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一株手足口病病毒的基因组序列分析及肠道病毒71型引起的内质网应激反应初探

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一株手足口病病毒的基因组序列分析及肠道病毒71型引起的内质网应激反应初探
论文目录
 
中文摘要第1-6页
Abstract第6-7页
第一章 绪论第11-33页
    1.1 手足口病简介第11-15页
        1.1.1 手足口病的临床症状第11-12页
        1.1.2 手足口病的致病机制第12页
        1.1.3 手足口病的流行病学第12-13页
        1.1.4 手足口病的疫苗第13-15页
    1.2 肠道病毒71型简介第15-23页
        1.2.1 EV71的分类第15页
        1.2.2 EV71的基因组结构第15-17页
        1.2.3 EV71的理化性质第17页
        1.2.4 EV71的复制周期第17-19页
        1.2.5 EV71的流行病学第19-20页
        1.2.6 细胞对EV71的免疫应答第20-23页
    1.3 内质网应激第23-28页
        1.3.1 未折叠蛋白反应的途径第23-25页
        1.3.2 内质网应激与病毒感染的关系第25-28页
    1.4 生物信息学在病毒领域的应用第28-32页
    1.5 实验目的第32-33页
第二章 实验材料第33-39页
    2.1 实验材料与试剂第33-35页
    2.2 实验所用仪器设备第35页
    2.3 实验相关试剂的配置第35-39页
        2.3.1 分子实验相关试剂配制第36-37页
        2.3.2 细胞实验相关试剂配制第37页
        2.3.3 蛋白印迹实验相关试剂配制第37-39页
第三章 实验方法第39-53页
    3.1 常规分子克隆实验第39-42页
        3.1.1 PCR引物设计原则第39页
        3.1.2 利用PCR技术扩增目的片段第39-40页
        3.1.3 PCR产物的胶回收第40页
        3.1.4 目的产物和载体的双酶切第40页
        3.1.5 连接反应第40页
        3.1.6 转化第40-41页
        3.1.7 菌落PCR鉴定第41页
        3.1.8 重组质粒的提取以及酶切鉴定第41-42页
    3.2 细胞学实验第42-45页
        3.2.1 细胞的复苏第42页
        3.2.2 细胞的换液及传代培养第42-43页
        3.2.3 细胞冻存第43页
        3.2.4 转染实验第43-44页
        3.2.5 Western blot操作第44-45页
    3.3 病毒学实验第45-47页
        3.3.1 病毒扩增第45-46页
        3.3.2 病毒滴度的测定第46-47页
        3.3.3 病毒感染细胞第47页
    3.4 实时荧光定量PCR实验第47-50页
        3.4.1 RNA的提取第47-48页
        3.4.2 去除基因组的DNA反应第48页
        3.4.3 RNA琼脂糖凝胶电泳第48-49页
        3.4.4 RNA反转录成cDNA第49页
        3.4.5 Real Time PCR反应第49-50页
    3.5 生物信息学分析第50-53页
        3.5.1 序列来源第50-51页
        3.5.2 EV71系统进化树分析第51-52页
        3.5.3 EV71基因重组分析第52-53页
第四章 实验结果第53-76页
    4.1 一株重组病毒株的生物进化树及重组分析第53-62页
        4.1.1 病毒分离株的生物进化树分析第53-58页
        4.1.2 病毒分离株的重组分析第58-62页
        4.1.3 病毒分离株对不同细胞的感染性研究第62页
    4.2 EV71感染细胞对UPR通路的影响第62-67页
        4.2.1 EV71病毒感染细胞引起IRE1α的磷酸化第62-63页
        4.2.2 EV71病毒感染细胞不激活Spliced XBP1mRNA的切割第63-65页
        4.2.3 EV71感染细胞引起IRE1α的降解第65-66页
        4.2.4 EV71感染细胞引起PERK的磷酸化第66-67页
    4.3 IRE1α的激酶及核酸内切酶活性对病毒复制的影响第67-72页
        4.3.1 TCID50法第67-70页
        4.3.2 Western Blot和Q-PCR法第70-72页
    4.4 EV71病毒蛋白与IRE1α的磷酸化的初步探究第72-76页
        4.4.1 EV71十个蛋白的构建及表达第72-73页
        4.4.2 EV71病毒3D蛋白与IRE1α-XBP1通路的初步研究第73-76页
第五章 总结与展望第76-79页
参考文献第79-86页
硕士研究生期间科研成果第86-87页
致谢第87-88页

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