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CoREST SANT结构域蛋白与非编码小dsRNA相互作用模式的初步研究

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CoREST SANT结构域蛋白与非编码小dsRNA相互作用模式的初步研究
论文目录
 
摘要第1-8页
ABSTRACT第8-9页
第一部分 文献综述第9-22页
  1 锌指蛋白的来源及种类第9-15页
    · C_2H_2锌指蛋白的结构特征第9-10页
    · Zn~(2+)对锌指蛋白构象的影响第10-11页
    · REST/NRSF蛋白的发现、特征及功能第11-14页
    · REST/NRSF调控基因转录的途径第14-15页
  2 CoREST蛋白第15-18页
    · CoREST蛋白的结构特征第15页
    · CoREST蛋白的生物学功能第15-16页
    · CoREST抑制基因转录的作用机制第16-17页
    · CoREST相互作用的生理学意义第17-18页
  3 RNA沉默现象第18-19页
  4 NRSE dsRNA与REST/NRSF的相互作用第19-21页
  5 本课题的研究思路、目的与意义第21-22页
第二部分 材料和方法第22-29页
  1 材料第22-26页
    · 仪器第22-23页
    · 培养基第23-24页
    · 缓冲液第24-25页
    · 试剂第25页
    · 菌株及质粒第25-26页
    · 其它试剂第26页
  2 方法第26-29页
    · 感受态细胞的制备第26页
    · 转化第26-27页
    · PCR反应体系第27页
    · 质粒的制备第27页
    · 连接第27页
    · 重组质粒的小量表达第27-28页
    · Ni~(2+)柱的再生第28页
    · 表达和纯化第28-29页
第三部分 CoREST蛋白SANT1结构域质粒构建、表达纯化第29-48页
  1 含His·tag的pSJ3-CoREST SANT1的质粒构建第29-30页
    · 引物设计第29页
    · PCR扩增第29-30页
    · 重组质粒的菌液PCR鉴定第30页
    · 分析第30页
  2 重组pSJ3-CoREST SANT1表达条件的优化第30-34页
    2.1 重组质粒pSJ3 SANT1小量表达条件的优化第30-33页
    · 分析第33-34页
  3 含SUMO-tag和FLAG-tag的pSMT3-CoREST-FLAG SANT1的质粒构建第34-35页
    · 引物设计第34页
    · PCR扩增第34-35页
    · 重组质粒的菌液PCR鉴定第35页
    · 分析第35页
  4 含SUMO·tag和FLAG·tag的pSMT3-CoREST-FLAG SANT1蛋白表达条件的优化第35-38页
    · 重组质粒pSMT3-SANT1-FLAG小量表达的优化第35-38页
    · 分析第38页
  5 含GB1·tag的pHGB-CoREST SANT1的质粒构建第38-40页
    · 引物设计第38-39页
    · PCR扩增第39页
    · 目标质粒的菌液PCR鉴定第39-40页
    · 分析第40页
  6 GB1·tag CoREST SANT1融合蛋白表达条件的优化第40-43页
    6.1 重组质粒pHGB SANT1小量表达条件的优化第40-43页
    · 分析第43页
  7 pHGB CoREST SANT1大量表达和纯化第43-47页
    · 表达和纯化第43-44页
    · 离子交换柱纯化第44-45页
    · 第二次纯化后的SDS-PAGE检测第45页
    · 分析和讨论第45-47页
  8 本章小结第47-48页
第四部分 CoREST蛋白SANT2结构域的表达与纯化第48-65页
  1 pET28a CoREST SANT2在M9中表达条件优化第48-51页
    1.1 重组质粒pET28a SANT2小量表达条件的优化第48-51页
    · 分析第51页
  2 ~(15)N标记CoREST SANT2大量表达和纯化第51-54页
    · 表达和纯化第51-52页
    · SDS-PAGE检测第52-53页
    · 透析和酶切第53页
    · 第二次Ni柱纯化第53-54页
    · 分析第54页
  3 ~(15)N标记的CoREST SANT2蛋白NMR样品的制备第54-56页
    · 自由态SANT2样品第54-55页
    · SANT2与ZF9复合物样品的制备第55页
    3.3 SANT2与核酸(NRSE/RE1 dsDNA和dsRNA)复合物样品制备第55-56页
  4 二维1H-15N HSQC结果与分析第56-62页
    · 结果第56-61页
    · 分析与讨论第61-62页
  5 CD光谱研究Zn~(2+)对SANT2构象的影响第62-64页
    · 结果第62-63页
    · 分析与讨论第63-64页
  6 本章小结第64-65页
参考文献第65-72页
致谢第72-73页
附录第73-79页
  附录1第73-74页
  附录2第74-75页
  附录3第75-76页
  附录4第76-77页
  附录5第77-78页
  附录6第78-79页
  附录7第79 页

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