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TRIM家族基因调控区DNA酶I超敏感位点的正选择分析

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TRIM家族基因调控区DNA酶I超敏感位点的正选择分析
论文目录
 
摘要第1-7页
ABSTRACT第7-11页
英文缩略词表第11-12页
第一章 绪论第12-29页
  1.1 引言第12-13页
  1.2 TRIM多家族基因第13-23页
    1.2.1 TRIM基因家族组成及表达第13-14页
    1.2.2 TRIM基因家族的蛋白结构第14-16页
    1.2.3 TRIM基因家族的抗病毒功能第16-20页
    1.2.4 TRIM基因家族的进化第20-23页
  1.3 DNA酶Ⅰ超敏感位点第23-25页
    1.3.1 DNA酶Ⅰ超敏感位点的特性第23页
    1.3.2 DNA酶Ⅰ超敏感位点在国内外研究现状第23-25页
  1.4 DNA酶Ⅰ超敏感位点在进化选择中的作用第25页
  1.5 自然选择学说和中性学说第25-26页
  1.6 正向选择与纯化选择第26-27页
  1.7 转录因子结合位点第27页
  1.8 论文主要内容第27-29页
第二章 材料与方法第29-36页
  2.1 DHS数据来源第29页
  2.2 分析平台与工具第29-30页
    2.2.1 Unix操作系统第29页
    2.2.2 软件工具第29-30页
  2.3 分析方法第30-34页
    2.3.1 技术路线第30-31页
    2.3.2 灵长类动物全基因组DHS的预处理第31页
    2.3.3 TRIM家族基因坐标的查找与确定第31-32页
    2.3.4 TRIM家族调控区DHS的获得第32-33页
    2.3.5 TRIM家族调控区DHS的正向选择分析第33-34页
    2.3.6 TRIM家族调控区DHS的靶基因分析第34页
    2.3.7 TRIM家族调控区DHS中潜在转录因子结合位点分析第34页
  2.4 本章小结第34-36页
第三章 结果与分析第36-52页
  3.1 TRIM基因家族调控区DHS的鉴定第36-37页
  3.2 灵长类TRIM多基因家族调控区的正向选择第37-39页
  3.3 灵长类动物TRIM家族haDHS靶基因鉴定与功能分析第39-42页
  3.4 haDHS中潜在的转录因子结合位点分析第42-46页
  3.5 haDHS靶基因与人类特有的转录因子结合位点关联分析第46-48页
  3.6 本章小结第48-52页
结论与展望第52-53页
参考文献第53-61页
附录第61-80页
攻读硕士学位期间取得的研究成果第80-81页
致谢第81-82页
附件第82页

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