-13页
    · 双组份信号转导系统第13页
  · 蛋白质相互作用网络第13-16页
    · 蛋白质相互作用的实验方法第14页
    · 蛋白质相互作用的生物信息学预测方法第14-16页
  · 本研究的目的和意义第16-17页
2 数据与方法第17-23页
  · 数据来源第17页
    · 数据库第17页
    · 所用软件第17页
  · 预测方法及验证方法的原理第17-19页
    · 基于直系同源的方法第17-18页
    · 基于结构域组合的方法第18-19页
    · 基于K最近邻算法第19页
  · 预测过程第19-22页
    · 数据的预处理第19-20页
    · 具体步骤第20-22页
  · 初步结果第22-23页
    · 基于直系同源预测方法的结果第22页
    · 基于结构域组合预测方法的结果第22-23页
    · K最近邻算法评估的结果第23页
3 蛋白质相互作用网络的构建及分析第23-36页
  · 蛋白质相互作用网络的可视化第23-25页
  · 蛋白质网络拓扑结构分析第25-27页
  · 蛋白质功能模块分析第27-28页
    · COG分类第27页
    · 模块划分第27-28页
  · 子网络的分析第28-36页
    · 分泌系统相关子网络第28-30页
    · 鞭毛合成相关子网络第30-33页
    · 趋化系统相关子网络第33-34页
    · 信号转导系统相关子网络第34-36页
4 讨论与展望第36-38页
  · 讨论第36-37页
  · 展望第37-38页
参考文献第38-48页
附表1第48-50页
致谢第50 页

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