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TRIM家族基因调控区DNA酶I超敏感位点的正选择分析
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TRIM家族基因调控区DNA酶I超敏感位点的正选择分析
论文目录
摘要
第1-7页
ABSTRACT
第7-11页
英文缩略词表
第11-12页
第一章 绪论
第12-29页
1.1 引言
第12-13页
1.2 TRIM多家族基因
第13-23页
1.2.1 TRIM基因家族组成及表达
第13-14页
1.2.2 TRIM基因家族的蛋白结构
第14-16页
1.2.3 TRIM基因家族的抗病毒功能
第16-20页
1.2.4 TRIM基因家族的进化
第20-23页
1.3 DNA酶Ⅰ超敏感位点
第23-25页
1.3.1 DNA酶Ⅰ超敏感位点的特性
第23页
1.3.2 DNA酶Ⅰ超敏感位点在国内外研究现状
第23-25页
1.4 DNA酶Ⅰ超敏感位点在进化选择中的作用
第25页
1.5 自然选择学说和中性学说
第25-26页
1.6 正向选择与纯化选择
第26-27页
1.7 转录因子结合位点
第27页
1.8 论文主要内容
第27-29页
第二章 材料与方法
第29-36页
2.1 DHS数据来源
第29页
2.2 分析平台与工具
第29-30页
2.2.1 Unix操作系统
第29页
2.2.2 软件工具
第29-30页
2.3 分析方法
第30-34页
2.3.1 技术路线
第30-31页
2.3.2 灵长类动物全基因组DHS的预处理
第31页
2.3.3 TRIM家族基因坐标的查找与确定
第31-32页
2.3.4 TRIM家族调控区DHS的获得
第32-33页
2.3.5 TRIM家族调控区DHS的正向选择分析
第33-34页
2.3.6 TRIM家族调控区DHS的靶基因分析
第34页
2.3.7 TRIM家族调控区DHS中潜在转录因子结合位点分析
第34页
2.4 本章小结
第34-36页
第三章 结果与分析
第36-52页
3.1 TRIM基因家族调控区DHS的鉴定
第36-37页
3.2 灵长类TRIM多基因家族调控区的正向选择
第37-39页
3.3 灵长类动物TRIM家族haDHS靶基因鉴定与功能分析
第39-42页
3.4 haDHS中潜在的转录因子结合位点分析
第42-46页
3.5 haDHS靶基因与人类特有的转录因子结合位点关联分析
第46-48页
3.6 本章小结
第48-52页
结论与展望
第52-53页
参考文献
第53-61页
附录
第61-80页
攻读硕士学位期间取得的研究成果
第80-81页
致谢
第81-82页
附件
第82页
本篇论文共
82
页,
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